More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0297 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B5522  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.87 
 
 
502 aa  648    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000300598  hitchhiker  0.0000000000000322299 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1746  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.88 
 
 
509 aa  644    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal  0.129066 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3172  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.82 
 
 
502 aa  662    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0844597  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0111  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.83 
 
 
503 aa  679    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1711  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.58 
 
 
503 aa  637    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0406  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.69 
 
 
509 aa  646    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.102948 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3827  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.07 
 
 
502 aa  651    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5432  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.07 
 
 
502 aa  649    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1426  ATP synthase F1, alpha subunit  60.65 
 
 
507 aa  647    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2078  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.31 
 
 
509 aa  637    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.368934 
 
 
-
 
NC_004310  BR1801  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.35 
 
 
509 aa  635    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16301  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.38 
 
 
505 aa  637    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5157  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.07 
 
 
502 aa  649    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4990  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.07 
 
 
502 aa  649    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0396  F0F1 ATP synthase subunit alpha  69.54 
 
 
524 aa  738    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5007  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.07 
 
 
502 aa  649    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0621  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.69 
 
 
509 aa  656    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.953551 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4108  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.46 
 
 
508 aa  635    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1620  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.76 
 
 
504 aa  651    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0802007  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3943  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.16 
 
 
509 aa  635    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1059  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.2 
 
 
525 aa  697    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0292  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.54 
 
 
507 aa  650    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2332  F0F1 ATP synthase subunit alpha  85.17 
 
 
526 aa  931    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3952  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.4 
 
 
502 aa  658    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.116029  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4261  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.98 
 
 
502 aa  674    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00501837  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1712  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.03 
 
 
526 aa  706    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000192165  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0262  F0F1 ATP synthase subunit alpha  88.21 
 
 
526 aa  954    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0489814 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0430  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.62 
 
 
510 aa  639    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0173  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.19 
 
 
510 aa  640    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3305  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.48 
 
 
502 aa  665    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.694138  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1679  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60 
 
 
510 aa  644    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.536422  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6637  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.31 
 
 
509 aa  642    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0712183 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0947  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.98 
 
 
502 aa  685    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3133  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.98 
 
 
502 aa  685    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1734  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.35 
 
 
509 aa  635    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1985  F0F1 ATP synthase subunit alpha  84.6 
 
 
526 aa  921    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.25217  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5485  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.07 
 
 
502 aa  649    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.184326  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0140  F0F1 ATP synthase subunit alpha  85.17 
 
 
526 aa  929    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2846  ATP synthase F1, alpha subunit  61.15 
 
 
508 aa  667    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.525611 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3408  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.83 
 
 
503 aa  676    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.14914  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0987  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.82 
 
 
502 aa  671    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975811  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5549  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.07 
 
 
502 aa  649    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.31478  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4632  ATP synthase F1, alpha subunit  67.18 
 
 
525 aa  712    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0663006  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.38 
 
 
505 aa  637    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1233  ATP synthase F1, alpha subunit  67.62 
 
 
525 aa  714    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4486  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.14 
 
 
510 aa  660    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5398  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.07 
 
 
502 aa  649    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2629899999999999e-45 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2380  ATP synthase F1, alpha subunit  63.71 
 
 
507 aa  679    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0176105 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4497  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.19 
 
 
512 aa  653    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.694909  normal  0.0411828 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4350  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.76 
 
 
510 aa  659    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0267  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.19 
 
 
510 aa  641    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.686525 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2400  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.5 
 
 
509 aa  654    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1519  ATP synthase F1, alpha subunit  57.74 
 
 
512 aa  644    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.283334  hitchhiker  0.000000000000106657 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4793  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.36 
 
 
502 aa  673    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3152  ATP synthase F1, alpha subunit  63.06 
 
 
501 aa  677    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2139  ATP synthase F1, alpha subunit  60.15 
 
 
507 aa  642    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0176  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.81 
 
 
510 aa  641    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1275  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.16 
 
 
503 aa  674    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.588856  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.16 
 
 
503 aa  674    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.244084  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3738  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.9 
 
 
502 aa  650    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0557  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.81 
 
 
510 aa  639    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.114224 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1736  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.23 
 
 
505 aa  642    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0532  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.81 
 
 
510 aa  644    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2193  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.09 
 
 
502 aa  672    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2705  F0F1 ATP synthase subunit alpha  84.79 
 
 
526 aa  922    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4334  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.57 
 
 
512 aa  671    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00117083  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7382  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.69 
 
 
509 aa  644    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187104  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2286  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.73 
 
 
509 aa  645    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1463  ATP synthase F1, alpha subunit  61.35 
 
 
509 aa  650    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.298107  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1468  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.88 
 
 
509 aa  644    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.184879 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2186  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.49 
 
 
502 aa  661    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3216  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.92 
 
 
509 aa  635    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.458172  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0183  F0F1 ATP synthase subunit alpha  67.37 
 
 
526 aa  715    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.617939  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2454  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.27 
 
 
502 aa  662    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2164  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.08 
 
 
502 aa  661    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17820  ATP synthase F1, alpha subunit  62.19 
 
 
541 aa  669    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0297  F0F1 ATP synthase subunit alpha  100 
 
 
526 aa  1061    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.204325 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0065  ATP synthase F1 subunit alpha  64.56 
 
 
532 aa  677    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4505  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.95 
 
 
510 aa  661    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16531  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.38 
 
 
505 aa  637    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.592214  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4037  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.4 
 
 
502 aa  659    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00278502 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5429  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.87 
 
 
502 aa  647    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.099904  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0915  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.62 
 
 
505 aa  644    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0383852  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5105  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.67 
 
 
502 aa  647    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0685  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.23 
 
 
505 aa  655    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.17328  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0601  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.8 
 
 
505 aa  659    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00209636  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2829  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.67 
 
 
502 aa  676    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1467  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.69 
 
 
509 aa  644    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16411  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.19 
 
 
505 aa  635    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1014  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.32 
 
 
502 aa  651    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000116673  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2584  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.15 
 
 
505 aa  656    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.341955  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3460  ATP synthase F1, alpha subunit  63.24 
 
 
507 aa  652    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.823714  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0605  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.85 
 
 
510 aa  647    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.404784  normal  0.651766 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15701  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.57 
 
 
504 aa  639    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.110948  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1527  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60 
 
 
505 aa  653    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000683533  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0604  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.76 
 
 
502 aa  683    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1505  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.76 
 
 
502 aa  683    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.56305  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  85.74 
 
 
526 aa  935    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4740  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.29 
 
 
510 aa  668    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.408023  hitchhiker  0.00635659 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3654  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.16 
 
 
509 aa  635    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>