More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0514 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_3152  ATP synthase F1, alpha subunit  62.62 
 
 		 501 aa  642    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0562  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.69 
 
 		 503 aa  638    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.529195  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4070  F0F1 ATP synthase subunit alpha  69.41 
 
 		 517 aa  726    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0283869  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0987  F0F1 ATP synthase subunit alpha  80.31 
 
 		 522 aa  860    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.746829 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0081  ATP synthase F1, alpha subunit  63.96 
 
 		 507 aa  655    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3738  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.79 
 
 		 502 aa  669    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4793  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.8 
 
 		 502 aa  636    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.1 
 
 		 503 aa  638    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.244084  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1426  ATP synthase F1, alpha subunit  64.69 
 
 		 507 aa  646    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4167  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.91 
 
 		 501 aa  651    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.804654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0065  ATP synthase F1, alpha subunit  67.31 
 
 		 508 aa  695    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2380  ATP synthase F1, alpha subunit  63.76 
 
 		 507 aa  651    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0176105 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17820  ATP synthase F1, alpha subunit  63.56 
 
 		 541 aa  644    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1275  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.1 
 
 		 503 aa  638    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.588856  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0514  F0F1 ATP synthase subunit alpha  100 
 
 		 527 aa  1060    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.709885  normal  0.673527 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2454  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.8 
 
 		 502 aa  637    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2164  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.6 
 
 		 502 aa  635    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1267  F0F1 ATP synthase subunit alpha  95.79 
 
 		 526 aa  1020    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.793474  normal  0.559767 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_501  ATP synthase F1, alpha subunit  63.08 
 
 		 503 aa  634  1e-180  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0562093  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2139  ATP synthase F1, alpha subunit  61.93 
 
 		 507 aa  630  1e-179  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0536  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.88 
 
 		 503 aa  631  1e-179  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.19649  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2384  Sodium-transporting two-sector ATPase  64.67 
 
 		 504 aa  629  1e-179  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0327  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.68 
 
 		 507 aa  622  1e-177  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0111  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.08 
 
 		 503 aa  620  1e-176  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0292  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.43 
 
 		 507 aa  619  1e-176  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15701  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.55 
 
 		 504 aa  620  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.110948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4261  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.85 
 
 		 502 aa  619  1e-176  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00501837  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0947  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.4 
 
 		 502 aa  615  1e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3133  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.4 
 
 		 502 aa  615  1e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3408  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.54 
 
 		 503 aa  615  1e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.14914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2619  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.08 
 
 		 503 aa  616  1e-175  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0915  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.12 
 
 		 505 aa  614  1e-175  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0383852  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1620  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.51 
 
 		 504 aa  615  1e-175  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0802007  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2584  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.63 
 
 		 505 aa  616  1e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.341955  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1527  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.56 
 
 		 505 aa  615  1e-175  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000683533  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3172  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.22 
 
 		 502 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0844597  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1492  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.65 
 
 		 505 aa  612  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0642798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0747  ATP synthase F1, alpha subunit  60.25 
 
 		 504 aa  613  9.999999999999999e-175  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.873736  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.35 
 
 		 505 aa  614  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16301  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.35 
 
 		 505 aa  614  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1736  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.12 
 
 		 505 aa  612  9.999999999999999e-175  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4334  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.92 
 
 		 512 aa  612  9.999999999999999e-175  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00117083  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0685  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.12 
 
 		 505 aa  611  9.999999999999999e-175  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.17328  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16411  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.19 
 
 		 505 aa  610  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2846  ATP synthase F1, alpha subunit  58.38 
 
 		 508 aa  609  1e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.525611 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12070  ATP synthase F1 subcomplex alpha subunit  60.04 
 
 		 524 aa  611  1e-173  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3055  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.41 
 
 		 517 aa  608  1e-173  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3952  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.41 
 
 		 502 aa  610  1e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.116029  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2759  ATP synthase F1, alpha subunit  60.46 
 
 		 502 aa  611  1e-173  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3496  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.06 
 
 		 513 aa  608  1e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.225453  normal  0.438236 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4037  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.22 
 
 		 502 aa  608  1e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00278502 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16531  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.19 
 
 		 505 aa  610  1e-173  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.592214  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0604  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.3 
 
 		 502 aa  610  1e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1505  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.3 
 
 		 502 aa  610  1e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.56305  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2720  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.29 
 
 		 503 aa  606  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3383  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.29 
 
 		 503 aa  606  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0111242  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2912  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.22 
 
 		 517 aa  607  9.999999999999999e-173  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0981  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.53 
 
 		 504 aa  607  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0336  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.61 
 
 		 505 aa  606  9.999999999999999e-173  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.120732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0108  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.08 
 
 		 517 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0072301  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18491  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.53 
 
 		 504 aa  602  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.983268 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0193  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.12 
 
 		 501 aa  602  1.0000000000000001e-171  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0287666  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21420  ATP synthase F1 subcomplex alpha subunit  57.72 
 
 		 520 aa  601  1.0000000000000001e-171  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2332  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.4 
 
 		 526 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2199  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.92 
 
 		 505 aa  602  1.0000000000000001e-171  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.539772 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0418  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.3 
 
 		 517 aa  603  1.0000000000000001e-171  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0213  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.41 
 
 		 514 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1679  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.05 
 
 		 510 aa  602  1.0000000000000001e-171  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.536422  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.21 
 
 		 526 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3970  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.77 
 
 		 513 aa  598  1e-170  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03111  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.52 
 
 		 515 aa  600  1e-170  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4044  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.77 
 
 		 513 aa  598  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0181  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.77 
 
 		 513 aa  598  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0488  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.66 
 
 		 506 aa  600  1e-170  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.294002  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0308  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.2 
 
 		 513 aa  598  1e-170  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0176346  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3029  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.96 
 
 		 513 aa  600  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0601  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.2 
 
 		 505 aa  598  1e-170  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00209636  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0621  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.28 
 
 		 509 aa  596  1e-169  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.953551 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0270  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.91 
 
 		 505 aa  595  1e-169  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2955  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.57 
 
 		 513 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.103528  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3013  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.57 
 
 		 513 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4872  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.42 
 
 		 517 aa  595  1e-169  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0195  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.22 
 
 		 517 aa  596  1e-169  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3896  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.38 
 
 		 513 aa  597  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.606313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3310  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.57 
 
 		 513 aa  597  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145544  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2746  ATP synthase F1, alpha subunit  57.04 
 
 		 513 aa  597  1e-169  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.426504  normal  0.209432 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0038  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.57 
 
 		 513 aa  598  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.266333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3528  ATP synthase F1, alpha subunit  59.81 
 
 		 512 aa  597  1e-169  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0251899 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2286  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.01 
 
 		 509 aa  595  1e-169  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3357  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.57 
 
 		 513 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4740  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.08 
 
 		 510 aa  597  1e-169  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.408023  hitchhiker  0.00635659 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2432  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.85 
 
 		 513 aa  598  1e-169  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.183567  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0104  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.45 
 
 		 513 aa  595  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0331113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1589  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.57 
 
 		 513 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.10033  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0104  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.45 
 
 		 513 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3307  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.05 
 
 		 513 aa  594  1e-168  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.48962  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3205  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.39 
 
 		 514 aa  594  1e-168  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3968  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.6 
 
 		 513 aa  594  1e-168  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00212226  normal  0.363418 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0426  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.85 
 
 		 515 aa  594  1e-168  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.077185  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0104  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.26 
 
 		 513 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.679281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>