More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3099 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_0470  F0F1 ATP synthase subunit alpha  70.08 
 
 
519 aa  722    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309325  normal  0.152842 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0895  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.47 
 
 
508 aa  684    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.19048 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3099  F0F1 ATP synthase subunit alpha  100 
 
 
571 aa  1152    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00665351  normal  0.271166 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2996  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.02 
 
 
522 aa  650    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1070  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.4 
 
 
511 aa  676    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2329  F0F1 ATP synthase subunit alpha  73.44 
 
 
520 aa  775    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1654  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.73 
 
 
511 aa  725    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1961  F0F1 ATP synthase subunit alpha  71.68 
 
 
510 aa  759    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.938875  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0945  alternate F1F0 ATPase, F1 subunit alpha  70.12 
 
 
585 aa  796    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.670591  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1168  F0F1 ATP synthase subunit alpha  76.33 
 
 
534 aa  819    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.295877  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2675  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64 
 
 
528 aa  681    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3056  F0F1 ATP synthase subunit alpha  71.4 
 
 
517 aa  750    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17820  ATP synthase F1, alpha subunit  50.18 
 
 
541 aa  528  1e-148  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0065  ATP synthase F1, alpha subunit  52.31 
 
 
508 aa  524  1e-147  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2846  ATP synthase F1, alpha subunit  53.03 
 
 
508 aa  523  1e-147  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.525611 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0747  ATP synthase F1, alpha subunit  51.88 
 
 
504 aa  519  1e-146  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.873736  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0081  ATP synthase F1, alpha subunit  53.32 
 
 
507 aa  520  1e-146  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2380  ATP synthase F1, alpha subunit  53.29 
 
 
507 aa  519  1e-146  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0176105 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0327  F0F1 ATP synthase subunit alpha  54.64 
 
 
507 aa  514  1e-144  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.98 
 
 
503 aa  511  1e-143  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.244084  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1519  ATP synthase F1, alpha subunit  53.19 
 
 
512 aa  509  1e-143  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.283334  hitchhiker  0.000000000000106657 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0536  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.25 
 
 
503 aa  509  1e-143  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.19649  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1275  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.98 
 
 
503 aa  511  1e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.588856  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_501  ATP synthase F1, alpha subunit  51.43 
 
 
503 aa  506  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0562093  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3738  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.46 
 
 
502 aa  507  9.999999999999999e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0562  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.64 
 
 
503 aa  502  1e-141  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.529195  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2139  ATP synthase F1, alpha subunit  53.12 
 
 
507 aa  503  1e-141  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4334  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.94 
 
 
512 aa  504  1e-141  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00117083  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1711  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.28 
 
 
503 aa  500  1e-140  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.3 
 
 
502 aa  501  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1426  ATP synthase F1, alpha subunit  51.96 
 
 
507 aa  501  1e-140  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2141  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.3 
 
 
502 aa  501  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.588965  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0519  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.51 
 
 
501 aa  500  1e-140  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3152  ATP synthase F1, alpha subunit  51.87 
 
 
501 aa  497  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3827  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.16 
 
 
502 aa  496  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0336  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.84 
 
 
505 aa  496  1e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.120732  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3383  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.65 
 
 
503 aa  498  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0111242  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4167  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.85 
 
 
501 aa  497  1e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.804654  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1492  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.36 
 
 
505 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0642798  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2720  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.65 
 
 
503 aa  498  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0292  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.33 
 
 
507 aa  496  1e-139  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1797  ATP synthase F1, alpha subunit  51.73 
 
 
504 aa  495  1e-139  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5429  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.32 
 
 
502 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.099904  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1014  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.4 
 
 
502 aa  493  9.999999999999999e-139  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000116673  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0174  ATP synthase F1, alpha subunit  49 
 
 
503 aa  493  9.999999999999999e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.168157  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0685  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.59 
 
 
505 aa  492  9.999999999999999e-139  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.17328  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3864  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.44 
 
 
548 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.283904  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3952  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.44 
 
 
548 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0936185  hitchhiker  0.00501194 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3417  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.42 
 
 
502 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3878  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.44 
 
 
548 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3305  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.17 
 
 
502 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.694138  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4793  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.32 
 
 
502 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5432  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.11 
 
 
502 aa  490  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5157  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.11 
 
 
502 aa  490  1e-137  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4990  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.11 
 
 
502 aa  490  1e-137  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5007  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.11 
 
 
502 aa  490  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5522  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.11 
 
 
502 aa  489  1e-137  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000300598  hitchhiker  0.0000000000000322299 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0201  ATP synthase F1, alpha subunit  50.1 
 
 
501 aa  491  1e-137  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.406681  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0465  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.84 
 
 
509 aa  491  1e-137  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.809021  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5549  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.11 
 
 
502 aa  490  1e-137  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.31478  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4261  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.86 
 
 
502 aa  489  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00501837  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5485  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.11 
 
 
502 aa  490  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.184326  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5105  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.32 
 
 
502 aa  491  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5398  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.11 
 
 
502 aa  490  1e-137  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2629899999999999e-45 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2384  Sodium-transporting two-sector ATPase  50.97 
 
 
504 aa  489  1e-137  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1240  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.76 
 
 
506 aa  490  1e-137  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0861  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.1 
 
 
501 aa  485  1e-136  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0205389  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2611  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.85 
 
 
506 aa  488  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.169882  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2619  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.62 
 
 
503 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0308  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.21 
 
 
513 aa  486  1e-136  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0176346  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0898  ATP synthase F1 subunit alpha  50.2 
 
 
549 aa  486  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.707906 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1978  ATP synthase F1, alpha subunit  53.02 
 
 
499 aa  487  1e-136  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2199  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.27 
 
 
505 aa  488  1e-136  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.539772 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1871  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.29 
 
 
505 aa  486  1e-136  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.798226  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4070  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.59 
 
 
517 aa  482  1e-135  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0283869  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2146  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.52 
 
 
515 aa  484  1e-135  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0178  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.52 
 
 
515 aa  484  1e-135  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3338  ATP synthase F1 subunit alpha  52.95 
 
 
506 aa  483  1e-135  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1736  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.49 
 
 
505 aa  484  1e-135  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0082  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.47 
 
 
525 aa  484  1e-135  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0915  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.09 
 
 
505 aa  485  1e-135  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0383852  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1527  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.48 
 
 
505 aa  483  1e-135  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000683533  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16411  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.67 
 
 
505 aa  482  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11335  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.79 
 
 
549 aa  485  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0663  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.37 
 
 
520 aa  482  1e-135  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0131395  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2584  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.42 
 
 
505 aa  484  1e-135  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.341955  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0193  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.69 
 
 
501 aa  479  1e-134  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0287666  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl113  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.04 
 
 
525 aa  479  1e-134  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6523  ATP synthase F1, alpha subunit  52.29 
 
 
524 aa  481  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1027  ATP synthase F1, alpha subunit  51.08 
 
 
501 aa  481  1e-134  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0947  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.43 
 
 
502 aa  481  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3133  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.43 
 
 
502 aa  481  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.16 
 
 
505 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16531  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.46 
 
 
505 aa  481  1e-134  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.592214  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0513  ATP synthase F1, alpha subunit  49.07 
 
 
501 aa  480  1e-134  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1935  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.44 
 
 
500 aa  479  1e-134  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0111  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.75 
 
 
503 aa  476  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1267  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.83 
 
 
526 aa  478  1e-133  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.793474  normal  0.559767 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4037  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.92 
 
 
502 aa  476  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00278502 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15701  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.78 
 
 
504 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.110948  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>