More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03060 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.48 
 
 
526 aa  693    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2705  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.71 
 
 
526 aa  683    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03060  ATP synthase subunit A  100 
 
 
524 aa  1050    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0297  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.94 
 
 
526 aa  688    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.204325 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2332  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.09 
 
 
526 aa  685    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1233  ATP synthase F1, alpha subunit  73.66 
 
 
525 aa  794    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6523  ATP synthase F1, alpha subunit  74.24 
 
 
524 aa  801    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1059  F0F1 ATP synthase subunit alpha  83.78 
 
 
525 aa  912    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0065  ATP synthase F1 subunit alpha  68.51 
 
 
532 aa  741    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4632  ATP synthase F1, alpha subunit  74.43 
 
 
525 aa  793    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0663006  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1985  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.28 
 
 
526 aa  690    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.25217  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0140  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.18 
 
 
526 aa  677    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0262  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.94 
 
 
526 aa  687    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0489814 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1712  F0F1 ATP synthase subunit alpha  85.5 
 
 
526 aa  915    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000192165  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0315  ATP synthase F1, alpha subunit  67.11 
 
 
534 aa  721    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0183  F0F1 ATP synthase subunit alpha  73.85 
 
 
526 aa  796    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.617939  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0396  F0F1 ATP synthase subunit alpha  78.24 
 
 
524 aa  848    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3460  ATP synthase F1, alpha subunit  60.62 
 
 
507 aa  623  1e-177  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.823714  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1467  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.89 
 
 
509 aa  620  1e-176  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0605  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.31 
 
 
510 aa  617  1e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.404784  normal  0.651766 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1463  ATP synthase F1, alpha subunit  60.69 
 
 
509 aa  617  1e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.298107  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1746  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.04 
 
 
509 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal  0.129066 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1620  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.16 
 
 
504 aa  614  9.999999999999999e-175  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0802007  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1468  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.04 
 
 
509 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.184879 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6637  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.94 
 
 
509 aa  610  1e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0712183 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2078  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.2 
 
 
509 aa  608  1e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.368934 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1014  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.26 
 
 
502 aa  608  1e-173  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000116673  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7382  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.94 
 
 
509 aa  609  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187104  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0532  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.28 
 
 
510 aa  605  9.999999999999999e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4740  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.87 
 
 
510 aa  606  9.999999999999999e-173  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.408023  hitchhiker  0.00635659 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0430  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.57 
 
 
510 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3654  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.08 
 
 
509 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4793  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.43 
 
 
502 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0220  ATP synthase F1, alpha subunit  59.41 
 
 
509 aa  602  1.0000000000000001e-171  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2804  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.84 
 
 
510 aa  602  1.0000000000000001e-171  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.370852  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1679  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.59 
 
 
510 aa  601  1.0000000000000001e-171  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.536422  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2924  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.78 
 
 
509 aa  601  1e-170  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.363319  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3943  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.08 
 
 
509 aa  601  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0341  ATP synthase F1, alpha subunit  58.17 
 
 
509 aa  601  1e-170  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00762672 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3152  ATP synthase F1, alpha subunit  59.68 
 
 
501 aa  600  1e-170  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.98 
 
 
503 aa  600  1e-170  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.244084  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0173  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.87 
 
 
510 aa  599  1e-170  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2720  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.82 
 
 
503 aa  601  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4350  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.56 
 
 
510 aa  598  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0267  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.06 
 
 
510 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.686525 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2400  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.21 
 
 
509 aa  601  1e-170  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1275  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.98 
 
 
503 aa  600  1e-170  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.588856  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0176  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.77 
 
 
510 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2759  ATP synthase F1, alpha subunit  59.53 
 
 
502 aa  599  1e-170  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1103  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.6 
 
 
509 aa  598  1e-170  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0406  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.96 
 
 
509 aa  600  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.102948 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3383  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.82 
 
 
503 aa  601  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0111242  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0621  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.33 
 
 
509 aa  600  1e-170  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.953551 
 
 
-
 
NC_004310  BR1801  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.91 
 
 
509 aa  596  1e-169  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2829  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.74 
 
 
502 aa  597  1e-169  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16301  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.74 
 
 
505 aa  595  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0987  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.36 
 
 
502 aa  595  1e-169  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975811  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0336  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.38 
 
 
505 aa  595  1e-169  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.120732  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1224  ATP synthase F1, alpha subunit  57.12 
 
 
510 aa  595  1e-169  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2380  ATP synthase F1, alpha subunit  58.48 
 
 
507 aa  598  1e-169  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0176105 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1734  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.91 
 
 
509 aa  595  1e-169  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0557  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.19 
 
 
510 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.114224 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1426  ATP synthase F1, alpha subunit  58.24 
 
 
507 aa  597  1e-169  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4108  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.45 
 
 
508 aa  595  1e-169  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4505  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.36 
 
 
510 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01523  ATP synthase alpha chain, mitochondrial precursor (Broad)  55.98 
 
 
556 aa  593  1e-168  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4486  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.36 
 
 
510 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0915  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.06 
 
 
505 aa  593  1e-168  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0383852  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4497  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.45 
 
 
512 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.694909  normal  0.0411828 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0513  ATP synthase F1, alpha subunit  57.92 
 
 
501 aa  592  1e-168  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.36 
 
 
505 aa  593  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4334  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.76 
 
 
512 aa  592  1e-168  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00117083  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2193  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.36 
 
 
502 aa  593  1e-168  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16411  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.74 
 
 
505 aa  593  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16531  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.74 
 
 
505 aa  594  1e-168  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.592214  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2186  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.7 
 
 
502 aa  590  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1736  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.87 
 
 
505 aa  590  1e-167  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2203  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.71 
 
 
512 aa  590  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0081  ATP synthase F1, alpha subunit  56.21 
 
 
507 aa  589  1e-167  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2286  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.62 
 
 
509 aa  590  1e-167  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0601  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.32 
 
 
505 aa  590  1e-167  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00209636  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3216  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.81 
 
 
509 aa  589  1e-167  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.458172  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0193  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.95 
 
 
501 aa  591  1e-167  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0287666  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1527  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.72 
 
 
505 aa  590  1e-167  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000683533  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3305  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.48 
 
 
502 aa  586  1e-166  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.694138  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1505  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.76 
 
 
502 aa  587  1e-166  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.56305  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1315  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.05 
 
 
512 aa  587  1e-166  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2297  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.33 
 
 
512 aa  587  1e-166  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0488  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.32 
 
 
506 aa  587  1e-166  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.294002  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2188  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.8 
 
 
506 aa  585  1e-166  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.929468 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2619  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.87 
 
 
503 aa  587  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3417  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.08 
 
 
502 aa  587  1e-166  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0972  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.33 
 
 
512 aa  587  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15701  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.17 
 
 
504 aa  587  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.110948  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86570  F1F0-ATPase complex, F1 alpha subunit  55.22 
 
 
545 aa  586  1e-166  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0112  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.64 
 
 
511 aa  585  1e-166  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2384  Sodium-transporting two-sector ATPase  57.36 
 
 
504 aa  585  1e-166  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0685  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.19 
 
 
505 aa  588  1e-166  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.17328  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2584  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.65 
 
 
505 aa  586  1e-166  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.341955  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0604  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.76 
 
 
502 aa  587  1e-166  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>