More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3152 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A1589  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.13 
 
 
513 aa  637    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.10033  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2432  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.76 
 
 
513 aa  647    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.183567  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16301  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.6 
 
 
505 aa  654    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0562  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.73 
 
 
503 aa  671    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.529195  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0111  F0F1 ATP synthase subunit alpha  69.06 
 
 
503 aa  703    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3357  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.13 
 
 
513 aa  637    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1711  F0F1 ATP synthase subunit alpha  67.2 
 
 
503 aa  694    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0010  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.74 
 
 
513 aa  635    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.768352  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3319  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.72 
 
 
513 aa  637    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.162911  decreased coverage  0.00532822 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5432  F0F1 ATP synthase subunit alpha  70 
 
 
502 aa  725    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0100  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.19 
 
 
501 aa  663    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0861  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.59 
 
 
501 aa  670    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0205389  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1801  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.24 
 
 
509 aa  659    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.47 
 
 
503 aa  668    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.244084  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0195  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.28 
 
 
517 aa  641    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5157  F0F1 ATP synthase subunit alpha  70 
 
 
502 aa  725    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4990  F0F1 ATP synthase subunit alpha  70 
 
 
502 aa  725    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5007  F0F1 ATP synthase subunit alpha  70 
 
 
502 aa  725    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2955  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.13 
 
 
513 aa  637    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.103528  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3055  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.81 
 
 
517 aa  638    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2912  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.01 
 
 
517 aa  639    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2193  F0F1 ATP synthase subunit alpha  67 
 
 
502 aa  703    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4112  ATP synthase F1, alpha subunit  61.45 
 
 
512 aa  649    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000122055  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2606  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.87 
 
 
506 aa  682    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0981  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.8 
 
 
504 aa  652    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3338  ATP synthase F1 subunit alpha  63.8 
 
 
506 aa  660    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2799  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.12 
 
 
513 aa  649    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0430  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.75 
 
 
510 aa  647    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2611  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.8 
 
 
506 aa  655    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.169882  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0181  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.33 
 
 
513 aa  638    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3076  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.53 
 
 
515 aa  645    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0140  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.19 
 
 
501 aa  663    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.241383  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4044  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.33 
 
 
513 aa  638    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0947  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.8 
 
 
502 aa  694    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3133  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.8 
 
 
502 aa  694    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3286  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.91 
 
 
513 aa  642    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1985  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.6 
 
 
526 aa  679    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.25217  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0488  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63 
 
 
506 aa  638    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.294002  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0140  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.64 
 
 
526 aa  671    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2188  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.2 
 
 
506 aa  642    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.929468 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3408  F0F1 ATP synthase subunit alpha  69.06 
 
 
503 aa  704    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.14914  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0987  F0F1 ATP synthase subunit alpha  69 
 
 
502 aa  722    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975811  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5549  F0F1 ATP synthase subunit alpha  70 
 
 
502 aa  725    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.31478  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1405  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.65 
 
 
505 aa  643    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0699258  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.8 
 
 
505 aa  654    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0336  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63 
 
 
505 aa  661    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.120732  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0308  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.94 
 
 
513 aa  664    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0176346  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0514  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.62 
 
 
527 aa  642    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.709885  normal  0.673527 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2380  ATP synthase F1, alpha subunit  73.45 
 
 
507 aa  766    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0176105 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3310  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.52 
 
 
513 aa  638    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145544  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4350  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.24 
 
 
510 aa  649    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0267  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.33 
 
 
510 aa  654    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.686525 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2400  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.64 
 
 
509 aa  657    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  67.66 
 
 
502 aa  696    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0292  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.27 
 
 
507 aa  667    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0406  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.67 
 
 
509 aa  647    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.102948 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0176  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.75 
 
 
510 aa  653    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2746  ATP synthase F1, alpha subunit  61.33 
 
 
513 aa  639    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.426504  normal  0.209432 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16531  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.4 
 
 
505 aa  654    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.592214  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0038  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.91 
 
 
513 aa  639    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.266333  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3970  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.33 
 
 
513 aa  638    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0557  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.33 
 
 
510 aa  655    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.114224 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16411  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.6 
 
 
505 aa  655    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0532  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.08 
 
 
510 aa  649    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3496  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.11 
 
 
513 aa  650    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.225453  normal  0.438236 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4334  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.13 
 
 
512 aa  679    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00117083  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1734  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.44 
 
 
509 aa  659    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2286  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.65 
 
 
509 aa  652    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2951  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.91 
 
 
513 aa  639    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130685  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18491  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63 
 
 
504 aa  652    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.983268 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1640  ATP synthase F1, alpha subunit  64.74 
 
 
526 aa  664    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04831  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62 
 
 
505 aa  637    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3216  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.05 
 
 
509 aa  654    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.458172  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0183  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.82 
 
 
526 aa  635    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.617939  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2454  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.8 
 
 
502 aa  719    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2164  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.8 
 
 
502 aa  719    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3152  ATP synthase F1, alpha subunit  100 
 
 
501 aa  1010    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2199  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.8 
 
 
505 aa  652    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.539772 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0465  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.8 
 
 
509 aa  681    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.809021  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0536  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.33 
 
 
503 aa  672    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.19649  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0621  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.82 
 
 
509 aa  670    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.953551 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2141  F0F1 ATP synthase subunit alpha  67.66 
 
 
502 aa  696    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.588965  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2384  Sodium-transporting two-sector ATPase  71.97 
 
 
504 aa  756    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2804  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.55 
 
 
510 aa  641    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.370852  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0095  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.91 
 
 
513 aa  640    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.88314  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1935  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.73 
 
 
500 aa  659    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0663  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.62 
 
 
520 aa  647    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0131395  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1240  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.07 
 
 
506 aa  672    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1871  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.47 
 
 
505 aa  670    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.798226  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0519  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66 
 
 
501 aa  675    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0104  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.91 
 
 
513 aa  639    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.679281  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2584  F0F1 ATP synthase subunit alpha  67.4 
 
 
505 aa  689    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.341955  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3460  ATP synthase F1, alpha subunit  64.55 
 
 
507 aa  648    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.823714  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4261  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.4 
 
 
502 aa  707    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00501837  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3013  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.13 
 
 
513 aa  637    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1527  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.67 
 
 
505 aa  650    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000683533  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0604  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.26 
 
 
502 aa  701    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1505  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.26 
 
 
502 aa  701    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.56305  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.44 
 
 
526 aa  677    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1679  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.51 
 
 
510 aa  670    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.536422  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>