More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2164 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1492  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.28 
 
 
505 aa  651    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0642798  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1519  ATP synthase F1, alpha subunit  60.12 
 
 
512 aa  653    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.283334  hitchhiker  0.000000000000106657 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1103  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.83 
 
 
509 aa  644    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0514  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.6 
 
 
527 aa  635    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.709885  normal  0.673527 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1679  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.51 
 
 
510 aa  635    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.536422  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0111  F0F1 ATP synthase subunit alpha  67.86 
 
 
503 aa  708    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.8 
 
 
502 aa  659    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1711  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.6 
 
 
503 aa  654    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2141  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.8 
 
 
502 aa  659    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.588965  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2846  ATP synthase F1, alpha subunit  65.48 
 
 
508 aa  688    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.525611 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5432  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.27 
 
 
502 aa  682    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0100  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.79 
 
 
501 aa  659    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0861  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.77 
 
 
501 aa  641    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0205389  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1801  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.22 
 
 
509 aa  649    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2606  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.54 
 
 
506 aa  674    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3952  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.8 
 
 
502 aa  687    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.116029  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5157  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.27 
 
 
502 aa  682    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4990  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.27 
 
 
502 aa  682    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0297  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.08 
 
 
526 aa  661    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.204325 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5007  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.27 
 
 
502 aa  682    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2705  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.66 
 
 
526 aa  654    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18491  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.28 
 
 
504 aa  640    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.983268 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16531  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.88 
 
 
505 aa  647    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.592214  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4497  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.45 
 
 
512 aa  674    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.694909  normal  0.0411828 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0140  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.59 
 
 
501 aa  657    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.241383  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16301  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.88 
 
 
505 aa  648    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1267  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.6 
 
 
526 aa  634    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.793474  normal  0.559767 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0981  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.88 
 
 
504 aa  646    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2924  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.52 
 
 
509 aa  650    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.363319  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1736  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.65 
 
 
505 aa  653    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4740  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.08 
 
 
510 aa  653    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.408023  hitchhiker  0.00635659 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2611  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.8 
 
 
506 aa  659    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.169882  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2332  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.63 
 
 
526 aa  661    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2193  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.25 
 
 
502 aa  667    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0465  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.6 
 
 
509 aa  635    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.809021  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0947  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.4 
 
 
502 aa  689    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3133  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.4 
 
 
502 aa  689    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1014  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.28 
 
 
502 aa  652    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000116673  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1985  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.82 
 
 
526 aa  664    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.25217  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2619  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63 
 
 
503 aa  660    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0140  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.88 
 
 
526 aa  649    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2188  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.82 
 
 
506 aa  638    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.929468 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3408  F0F1 ATP synthase subunit alpha  67.47 
 
 
503 aa  707    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.14914  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0987  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.4 
 
 
502 aa  668    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975811  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5549  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.27 
 
 
502 aa  682    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.31478  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5522  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.27 
 
 
502 aa  682    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000300598  hitchhiker  0.0000000000000322299 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.08 
 
 
505 aa  649    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0336  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.48 
 
 
505 aa  646    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.120732  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4793  F0F1 ATP synthase subunit alpha  70.26 
 
 
502 aa  734    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2186  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.45 
 
 
502 aa  660    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2380  ATP synthase F1, alpha subunit  69.06 
 
 
507 aa  730    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0176105 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5485  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.27 
 
 
502 aa  682    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.184326  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4350  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.04 
 
 
510 aa  673    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0213  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.3 
 
 
514 aa  640    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2400  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.02 
 
 
509 aa  646    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1463  ATP synthase F1, alpha subunit  61.42 
 
 
509 aa  642    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.298107  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3172  F0F1 ATP synthase subunit alpha  67 
 
 
502 aa  699    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0844597  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3152  ATP synthase F1, alpha subunit  68.8 
 
 
501 aa  719    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0176  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.31 
 
 
510 aa  635    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0685  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.66 
 
 
505 aa  659    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.17328  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0915  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.45 
 
 
505 aa  655    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0383852  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3827  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.27 
 
 
502 aa  684    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3338  ATP synthase F1 subunit alpha  63.8 
 
 
506 aa  660    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0262  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.27 
 
 
526 aa  655    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0489814 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2139  ATP synthase F1, alpha subunit  66.07 
 
 
507 aa  686    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0112  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.18 
 
 
511 aa  643    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1275  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.28 
 
 
503 aa  654    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.588856  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4334  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.6 
 
 
512 aa  671    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00117083  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4261  F0F1 ATP synthase subunit alpha  67.8 
 
 
502 aa  710    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00501837  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2286  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.01 
 
 
509 aa  660    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5398  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.27 
 
 
502 aa  682    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2629899999999999e-45 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0621  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.83 
 
 
509 aa  643    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.953551 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5429  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.47 
 
 
502 aa  684    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.099904  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3216  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.02 
 
 
509 aa  642    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.458172  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4486  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.04 
 
 
510 aa  671    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2454  F0F1 ATP synthase subunit alpha  99.8 
 
 
502 aa  1015    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2164  F0F1 ATP synthase subunit alpha  100 
 
 
502 aa  1016    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.28 
 
 
503 aa  654    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.244084  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2199  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.95 
 
 
505 aa  646    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.539772 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0112  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.39 
 
 
501 aa  657    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0295232  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16411  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.88 
 
 
505 aa  646    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2720  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62 
 
 
503 aa  642    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5105  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.47 
 
 
502 aa  684    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2384  Sodium-transporting two-sector ATPase  64.14 
 
 
504 aa  665    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2804  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.71 
 
 
510 aa  645    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.370852  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15701  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.08 
 
 
504 aa  644    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.110948  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2809  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.78 
 
 
514 aa  638    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0629727  normal  0.24519 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2829  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.6 
 
 
502 aa  663    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0663  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.75 
 
 
520 aa  639    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0131395  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3205  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.78 
 
 
514 aa  638    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1871  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.4 
 
 
505 aa  642    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.798226  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0519  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.18 
 
 
501 aa  652    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3738  F0F1 ATP synthase subunit alpha  70 
 
 
502 aa  731    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2584  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.43 
 
 
505 aa  661    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.341955  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1620  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.98 
 
 
504 aa  648    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0802007  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1734  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.42 
 
 
509 aa  649    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0292  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.55 
 
 
507 aa  645    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1527  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.6 
 
 
505 aa  662    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000683533  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0604  F0F1 ATP synthase subunit alpha  67.6 
 
 
502 aa  711    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1505  F0F1 ATP synthase subunit alpha  67.6 
 
 
502 aa  711    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.56305  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>