More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3952 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_4261  F0F1 ATP synthase subunit alpha  92.43 
 
 
502 aa  950    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00501837  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01523  ATP synthase alpha chain, mitochondrial precursor (Broad)  61.31 
 
 
556 aa  646    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3738  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.27 
 
 
502 aa  689    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0220  ATP synthase F1, alpha subunit  61.89 
 
 
509 aa  657    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_002936  DET0562  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.92 
 
 
503 aa  635    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.529195  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0111  F0F1 ATP synthase subunit alpha  90.46 
 
 
503 aa  926    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0536  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.32 
 
 
503 aa  640    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.19649  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1711  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.47 
 
 
503 aa  671    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0406  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.05 
 
 
509 aa  672    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.102948 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1519  ATP synthase F1, alpha subunit  59.92 
 
 
512 aa  638    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.283334  hitchhiker  0.000000000000106657 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5432  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.33 
 
 
502 aa  689    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0100  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.99 
 
 
501 aa  675    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0861  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.33 
 
 
501 aa  654    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0205389  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1801  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.57 
 
 
509 aa  684    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0112  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.19 
 
 
511 aa  681    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5105  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.53 
 
 
502 aa  692    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5157  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.33 
 
 
502 aa  689    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4990  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.33 
 
 
502 aa  689    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2936  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.37 
 
 
512 aa  678    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.147396  normal  0.0629902 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5007  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.33 
 
 
502 aa  689    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4740  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.64 
 
 
510 aa  684    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.408023  hitchhiker  0.00635659 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3827  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.14 
 
 
502 aa  689    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2924  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.54 
 
 
509 aa  706    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.363319  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02280  ATP synthase alpha chain, mitochondrial precursor, putative  63.62 
 
 
540 aa  643    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0972  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.4 
 
 
512 aa  672    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.48 
 
 
503 aa  642    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.244084  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1463  ATP synthase F1, alpha subunit  65.35 
 
 
509 aa  686    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.298107  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2332  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.9 
 
 
526 aa  651    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86570  F1F0-ATPase complex, F1 alpha subunit  61.75 
 
 
545 aa  636    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2846  ATP synthase F1, alpha subunit  63.2 
 
 
508 aa  661    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.525611 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0430  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.65 
 
 
510 aa  668    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2611  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.55 
 
 
506 aa  647    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.169882  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0915  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.67 
 
 
505 aa  676    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0383852  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2139  ATP synthase F1, alpha subunit  63.2 
 
 
507 aa  646    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16531  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.56 
 
 
505 aa  637    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.592214  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2297  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.4 
 
 
512 aa  672    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0947  F0F1 ATP synthase subunit alpha  77.45 
 
 
502 aa  795    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3133  F0F1 ATP synthase subunit alpha  77.45 
 
 
502 aa  795    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0685  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.6 
 
 
505 aa  691    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.17328  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1985  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.86 
 
 
526 aa  664    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.25217  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0465  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.5 
 
 
509 aa  637    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.809021  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0140  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61 
 
 
526 aa  651    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1275  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.48 
 
 
503 aa  642    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.588856  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3408  F0F1 ATP synthase subunit alpha  90.26 
 
 
503 aa  928    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.14914  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0987  F0F1 ATP synthase subunit alpha  69.52 
 
 
502 aa  729    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975811  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5549  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.33 
 
 
502 aa  689    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.31478  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1405  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.13 
 
 
505 aa  672    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0699258  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1620  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.33 
 
 
504 aa  685    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0802007  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0336  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.55 
 
 
505 aa  647    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.120732  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0308  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.52 
 
 
513 aa  643    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0176346  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0140  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.99 
 
 
501 aa  674    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.241383  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1224  ATP synthase F1, alpha subunit  65.82 
 
 
510 aa  683    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2380  ATP synthase F1, alpha subunit  69.58 
 
 
507 aa  719    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0176105 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6637  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.44 
 
 
509 aa  674    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0712183 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4350  F0F1 ATP synthase subunit alpha  70.95 
 
 
510 aa  730    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0267  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.65 
 
 
510 aa  671    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.686525 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2400  F0F1 ATP synthase subunit alpha  69.69 
 
 
509 aa  731    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1047  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.81 
 
 
512 aa  674    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.501487  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4497  F0F1 ATP synthase subunit alpha  70.75 
 
 
512 aa  736    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.694909  normal  0.0411828 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2078  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.37 
 
 
509 aa  665    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.368934 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0176  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.87 
 
 
510 aa  667    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2746  ATP synthase F1, alpha subunit  60.04 
 
 
513 aa  644    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.426504  normal  0.209432 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0605  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.5 
 
 
510 aa  669    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.404784  normal  0.651766 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0112  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.39 
 
 
501 aa  671    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0295232  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2193  F0F1 ATP synthase subunit alpha  67.93 
 
 
502 aa  719    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0557  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.87 
 
 
510 aa  669    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.114224 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0601  F0F1 ATP synthase subunit alpha  67.2 
 
 
505 aa  707    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00209636  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0532  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.87 
 
 
510 aa  667    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1679  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.85 
 
 
510 aa  682    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.536422  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3496  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.31 
 
 
513 aa  635    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.225453  normal  0.438236 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4334  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.33 
 
 
512 aa  701    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00117083  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2088  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.23 
 
 
513 aa  688    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.509731  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2286  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.14 
 
 
509 aa  703    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1734  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.57 
 
 
509 aa  683    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3816  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.33 
 
 
511 aa  668    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.905134  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3216  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.01 
 
 
509 aa  693    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.458172  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3152  ATP synthase F1, alpha subunit  67 
 
 
501 aa  691    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2454  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66 
 
 
502 aa  688    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2164  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.8 
 
 
502 aa  687    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0621  F0F1 ATP synthase subunit alpha  67.13 
 
 
509 aa  704    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.953551 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1467  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.98 
 
 
509 aa  671    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16411  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.76 
 
 
505 aa  638    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1468  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.17 
 
 
509 aa  673    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.184879 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2203  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.41 
 
 
512 aa  666    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.48 
 
 
526 aa  656    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2384  Sodium-transporting two-sector ATPase  65.54 
 
 
504 aa  674    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2804  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.85 
 
 
510 aa  675    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.370852  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1736  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.6 
 
 
505 aa  675    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2141  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.47 
 
 
502 aa  670    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.588965  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1935  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.81 
 
 
500 aa  640    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.47 
 
 
502 aa  670    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1240  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.88 
 
 
506 aa  639    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1871  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.8 
 
 
505 aa  635    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.798226  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0519  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.52 
 
 
501 aa  654    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1103  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.57 
 
 
509 aa  682    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2584  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.54 
 
 
505 aa  700    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.341955  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3460  ATP synthase F1, alpha subunit  65.48 
 
 
507 aa  664    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.823714  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3338  ATP synthase F1 subunit alpha  63.15 
 
 
506 aa  646    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1527  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.74 
 
 
505 aa  689    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000683533  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0604  F0F1 ATP synthase subunit alpha  84.86 
 
 
502 aa  884    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>