More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2606 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0111  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.75 
 
 		 503 aa  634    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2606  F0F1 ATP synthase subunit alpha  100 
 
 		 506 aa  1031    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3827  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.12 
 
 		 502 aa  640    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5432  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.92 
 
 		 502 aa  638    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3152  ATP synthase F1, alpha subunit  66.87 
 
 		 501 aa  682    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5157  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.92 
 
 		 502 aa  638    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4990  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.92 
 
 		 502 aa  638    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5007  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.92 
 
 		 502 aa  638    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.95 
 
 		 503 aa  659    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.244084  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17820  ATP synthase F1, alpha subunit  68.06 
 
 		 541 aa  721    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1426  ATP synthase F1, alpha subunit  67.2 
 
 		 507 aa  719    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0292  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.11 
 
 		 507 aa  645    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2759  ATP synthase F1, alpha subunit  61.55 
 
 		 502 aa  646    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0327  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.91 
 
 		 507 aa  643    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4167  F0F1 ATP synthase subunit alpha  67.07 
 
 		 501 aa  692    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.804654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5485  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.92 
 
 		 502 aa  638    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.184326  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3408  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.55 
 
 		 503 aa  637    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.14914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5549  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.92 
 
 		 502 aa  638    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.31478  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0336  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.55 
 
 		 505 aa  638    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.120732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1492  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.96 
 
 		 505 aa  635    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0642798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2846  ATP synthase F1, alpha subunit  61.51 
 
 		 508 aa  639    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.525611 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2380  ATP synthase F1, alpha subunit  67.07 
 
 		 507 aa  702    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0176105 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5105  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.71 
 
 		 502 aa  637    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0081  ATP synthase F1, alpha subunit  65.67 
 
 		 507 aa  664    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4793  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.74 
 
 		 502 aa  680    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3305  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.15 
 
 		 502 aa  651    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.694138  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3417  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.15 
 
 		 502 aa  652    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2139  ATP synthase F1, alpha subunit  64.74 
 
 		 507 aa  660    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1275  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.95 
 
 		 503 aa  659    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.588856  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3738  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.67 
 
 		 502 aa  689    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2454  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.54 
 
 		 502 aa  673    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2164  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.54 
 
 		 502 aa  674    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0270  F0F1 ATP synthase subunit alpha  74.1 
 
 		 505 aa  795    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2384  Sodium-transporting two-sector ATPase  63.15 
 
 		 504 aa  649    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5522  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.92 
 
 		 502 aa  638    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000300598  hitchhiker  0.0000000000000322299 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1240  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.46 
 
 		 506 aa  636    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0065  ATP synthase F1, alpha subunit  63.47 
 
 		 508 aa  651    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5429  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.71 
 
 		 502 aa  636    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.099904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5398  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.92 
 
 		 502 aa  638    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2629899999999999e-45 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1711  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.99 
 
 		 503 aa  633  1e-180  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2332  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.93 
 
 		 526 aa  632  1e-180  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1463  ATP synthase F1, alpha subunit  61.3 
 
 		 509 aa  629  1e-179  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.298107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.58 
 
 		 502 aa  630  1e-179  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4261  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.08 
 
 		 502 aa  629  1e-179  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00501837  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3172  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.08 
 
 		 502 aa  630  1e-179  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0844597  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2141  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.58 
 
 		 502 aa  630  1e-179  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.588965  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1527  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.12 
 
 		 505 aa  628  1e-179  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000683533  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.62 
 
 		 526 aa  629  1e-179  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1519  ATP synthase F1, alpha subunit  59.8 
 
 		 512 aa  627  1e-178  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.283334  hitchhiker  0.000000000000106657 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2611  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.52 
 
 		 506 aa  627  1e-178  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.169882  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0861  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.6 
 
 		 501 aa  623  1e-177  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0205389  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3383  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.88 
 
 		 503 aa  621  1e-177  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0111242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2619  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.48 
 
 		 503 aa  624  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1985  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.23 
 
 		 526 aa  622  1e-177  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.25217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_501  ATP synthase F1, alpha subunit  60.52 
 
 		 503 aa  622  1e-177  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0562093  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2720  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.88 
 
 		 503 aa  621  1e-177  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0297  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.99 
 
 		 526 aa  621  1e-177  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.204325 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3364  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.65 
 
 		 502 aa  622  1e-177  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.677346  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0262  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.8 
 
 		 526 aa  621  1e-177  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0489814 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2199  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.56 
 
 		 505 aa  621  1e-177  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.539772 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0519  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.8 
 
 		 501 aa  624  1e-177  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0604  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.28 
 
 		 502 aa  624  1e-177  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1505  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.28 
 
 		 502 aa  624  1e-177  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.56305  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0562  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.52 
 
 		 503 aa  620  1e-176  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.529195  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0947  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.88 
 
 		 502 aa  620  1e-176  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3133  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.88 
 
 		 502 aa  620  1e-176  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3338  ATP synthase F1 subunit alpha  61.11 
 
 		 506 aa  616  1e-175  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2829  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.56 
 
 		 502 aa  615  1e-175  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3952  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.48 
 
 		 502 aa  617  1e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.116029  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4037  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.28 
 
 		 502 aa  615  1e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00278502 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0685  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.28 
 
 		 505 aa  616  1e-175  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.17328  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2584  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61 
 
 		 505 aa  616  1e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.341955  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2193  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.48 
 
 		 502 aa  617  1e-175  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1014  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.76 
 
 		 502 aa  612  9.999999999999999e-175  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000116673  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1468  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.04 
 
 		 509 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.184879 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1746  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.04 
 
 		 509 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal  0.129066 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0605  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.92 
 
 		 510 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.404784  normal  0.651766 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2078  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.14 
 
 		 509 aa  612  9.999999999999999e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.368934 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0193  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.56 
 
 		 501 aa  612  9.999999999999999e-175  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0287666  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16301  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.52 
 
 		 505 aa  612  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1620  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.52 
 
 		 504 aa  613  9.999999999999999e-175  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0802007  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0987  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.88 
 
 		 502 aa  614  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975811  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.33 
 
 		 505 aa  612  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0465  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.4 
 
 		 509 aa  613  9.999999999999999e-175  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.809021  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0176  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.41 
 
 		 510 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2705  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.45 
 
 		 526 aa  612  9.999999999999999e-175  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0536  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.92 
 
 		 503 aa  614  9.999999999999999e-175  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.19649  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15701  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.57 
 
 		 504 aa  613  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.110948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1043  ATP synthase F1, alpha subunit  58.64 
 
 		 522 aa  613  9.999999999999999e-175  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.890996  normal  0.113061 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0663  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.88 
 
 		 520 aa  612  9.999999999999999e-175  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0131395  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16411  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.33 
 
 		 505 aa  608  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0201  ATP synthase F1, alpha subunit  60.88 
 
 		 501 aa  611  1e-173  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.406681  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1027  ATP synthase F1, alpha subunit  61.07 
 
 		 501 aa  610  1e-173  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0557  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.82 
 
 		 510 aa  609  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.114224 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16531  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.33 
 
 		 505 aa  609  1e-173  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.592214  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0341  ATP synthase F1, alpha subunit  59.14 
 
 		 509 aa  610  1e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00762672 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1871  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.64 
 
 		 505 aa  611  1e-173  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.798226  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1467  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.14 
 
 		 509 aa  610  1e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0981  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.76 
 
 		 504 aa  606  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0267  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.63 
 
 		 510 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.686525 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>