More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0132 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0132  diguanylate cyclase  100 
 
 
289 aa  545  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0508624  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0150  diguanylate cyclase  95.5 
 
 
289 aa  458  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0139  diguanylate cyclase  94.12 
 
 
289 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0136  diguanylate cyclase  64.58 
 
 
288 aa  292  4e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.041844  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0219  diguanylate cyclase  39.04 
 
 
303 aa  195  9e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2371  diguanylate cyclase  38.1 
 
 
294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.171648  normal  0.191081 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4141  diguanylate cyclase  42.55 
 
 
312 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274749 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5712  diguanylate cyclase  38.75 
 
 
316 aa  161  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.54195  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5913  diguanylate cyclase  36.93 
 
 
364 aa  150  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0458  diguanylate cyclase  41.44 
 
 
326 aa  149  8e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1695  diguanylate cyclase  43.95 
 
 
753 aa  148  8e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.560166  normal  0.428473 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0457  diguanylate cyclase  41.44 
 
 
326 aa  149  8e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0221  response regulator PleD  40.78 
 
 
460 aa  147  2.0000000000000003e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4293  GGDEF domain-containing protein  41.18 
 
 
334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0725016  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0429  diguanylate cyclase  40.96 
 
 
338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3391  diguanylate cyclase  49.39 
 
 
360 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.372073  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3477  diguanylate cyclase  50 
 
 
342 aa  142  5e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.377939  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1440  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  43.98 
 
 
315 aa  140  3e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0301186  normal  0.059237 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2525  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  48.26 
 
 
464 aa  140  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.21158 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1301  two component regulator propeller domain protein  46.77 
 
 
1008 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.503431  normal  0.30236 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4119  diguanylate cyclase  49.43 
 
 
382 aa  138  8.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.898336 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4551  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  47.62 
 
 
313 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.111866  normal  0.524526 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4714  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  52.12 
 
 
684 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2350  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  51.83 
 
 
1000 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.521127 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5509  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  47.62 
 
 
326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.872831  normal  0.058561 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0471  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.44 
 
 
572 aa  136  4e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.634401  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3631  GGDEF domain-containing protein  38.82 
 
 
722 aa  136  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.770761  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3170  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  47.65 
 
 
312 aa  135  8e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0256904  normal  0.861805 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0157  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  49.07 
 
 
917 aa  135  9e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5684  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  48.52 
 
 
313 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.656373  hitchhiker  0.00195148 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0719  diguanylate cyclase  49.71 
 
 
370 aa  134  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5175  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  48.52 
 
 
313 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0452  sensory box protein  39.43 
 
 
451 aa  134  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0530  response regulator receiver protein  41.86 
 
 
392 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.143294  normal  0.0713478 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6286  GGDEF domain-containing protein  47.8 
 
 
668 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1405  diguanylate cyclase  47.24 
 
 
464 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0050  putative diguanylate cyclase  44.03 
 
 
696 aa  133  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.315879  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0014  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  48.52 
 
 
312 aa  133  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.927772  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72420  GGDEF domain-containing protein  47.8 
 
 
671 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0411466  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0303  GGDEF family protein  49.68 
 
 
554 aa  133  3e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0304  diguanylate cyclase  44.19 
 
 
464 aa  133  3.9999999999999996e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2523  diguanylate cyclase  50.93 
 
 
587 aa  133  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0272  diguanylate cyclase  49.68 
 
 
554 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4956  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  47.37 
 
 
324 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0364888 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3024  diguanylate cyclase  45.78 
 
 
260 aa  132  5e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.104216  normal  0.207783 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2333  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  46.58 
 
 
578 aa  132  6e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2588  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  46.34 
 
 
710 aa  132  6e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0652312  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0088  PAS:GGDEF  35.17 
 
 
335 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.10869  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3430  diguanylate cyclase  40.11 
 
 
513 aa  132  7.999999999999999e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0680  diguanylate cyclase  41.57 
 
 
466 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3922  GGDEF domain-containing protein  35.06 
 
 
364 aa  131  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3066  GGDEF domain-containing protein  43.9 
 
 
466 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1418  diguanylate cyclase  43.9 
 
 
466 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1551  GGDEF domain-containing protein  43.9 
 
 
466 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4084  diguanylate cyclase  45.34 
 
 
308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1222  GGDEF domain-containing protein  43.9 
 
 
466 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1449  diguanylate cyclase  43.9 
 
 
466 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0645  GGDEF domain-containing protein  43.9 
 
 
454 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0508  GGDEF domain-containing protein  43.9 
 
 
454 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0304  sensory box/GGDEF domain protein  42.33 
 
 
332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2954  diguanylate cyclase  46.15 
 
 
612 aa  131  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0512853  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0304  response regulator PleD  35.59 
 
 
458 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0864091  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0190  diguanylate cyclase  43.56 
 
 
329 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1306  diguanylate cyclase  43.48 
 
 
615 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.550913  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1154  sensory box protein  36.11 
 
 
340 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4457  GGDEF domain-containing protein  32.54 
 
 
485 aa  130  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1346  sensory box/GGDEF domain protein  39.62 
 
 
425 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1808  diguanylate cyclase  38.38 
 
 
247 aa  130  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.148862  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2943  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.62 
 
 
438 aa  130  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.641955  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0309  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  49.39 
 
 
827 aa  130  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0510078  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2045  diguanylate cyclase  47.93 
 
 
243 aa  130  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2505  GAF domain/GGDEF domain-containing protein  47.2 
 
 
345 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.430442  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0198  diguanylate cyclase  34.45 
 
 
312 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0144  diguanylate cyclase  46.54 
 
 
642 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2218  GGDEF  46.5 
 
 
448 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1433  diguanylate cyclase  47.5 
 
 
387 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.58748  normal  0.153521 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3704  diguanylate cyclase  41.01 
 
 
460 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3800  diguanylate cyclase  39.8 
 
 
553 aa  129  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1895  diguanylate cyclase  38.36 
 
 
555 aa  129  6e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2824  GGDEF domain-containing protein  43.9 
 
 
628 aa  129  6e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0249  hypothetical protein  46.39 
 
 
275 aa  129  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.664064  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02110  GGDEF domain-containing protein  46.39 
 
 
235 aa  129  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.594222 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0058  diguanylate cyclase  45.56 
 
 
565 aa  129  7.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.714624  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0699  diguanylate cyclase  45.09 
 
 
226 aa  129  7.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.642785 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6727  diguanylate cyclase  42.31 
 
 
467 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3374  diguanylate cyclase  47.56 
 
 
492 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3217  diguanylate cyclase  45.96 
 
 
345 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.201545  normal  0.0694192 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3059  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  42.16 
 
 
921 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.227976  normal  0.0140856 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1316  diguanylate cyclase  47.24 
 
 
1004 aa  128  9.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.730261  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1842  diguanylate cyclase  45.96 
 
 
308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.721538  normal  0.677546 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3816  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  44.79 
 
 
797 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.250791  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0269  diguanylate cyclase  32.14 
 
 
485 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.853723  hitchhiker  0.00000177476 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3381  diguanylate cyclase  44.65 
 
 
622 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0178  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.2 
 
 
322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.895619 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0223  diguanylate cyclase  42.77 
 
 
357 aa  128  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.133267  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2363  GGDEF domain-containing protein  42.51 
 
 
311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.282615  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3939  response regulator receiver domain-containing protein  39.77 
 
 
588 aa  128  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.238688  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3137  response regulator receiver protein  39.02 
 
 
319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1598  diguanylate cyclase  44.58 
 
 
257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2276  diguanylate cyclase  44.58 
 
 
257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40422  normal  0.360858 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>