More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0972 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001303  ANIA_10626  hypothetical protein similar to ATP synthase alpha chain (Broad)  65.29 
 
 
561 aa  690    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.585818  normal  0.812779 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01523  ATP synthase alpha chain, mitochondrial precursor (Broad)  67.72 
 
 
556 aa  720    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0111  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.82 
 
 
503 aa  689    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2936  F0F1 ATP synthase subunit alpha  90.62 
 
 
512 aa  949    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.147396  normal  0.0629902 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7382  F0F1 ATP synthase subunit alpha  76.13 
 
 
509 aa  781    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187104  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3654  F0F1 ATP synthase subunit alpha  76.56 
 
 
509 aa  800    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6637  F0F1 ATP synthase subunit alpha  76.17 
 
 
509 aa  785    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0712183 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4261  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.97 
 
 
502 aa  682    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00501837  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3943  F0F1 ATP synthase subunit alpha  76.56 
 
 
509 aa  800    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2078  F0F1 ATP synthase subunit alpha  75.78 
 
 
509 aa  789    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.368934 
 
 
-
 
NC_004310  BR1801  F0F1 ATP synthase subunit alpha  77.54 
 
 
509 aa  804    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0173  F0F1 ATP synthase subunit alpha  75.98 
 
 
510 aa  785    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4505  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.71 
 
 
510 aa  658    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4497  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.86 
 
 
512 aa  653    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.694909  normal  0.0411828 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02280  ATP synthase alpha chain, mitochondrial precursor, putative  69.23 
 
 
540 aa  723    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1467  F0F1 ATP synthase subunit alpha  75 
 
 
509 aa  778    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86570  F1F0-ATPase complex, F1 alpha subunit  67.98 
 
 
545 aa  721    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0513  ATP synthase F1, alpha subunit  62.16 
 
 
501 aa  649    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4486  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.51 
 
 
510 aa  656    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4740  F0F1 ATP synthase subunit alpha  73.1 
 
 
510 aa  766    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.408023  hitchhiker  0.00635659 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0430  F0F1 ATP synthase subunit alpha  75.2 
 
 
510 aa  778    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1103  F0F1 ATP synthase subunit alpha  77.73 
 
 
509 aa  806    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47835  synthase of mitochondrial ATP synthase  64.34 
 
 
544 aa  665    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0112  F0F1 ATP synthase subunit alpha  74.61 
 
 
511 aa  780    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2297  F0F1 ATP synthase subunit alpha  100 
 
 
512 aa  1037    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0947  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.21 
 
 
502 aa  667    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3133  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.21 
 
 
502 aa  667    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3408  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.82 
 
 
503 aa  689    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.14914  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0987  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.45 
 
 
502 aa  648    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975811  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2193  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.25 
 
 
502 aa  649    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2759  ATP synthase F1, alpha subunit  66.24 
 
 
502 aa  643    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0915  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.57 
 
 
505 aa  634    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0383852  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1224  ATP synthase F1, alpha subunit  74.02 
 
 
510 aa  774    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6064  ATP synthase F1, alpha subunit  63.57 
 
 
512 aa  665    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0601  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.21 
 
 
505 aa  654    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00209636  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4350  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.71 
 
 
510 aa  657    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0267  F0F1 ATP synthase subunit alpha  76.17 
 
 
510 aa  787    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.686525 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2400  F0F1 ATP synthase subunit alpha  73.44 
 
 
509 aa  777    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3952  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.4 
 
 
502 aa  672    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.116029  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0132  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.96 
 
 
509 aa  635    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1047  F0F1 ATP synthase subunit alpha  85.35 
 
 
512 aa  909    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.501487  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0341  ATP synthase F1, alpha subunit  74.8 
 
 
509 aa  771    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00762672 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0176  F0F1 ATP synthase subunit alpha  75.39 
 
 
510 aa  784    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1315  F0F1 ATP synthase subunit alpha  70.62 
 
 
512 aa  728    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2214  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.25 
 
 
504 aa  644    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.188551  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1746  F0F1 ATP synthase subunit alpha  75 
 
 
509 aa  776    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal  0.129066 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3816  F0F1 ATP synthase subunit alpha  85.55 
 
 
511 aa  889    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.905134  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0557  F0F1 ATP synthase subunit alpha  75.59 
 
 
510 aa  785    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.114224 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0532  F0F1 ATP synthase subunit alpha  76.32 
 
 
510 aa  792    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0972  F0F1 ATP synthase subunit alpha  100 
 
 
512 aa  1037    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4108  F0F1 ATP synthase subunit alpha  76.76 
 
 
508 aa  802    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2088  F0F1 ATP synthase subunit alpha  87.33 
 
 
513 aa  910    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.509731  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2286  F0F1 ATP synthase subunit alpha  71.88 
 
 
509 aa  760    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0406  F0F1 ATP synthase subunit alpha  76.37 
 
 
509 aa  784    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.102948 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1679  F0F1 ATP synthase subunit alpha  72.12 
 
 
510 aa  759    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.536422  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0220  ATP synthase F1, alpha subunit  72.27 
 
 
509 aa  759    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3216  F0F1 ATP synthase subunit alpha  77.93 
 
 
509 aa  819    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.458172  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3364  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.64 
 
 
502 aa  647    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.677346  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2829  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.86 
 
 
502 aa  638    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2186  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.97 
 
 
502 aa  642    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4037  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.4 
 
 
502 aa  674    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00278502 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2804  F0F1 ATP synthase subunit alpha  77 
 
 
510 aa  803    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.370852  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1734  F0F1 ATP synthase subunit alpha  77.54 
 
 
509 aa  803    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3172  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.19 
 
 
502 aa  676    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0844597  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2924  F0F1 ATP synthase subunit alpha  76.95 
 
 
509 aa  803    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.363319  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2203  F0F1 ATP synthase subunit alpha  98.83 
 
 
512 aa  1026    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1463  ATP synthase F1, alpha subunit  75 
 
 
509 aa  793    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.298107  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1468  F0F1 ATP synthase subunit alpha  75 
 
 
509 aa  776    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.184879 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0621  F0F1 ATP synthase subunit alpha  72.46 
 
 
509 aa  772    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.953551 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2584  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.67 
 
 
505 aa  644    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.341955  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3460  ATP synthase F1, alpha subunit  68.69 
 
 
507 aa  711    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.823714  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0605  F0F1 ATP synthase subunit alpha  75.15 
 
 
510 aa  777    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.404784  normal  0.651766 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0604  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.09 
 
 
502 aa  671    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1505  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.09 
 
 
502 aa  671    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.56305  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0685  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.2 
 
 
505 aa  633  1e-180  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.17328  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0083  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.35 
 
 
509 aa  632  1e-180  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0193  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.95 
 
 
501 aa  632  1e-180  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0287666  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1736  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.37 
 
 
505 aa  634  1e-180  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4793  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.27 
 
 
502 aa  630  1e-179  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4167  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.55 
 
 
501 aa  629  1e-179  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.804654  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4334  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.86 
 
 
512 aa  630  1e-179  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00117083  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1527  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.2 
 
 
505 aa  630  1e-179  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000683533  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0100  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.57 
 
 
501 aa  626  1e-178  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0112  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.37 
 
 
501 aa  625  1e-178  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0295232  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0140  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.57 
 
 
501 aa  626  1e-178  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.241383  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17820  ATP synthase F1, alpha subunit  58.4 
 
 
541 aa  622  1e-177  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3152  ATP synthase F1, alpha subunit  60.55 
 
 
501 aa  621  1e-177  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0065  ATP synthase F1, alpha subunit  59.88 
 
 
508 aa  620  1e-176  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1426  ATP synthase F1, alpha subunit  60.2 
 
 
507 aa  619  1e-176  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3417  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.18 
 
 
502 aa  619  1e-176  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1519  ATP synthase F1, alpha subunit  57.93 
 
 
512 aa  618  1e-176  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.283334  hitchhiker  0.000000000000106657 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0336  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.84 
 
 
505 aa  618  1e-176  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.120732  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3305  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.67 
 
 
502 aa  618  1e-176  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.694138  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2384  Sodium-transporting two-sector ATPase  61.01 
 
 
504 aa  619  1e-176  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3738  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.38 
 
 
502 aa  617  1e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0201  ATP synthase F1, alpha subunit  61.06 
 
 
501 aa  615  1e-175  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.406681  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0140  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.44 
 
 
526 aa  616  1e-175  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1014  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.08 
 
 
502 aa  616  1e-175  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000116673  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2846  ATP synthase F1, alpha subunit  59.3 
 
 
508 aa  617  1e-175  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.525611 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3827  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.1 
 
 
502 aa  615  1e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>