More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0292 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_0173  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.76 
 
 
510 aa  640    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5522  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.55 
 
 
502 aa  648    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000300598  hitchhiker  0.0000000000000322299 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16301  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.76 
 
 
505 aa  635    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2193  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.68 
 
 
502 aa  650    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0562  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.18 
 
 
503 aa  641    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.529195  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0111  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.43 
 
 
503 aa  635    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3417  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.34 
 
 
502 aa  673    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1711  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.23 
 
 
503 aa  635    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2846  ATP synthase F1, alpha subunit  63.35 
 
 
508 aa  668    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.525611 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4740  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.67 
 
 
510 aa  651    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.408023  hitchhiker  0.00635659 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5432  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.55 
 
 
502 aa  647    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0100  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.72 
 
 
501 aa  648    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2078  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.08 
 
 
509 aa  641    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.368934 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3364  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.08 
 
 
502 aa  644    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.677346  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2829  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.28 
 
 
502 aa  645    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5157  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.55 
 
 
502 aa  647    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4990  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.55 
 
 
502 aa  647    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5007  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.55 
 
 
502 aa  647    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17820  ATP synthase F1, alpha subunit  64.94 
 
 
541 aa  681    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2214  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.08 
 
 
504 aa  652    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.188551  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0536  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.58 
 
 
503 aa  636    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.19649  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15701  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.96 
 
 
504 aa  640    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.110948  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5429  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.35 
 
 
502 aa  646    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.099904  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2759  ATP synthase F1, alpha subunit  63.94 
 
 
502 aa  666    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3383  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.08 
 
 
503 aa  639    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0111242  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1426  ATP synthase F1, alpha subunit  67.54 
 
 
507 aa  693    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3152  ATP synthase F1, alpha subunit  63.27 
 
 
501 aa  667    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_501  ATP synthase F1, alpha subunit  63.78 
 
 
503 aa  645    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0562093  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0430  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.37 
 
 
510 aa  637    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2611  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.87 
 
 
506 aa  640    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.169882  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3827  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.55 
 
 
502 aa  649    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  79.84 
 
 
503 aa  839    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.244084  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7382  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.08 
 
 
509 aa  642    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187104  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0947  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.75 
 
 
502 aa  651    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3133  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.75 
 
 
502 aa  651    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1467  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.08 
 
 
509 aa  645    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1985  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.74 
 
 
526 aa  640    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.25217  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5398  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.55 
 
 
502 aa  647    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2629899999999999e-45 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4793  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.75 
 
 
502 aa  657    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1620  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.53 
 
 
504 aa  645    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0802007  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3408  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.43 
 
 
503 aa  640    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.14914  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0987  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.56 
 
 
502 aa  654    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975811  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5549  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.55 
 
 
502 aa  647    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.31478  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0193  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.35 
 
 
501 aa  639    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0287666  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1027  ATP synthase F1, alpha subunit  63.94 
 
 
501 aa  636    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0336  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.55 
 
 
505 aa  642    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.120732  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0605  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.69 
 
 
510 aa  652    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.404784  normal  0.651766 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5485  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.55 
 
 
502 aa  647    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.184326  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2380  ATP synthase F1, alpha subunit  67.06 
 
 
507 aa  702    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0176105 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2619  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.95 
 
 
503 aa  645    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0915  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.6 
 
 
505 aa  647    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0383852  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0267  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.96 
 
 
510 aa  644    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.686525 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1492  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.9 
 
 
505 aa  649    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0642798  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4261  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.16 
 
 
502 aa  636    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00501837  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0601  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.08 
 
 
505 aa  637    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00209636  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0297  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.54 
 
 
526 aa  650    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.204325 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1736  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.6 
 
 
505 aa  646    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0176  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.55 
 
 
510 aa  648    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0406  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.69 
 
 
509 aa  637    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.102948 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1679  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.9 
 
 
510 aa  644    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.536422  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3738  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.43 
 
 
502 aa  647    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0557  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.55 
 
 
510 aa  649    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.114224 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5105  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.35 
 
 
502 aa  646    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0532  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.23 
 
 
510 aa  649    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0327  F0F1 ATP synthase subunit alpha  83.43 
 
 
507 aa  874    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0081  ATP synthase F1, alpha subunit  63.44 
 
 
507 aa  670    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2720  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.08 
 
 
503 aa  639    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0747  ATP synthase F1, alpha subunit  68.91 
 
 
504 aa  706    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.873736  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1519  ATP synthase F1, alpha subunit  59.8 
 
 
512 aa  637    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.283334  hitchhiker  0.000000000000106657 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1468  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.08 
 
 
509 aa  645    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.184879 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0140  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.72 
 
 
501 aa  647    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.241383  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1640  ATP synthase F1, alpha subunit  63.22 
 
 
526 aa  654    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6064  ATP synthase F1, alpha subunit  63.1 
 
 
512 aa  652    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1463  ATP synthase F1, alpha subunit  61.89 
 
 
509 aa  636    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.298107  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2454  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.55 
 
 
502 aa  645    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2164  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.55 
 
 
502 aa  645    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0262  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.93 
 
 
526 aa  645    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0489814 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0513  ATP synthase F1, alpha subunit  62.42 
 
 
501 aa  652    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2606  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.11 
 
 
506 aa  645    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1746  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.08 
 
 
509 aa  645    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal  0.129066 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0685  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.2 
 
 
505 aa  643    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.17328  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2384  Sodium-transporting two-sector ATPase  61.23 
 
 
504 aa  635    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2332  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.54 
 
 
526 aa  640    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2139  ATP synthase F1, alpha subunit  63.44 
 
 
507 aa  665    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4167  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.87 
 
 
501 aa  682    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.804654  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0292  F0F1 ATP synthase subunit alpha  100 
 
 
507 aa  1020    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1014  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.57 
 
 
502 aa  659    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000116673  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0065  ATP synthase F1, alpha subunit  66.73 
 
 
508 aa  690    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2186  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.36 
 
 
502 aa  642    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0270  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.43 
 
 
505 aa  642    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1275  F0F1 ATP synthase subunit alpha  79.84 
 
 
503 aa  839    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.588856  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2584  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.83 
 
 
505 aa  650    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.341955  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3305  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.41 
 
 
502 aa  674    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.694138  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0112  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.52 
 
 
501 aa  648    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0295232  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1978  ATP synthase F1, alpha subunit  63.55 
 
 
499 aa  634    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1527  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.28 
 
 
505 aa  648    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000683533  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0604  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.08 
 
 
502 aa  649    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1505  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.08 
 
 
502 aa  649    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.56305  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.15 
 
 
526 aa  644    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6637  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.69 
 
 
509 aa  641    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0712183 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>