More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2384 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3172  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.93 
 
 
502 aa  687    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0844597  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.37 
 
 
503 aa  660    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.244084  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3827  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.94 
 
 
502 aa  662    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0562  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.97 
 
 
503 aa  643    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.529195  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0111  F0F1 ATP synthase subunit alpha  67.2 
 
 
503 aa  682    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1711  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.34 
 
 
503 aa  665    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21420  ATP synthase F1 subcomplex alpha subunit  61.63 
 
 
520 aa  635    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5432  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.14 
 
 
502 aa  663    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2759  ATP synthase F1, alpha subunit  64.14 
 
 
502 aa  667    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2186  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.94 
 
 
502 aa  652    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1426  ATP synthase F1, alpha subunit  66.33 
 
 
507 aa  689    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2606  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.15 
 
 
506 aa  649    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5157  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.14 
 
 
502 aa  663    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4990  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.14 
 
 
502 aa  663    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5007  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.14 
 
 
502 aa  663    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2619  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.55 
 
 
503 aa  642    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.21 
 
 
502 aa  663    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4793  F0F1 ATP synthase subunit alpha  69.72 
 
 
502 aa  723    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5522  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.14 
 
 
502 aa  663    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000300598  hitchhiker  0.0000000000000322299 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3364  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.95 
 
 
502 aa  647    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.677346  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4261  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.93 
 
 
502 aa  688    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00501837  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3305  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.9 
 
 
502 aa  657    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.694138  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2611  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.75 
 
 
506 aa  636    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.169882  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4037  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.34 
 
 
502 aa  673    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00278502 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0465  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.75 
 
 
509 aa  641    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.809021  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0947  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.95 
 
 
502 aa  650    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3133  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.95 
 
 
502 aa  650    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3952  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.54 
 
 
502 aa  674    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.116029  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0201  ATP synthase F1, alpha subunit  65.74 
 
 
501 aa  683    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.406681  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3738  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.73 
 
 
502 aa  692    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3408  F0F1 ATP synthase subunit alpha  67 
 
 
503 aa  681    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.14914  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0987  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.75 
 
 
502 aa  656    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975811  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5549  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.14 
 
 
502 aa  663    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.31478  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0536  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.96 
 
 
503 aa  651    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.19649  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0336  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.76 
 
 
505 aa  634    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.120732  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5398  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.14 
 
 
502 aa  663    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2629899999999999e-45 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4167  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.99 
 
 
501 aa  727    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.804654  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2380  ATP synthase F1, alpha subunit  72.51 
 
 
507 aa  754    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0176105 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1492  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.35 
 
 
505 aa  637    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0642798  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2400  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.18 
 
 
509 aa  635    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0270  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.75 
 
 
505 aa  646    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0621  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.96 
 
 
509 aa  640    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.953551 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12070  ATP synthase F1 subcomplex alpha subunit  61.9 
 
 
524 aa  634    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1463  ATP synthase F1, alpha subunit  62.16 
 
 
509 aa  636    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.298107  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0081  ATP synthase F1, alpha subunit  70.24 
 
 
507 aa  747    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2214  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.14 
 
 
504 aa  660    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.188551  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2829  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.55 
 
 
502 aa  650    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3417  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.69 
 
 
502 aa  659    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4334  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63 
 
 
512 aa  647    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00117083  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5485  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.14 
 
 
502 aa  663    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.184326  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6064  ATP synthase F1, alpha subunit  63.78 
 
 
512 aa  668    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_501  ATP synthase F1, alpha subunit  64.2 
 
 
503 aa  650    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0562093  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17820  ATP synthase F1, alpha subunit  68.25 
 
 
541 aa  717    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5105  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.34 
 
 
502 aa  666    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3383  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.9 
 
 
503 aa  641    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0111242  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2454  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.14 
 
 
502 aa  665    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2164  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.14 
 
 
502 aa  665    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2199  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.29 
 
 
505 aa  642    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.539772 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2720  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.9 
 
 
503 aa  641    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2141  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.21 
 
 
502 aa  663    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.588965  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2384  Sodium-transporting two-sector ATPase  100 
 
 
504 aa  1020    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5429  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.34 
 
 
502 aa  665    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.099904  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0292  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.23 
 
 
507 aa  635    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0065  ATP synthase F1, alpha subunit  65.34 
 
 
508 aa  676    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2139  ATP synthase F1, alpha subunit  69.52 
 
 
507 aa  732    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1275  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.37 
 
 
503 aa  660    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.588856  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2584  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.17 
 
 
505 aa  644    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.341955  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1519  ATP synthase F1, alpha subunit  60.4 
 
 
512 aa  649    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.283334  hitchhiker  0.000000000000106657 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2589  ATP synthase F1, alpha subunit  60.12 
 
 
513 aa  640    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.20493  normal  0.113766 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1027  ATP synthase F1, alpha subunit  67.73 
 
 
501 aa  667    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0604  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.01 
 
 
502 aa  675    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1505  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.01 
 
 
502 aa  675    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.56305  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2846  ATP synthase F1, alpha subunit  64.94 
 
 
508 aa  680    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.525611 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3152  ATP synthase F1, alpha subunit  71.97 
 
 
501 aa  756    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2193  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.75 
 
 
502 aa  656    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0327  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.43 
 
 
507 aa  632  1e-180  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0262  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.73 
 
 
526 aa  634  1e-180  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0489814 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0297  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.15 
 
 
526 aa  632  1e-180  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.204325 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1240  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.52 
 
 
506 aa  633  1e-180  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0519  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.72 
 
 
501 aa  632  1e-180  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1527  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.64 
 
 
505 aa  632  1e-180  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000683533  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.73 
 
 
526 aa  631  1e-180  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16301  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.56 
 
 
505 aa  629  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16531  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.76 
 
 
505 aa  630  1e-179  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.592214  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0514  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.67 
 
 
527 aa  629  1e-179  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.709885  normal  0.673527 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15701  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.16 
 
 
504 aa  629  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.110948  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0213  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.92 
 
 
514 aa  630  1e-179  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.76 
 
 
505 aa  630  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16411  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.96 
 
 
505 aa  631  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0176  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.86 
 
 
510 aa  628  1e-179  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0513  ATP synthase F1, alpha subunit  60.56 
 
 
501 aa  629  1e-179  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0747  ATP synthase F1, alpha subunit  60.28 
 
 
504 aa  629  1e-179  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.873736  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3338  ATP synthase F1 subunit alpha  61.75 
 
 
506 aa  630  1e-179  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4497  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.2 
 
 
512 aa  629  1e-179  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.694909  normal  0.0411828 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0685  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.16 
 
 
505 aa  626  1e-178  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.17328  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1679  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.49 
 
 
510 aa  627  1e-178  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.536422  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0981  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.16 
 
 
504 aa  627  1e-178  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4350  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.8 
 
 
510 aa  625  1e-178  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1043  ATP synthase F1, alpha subunit  61.43 
 
 
522 aa  627  1e-178  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.890996  normal  0.113061 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0557  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.25 
 
 
510 aa  626  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.114224 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>