More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0183 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_0065  ATP synthase F1 subunit alpha  72.33 
 
 		 532 aa  789    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0262  F0F1 ATP synthase subunit alpha  67.56 
 
 		 526 aa  714    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0489814 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6523  ATP synthase F1, alpha subunit  79.96 
 
 		 524 aa  866    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0621  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.71 
 
 		 509 aa  642    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.953551 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1467  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.23 
 
 		 509 aa  636    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1059  F0F1 ATP synthase subunit alpha  74.1 
 
 		 525 aa  806    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1233  ATP synthase F1, alpha subunit  70.86 
 
 		 525 aa  775    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1985  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.26 
 
 		 526 aa  714    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.25217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0140  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.32 
 
 		 526 aa  717    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4632  ATP synthase F1, alpha subunit  79.01 
 
 		 525 aa  861    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0663006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0297  F0F1 ATP synthase subunit alpha  67.37 
 
 		 526 aa  715    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.204325 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2380  ATP synthase F1, alpha subunit  63.18 
 
 		 507 aa  646    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0176105 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3152  ATP synthase F1, alpha subunit  62.82 
 
 		 501 aa  635    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2400  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.45 
 
 		 509 aa  637    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1712  F0F1 ATP synthase subunit alpha  73.76 
 
 		 526 aa  803    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000192165  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2332  F0F1 ATP synthase subunit alpha  67.75 
 
 		 526 aa  709    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2705  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.52 
 
 		 526 aa  715    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1620  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.86 
 
 		 504 aa  650    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0802007  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0183  F0F1 ATP synthase subunit alpha  100 
 
 		 526 aa  1060    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.617939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0315  ATP synthase F1, alpha subunit  68.46 
 
 		 534 aa  728    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4793  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.19 
 
 		 502 aa  636    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0396  F0F1 ATP synthase subunit alpha  79.2 
 
 		 524 aa  860    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  67.94 
 
 		 526 aa  719    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03060  ATP synthase subunit A  73.85 
 
 		 524 aa  796    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0341  ATP synthase F1, alpha subunit  59.85 
 
 		 509 aa  632  1e-180  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00762672 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4261  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.1 
 
 		 502 aa  632  1e-180  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00501837  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2078  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.8 
 
 		 509 aa  633  1e-180  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.368934 
 
 
-
 
NC_004310  BR1801  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.66 
 
 		 509 aa  629  1e-179  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1468  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.85 
 
 		 509 aa  631  1e-179  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.184879 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1103  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.09 
 
 		 509 aa  629  1e-179  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0430  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.92 
 
 		 510 aa  630  1e-179  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1746  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.85 
 
 		 509 aa  631  1e-179  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal  0.129066 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7382  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.96 
 
 		 509 aa  629  1e-179  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187104  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2804  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.96 
 
 		 510 aa  629  1e-179  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.370852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1734  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.66 
 
 		 509 aa  629  1e-179  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0605  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.95 
 
 		 510 aa  630  1e-179  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.404784  normal  0.651766 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6637  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.11 
 
 		 509 aa  630  1e-179  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0712183 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1463  ATP synthase F1, alpha subunit  60.84 
 
 		 509 aa  627  1e-178  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.298107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0267  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.55 
 
 		 510 aa  625  1e-178  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.686525 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0176  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.34 
 
 		 510 aa  625  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0173  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.55 
 
 		 510 aa  627  1e-178  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2286  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.87 
 
 		 509 aa  626  1e-178  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0406  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.63 
 
 		 509 aa  627  1e-178  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.102948 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0220  ATP synthase F1, alpha subunit  61.07 
 
 		 509 aa  624  1e-177  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0557  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.55 
 
 		 510 aa  624  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.114224 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4334  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.05 
 
 		 512 aa  623  1e-177  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00117083  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1014  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.48 
 
 		 502 aa  623  1e-177  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000116673  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2384  Sodium-transporting two-sector ATPase  59.32 
 
 		 504 aa  622  1e-177  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4740  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.79 
 
 		 510 aa  621  1e-177  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.408023  hitchhiker  0.00635659 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3460  ATP synthase F1, alpha subunit  60.93 
 
 		 507 aa  624  1e-177  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.823714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0604  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.31 
 
 		 502 aa  623  1e-177  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1505  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.31 
 
 		 502 aa  623  1e-177  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.56305  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0532  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.55 
 
 		 510 aa  621  1e-176  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0112  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.3 
 
 		 511 aa  619  1e-176  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17820  ATP synthase F1, alpha subunit  59.13 
 
 		 541 aa  620  1e-176  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0111  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.43 
 
 		 503 aa  617  1e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2186  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.23 
 
 		 502 aa  615  1e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3408  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.24 
 
 		 503 aa  615  1e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.14914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0336  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.88 
 
 		 505 aa  615  1e-175  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.120732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4350  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.39 
 
 		 510 aa  615  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3654  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.71 
 
 		 509 aa  614  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3216  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.71 
 
 		 509 aa  615  1e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.458172  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0081  ATP synthase F1, alpha subunit  58.96 
 
 		 507 aa  615  1e-175  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4108  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.01 
 
 		 508 aa  616  1e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0140  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.82 
 
 		 501 aa  613  9.999999999999999e-175  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.241383  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2924  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.14 
 
 		 509 aa  612  9.999999999999999e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.363319  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0100  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.82 
 
 		 501 aa  614  9.999999999999999e-175  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1679  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.76 
 
 		 510 aa  614  9.999999999999999e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.536422  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3943  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.08 
 
 		 509 aa  614  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0947  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.11 
 
 		 502 aa  614  9.999999999999999e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3133  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.11 
 
 		 502 aa  614  9.999999999999999e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4505  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.82 
 
 		 510 aa  612  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0987  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.57 
 
 		 502 aa  611  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975811  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3952  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.72 
 
 		 502 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.116029  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1224  ATP synthase F1, alpha subunit  59.96 
 
 		 510 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4037  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.72 
 
 		 502 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00278502 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01523  ATP synthase alpha chain, mitochondrial precursor (Broad)  58.83 
 
 		 556 aa  609  1e-173  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0112  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.25 
 
 		 501 aa  610  1e-173  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0295232  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4486  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.63 
 
 		 510 aa  609  1e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1275  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.48 
 
 		 503 aa  608  1e-173  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.588856  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2829  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.96 
 
 		 502 aa  609  1e-173  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3172  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60 
 
 		 502 aa  610  1e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0844597  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.48 
 
 		 503 aa  608  1e-173  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.244084  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1426  ATP synthase F1, alpha subunit  59.2 
 
 		 507 aa  610  1e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2759  ATP synthase F1, alpha subunit  59.22 
 
 		 502 aa  608  1e-173  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4497  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.24 
 
 		 512 aa  610  1e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.694909  normal  0.0411828 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4167  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.38 
 
 		 501 aa  610  1e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.804654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2720  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.96 
 
 		 503 aa  607  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2846  ATP synthase F1, alpha subunit  58.14 
 
 		 508 aa  607  9.999999999999999e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.525611 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3383  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.96 
 
 		 503 aa  607  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0111242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3305  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.44 
 
 		 502 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.694138  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16411  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.54 
 
 		 505 aa  605  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16531  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.54 
 
 		 505 aa  605  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.592214  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2619  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.27 
 
 		 503 aa  606  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2193  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.44 
 
 		 502 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2584  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.78 
 
 		 505 aa  606  9.999999999999999e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.341955  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0201  ATP synthase F1, alpha subunit  60.04 
 
 		 501 aa  607  9.999999999999999e-173  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.406681  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0513  ATP synthase F1, alpha subunit  57.55 
 
 		 501 aa  606  9.999999999999999e-173  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2297  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.06 
 
 		 512 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0601  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.82 
 
 		 505 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00209636  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>