More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3878 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4014  F0F1 ATP synthase subunit alpha  72.02 
 
 		 550 aa  767    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000699734 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1314  ATP synthase F1 subunit alpha  66.54 
 
 		 545 aa  727    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.438487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18220  F0F1 ATP synthase subunit alpha  70.77 
 
 		 549 aa  793    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.850315  normal  0.256257 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3918  ATP synthase F1, alpha subunit  72.22 
 
 		 546 aa  814    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19150  F0F1 ATP synthase subunit alpha  67.9 
 
 		 541 aa  763    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2124  F0F1 ATP synthase subunit alpha  73.49 
 
 		 547 aa  826    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00337947  hitchhiker  0.00781719 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2409  F0F1 ATP synthase subunit alpha  69.65 
 
 		 547 aa  790    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1125  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.48 
 
 		 543 aa  715    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.826073  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1268  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.38 
 
 		 552 aa  763    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2316  F0F1 ATP synthase subunit alpha  86.86 
 
 		 548 aa  983    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6138  F0F1 ATP synthase subunit alpha  74.64 
 
 		 548 aa  849    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1216  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.69 
 
 		 544 aa  780    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29570  F0F1 ATP synthase subunit alpha  73.72 
 
 		 548 aa  857    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1253  ATP synthase F1, alpha subunit  70.11 
 
 		 544 aa  793    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0274043  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1305  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.91 
 
 		 544 aa  739    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.206364  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1070  ATP synthase F1, alpha subunit  68.01 
 
 		 542 aa  758    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4138  ATP synthase F1, alpha subunit  70.09 
 
 		 545 aa  795    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.413993  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3709  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.25 
 
 		 552 aa  753    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11335  F0F1 ATP synthase subunit alpha  86.01 
 
 		 549 aa  961    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3864  F0F1 ATP synthase subunit alpha  100 
 
 		 548 aa  1115    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.283904  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0334  ATP synthase F1, alpha subunit  68.32 
 
 		 546 aa  763    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.297297 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08160  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.44 
 
 		 555 aa  739    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3878  F0F1 ATP synthase subunit alpha  100 
 
 		 548 aa  1115    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10010  ATP synthase F1 subcomplex alpha subunit  68.56 
 
 		 543 aa  761    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.564506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2450  ATP synthase F1, alpha subunit  67.77 
 
 		 543 aa  751    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3632  F0F1 ATP synthase subunit alpha  71.23 
 
 		 550 aa  761    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.145338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1669  H(+)-transporting two-sector ATPase  69.76 
 
 		 549 aa  792    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1022  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.92 
 
 		 553 aa  760    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0898  ATP synthase F1 subunit alpha  72.13 
 
 		 549 aa  819    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.707906 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2607  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.16 
 
 		 545 aa  731    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197618  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1776  F0F1 ATP synthase subunit alpha  69.53 
 
 		 543 aa  739    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.984214 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0651  F0F1 ATP synthase subunit alpha  70.13 
 
 		 554 aa  783    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.310941  normal  0.421508 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2340  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.87 
 
 		 545 aa  738    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125145 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1919  ATP synthase F1, alpha subunit  69 
 
 		 542 aa  790    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.086846  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0146  ATP synthase F1, alpha subunit  66.24 
 
 		 553 aa  737    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.445327 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1761  F0F1 ATP synthase subunit alpha  67.89 
 
 		 547 aa  766    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.743322  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3952  F0F1 ATP synthase subunit alpha  100 
 
 		 548 aa  1115    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0936185  hitchhiker  0.00501194 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4330  F0F1 ATP synthase subunit alpha  85.95 
 
 		 548 aa  955    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.930948  normal  0.0279627 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2186  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.25 
 
 		 502 aa  631  1e-179  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17820  ATP synthase F1, alpha subunit  58.94 
 
 		 541 aa  626  1e-178  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2214  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.06 
 
 		 504 aa  627  1e-178  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.188551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2193  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.76 
 
 		 502 aa  625  1e-178  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4793  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.46 
 
 		 502 aa  621  1e-177  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0987  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.68 
 
 		 502 aa  619  1e-176  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975811  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2829  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.35 
 
 		 502 aa  619  1e-176  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1797  ATP synthase F1, alpha subunit  60.63 
 
 		 504 aa  616  1e-175  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0685  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.71 
 
 		 505 aa  612  9.999999999999999e-175  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.17328  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3738  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.28 
 
 		 502 aa  613  9.999999999999999e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1463  ATP synthase F1, alpha subunit  57.87 
 
 		 509 aa  613  9.999999999999999e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.298107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1527  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.28 
 
 		 505 aa  612  9.999999999999999e-175  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000683533  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1679  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.37 
 
 		 510 aa  609  1e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.536422  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0201  ATP synthase F1, alpha subunit  57.76 
 
 		 501 aa  608  1e-173  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.406681  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16411  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.56 
 
 		 505 aa  610  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16531  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.56 
 
 		 505 aa  610  1e-173  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.592214  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2846  ATP synthase F1, alpha subunit  56.78 
 
 		 508 aa  608  9.999999999999999e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.525611 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0065  ATP synthase F1, alpha subunit  58.07 
 
 		 508 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3152  ATP synthase F1, alpha subunit  58.66 
 
 		 501 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.36 
 
 		 505 aa  605  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2380  ATP synthase F1, alpha subunit  57.56 
 
 		 507 aa  605  9.999999999999999e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0176105 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2286  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.69 
 
 		 509 aa  606  9.999999999999999e-173  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16301  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.56 
 
 		 505 aa  608  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3216  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.09 
 
 		 509 aa  605  9.999999999999999e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.458172  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1736  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.71 
 
 		 505 aa  605  9.999999999999999e-173  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3364  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.76 
 
 		 502 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.677346  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0513  ATP synthase F1, alpha subunit  57.71 
 
 		 501 aa  604  1.0000000000000001e-171  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1711  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.53 
 
 		 503 aa  602  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0915  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.71 
 
 		 505 aa  603  1.0000000000000001e-171  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0383852  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1519  ATP synthase F1, alpha subunit  55.58 
 
 		 512 aa  602  1.0000000000000001e-171  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.283334  hitchhiker  0.000000000000106657 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3417  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.87 
 
 		 502 aa  604  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.87 
 
 		 502 aa  599  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.58 
 
 		 503 aa  600  1e-170  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.244084  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1275  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.58 
 
 		 503 aa  600  1e-170  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.588856  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3305  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.89 
 
 		 502 aa  600  1e-170  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.694138  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0621  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.69 
 
 		 509 aa  600  1e-170  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.953551 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2141  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.87 
 
 		 502 aa  599  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.588965  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2804  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.19 
 
 		 510 aa  600  1e-170  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.370852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4740  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.19 
 
 		 510 aa  600  1e-170  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.408023  hitchhiker  0.00635659 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2078  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.89 
 
 		 509 aa  596  1e-169  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.368934 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0111  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.97 
 
 		 503 aa  595  1e-169  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1224  ATP synthase F1, alpha subunit  57.37 
 
 		 510 aa  597  1e-169  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4261  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.5 
 
 		 502 aa  595  1e-169  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00501837  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2619  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.5 
 
 		 503 aa  596  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2400  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.1 
 
 		 509 aa  595  1e-169  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4167  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.69 
 
 		 501 aa  597  1e-169  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.804654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12070  ATP synthase F1 subcomplex alpha subunit  55.94 
 
 		 524 aa  596  1e-169  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3172  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.5 
 
 		 502 aa  595  1e-169  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0844597  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1871  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.07 
 
 		 505 aa  598  1e-169  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.798226  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1492  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.68 
 
 		 505 aa  598  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0642798  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5432  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.69 
 
 		 502 aa  591  1e-168  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0100  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.62 
 
 		 501 aa  594  1e-168  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5157  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.69 
 
 		 502 aa  591  1e-168  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1468  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.51 
 
 		 509 aa  593  1e-168  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.184879 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3827  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.89 
 
 		 502 aa  593  1e-168  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1014  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.5 
 
 		 502 aa  592  1e-168  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000116673  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5398  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.69 
 
 		 502 aa  591  1e-168  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2629899999999999e-45 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5429  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.89 
 
 		 502 aa  593  1e-168  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.099904  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0336  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.51 
 
 		 505 aa  591  1e-168  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.120732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1746  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.51 
 
 		 509 aa  593  1e-168  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal  0.129066 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0519  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.43 
 
 		 501 aa  593  1e-168  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2584  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.75 
 
 		 505 aa  594  1e-168  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.341955  normal  0.818927 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>