More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2139 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_4261  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.6 
 
 
502 aa  672    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00501837  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0270  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.15 
 
 
505 aa  645    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0562  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.35 
 
 
503 aa  655    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.529195  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0111  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.07 
 
 
503 aa  664    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18491  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.57 
 
 
504 aa  639    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.983268 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1711  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.4 
 
 
503 aa  665    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3952  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.2 
 
 
502 aa  646    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.116029  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0065  ATP synthase F1, alpha subunit  68.25 
 
 
508 aa  702    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5432  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.87 
 
 
502 aa  667    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3417  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.87 
 
 
502 aa  678    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4037  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.2 
 
 
502 aa  646    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00278502 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2186  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.4 
 
 
502 aa  634    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5157  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.87 
 
 
502 aa  667    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4990  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.87 
 
 
502 aa  667    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5007  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.87 
 
 
502 aa  667    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2332  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.09 
 
 
526 aa  646    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0262  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.51 
 
 
526 aa  649    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0489814 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2139  ATP synthase F1, alpha subunit  100 
 
 
507 aa  1028    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4167  F0F1 ATP synthase subunit alpha  75 
 
 
501 aa  785    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.804654  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0981  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.77 
 
 
504 aa  639    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2606  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.74 
 
 
506 aa  660    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2720  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.8 
 
 
503 aa  653    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3738  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.74 
 
 
502 aa  685    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2611  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.4 
 
 
506 aa  639    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.169882  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3172  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.8 
 
 
502 aa  661    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0844597  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1275  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.27 
 
 
503 aa  688    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.588856  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5485  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.87 
 
 
502 aa  667    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.184326  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0947  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.4 
 
 
502 aa  651    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3133  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.4 
 
 
502 aa  651    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5522  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.87 
 
 
502 aa  667    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000300598  hitchhiker  0.0000000000000322299 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1985  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.7 
 
 
526 aa  639    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.25217  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0174  ATP synthase F1, alpha subunit  61.2 
 
 
503 aa  639    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.168157  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3408  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.07 
 
 
503 aa  664    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.14914  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0987  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.28 
 
 
502 aa  657    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975811  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5549  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.87 
 
 
502 aa  667    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.31478  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2214  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.6 
 
 
504 aa  645    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.188551  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.97 
 
 
505 aa  643    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0336  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.05 
 
 
505 aa  652    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.120732  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3305  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.28 
 
 
502 aa  672    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.694138  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.27 
 
 
503 aa  688    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.244084  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2380  ATP synthase F1, alpha subunit  71.66 
 
 
507 aa  744    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0176105 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0513  ATP synthase F1, alpha subunit  62.08 
 
 
501 aa  645    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4793  F0F1 ATP synthase subunit alpha  71.26 
 
 
502 aa  747    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5429  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.07 
 
 
502 aa  669    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.099904  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0536  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.35 
 
 
503 aa  650    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.19649  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16301  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.77 
 
 
505 aa  642    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0292  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.44 
 
 
507 aa  665    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1492  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.07 
 
 
505 aa  657    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0642798  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2829  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.2 
 
 
502 aa  642    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65 
 
 
502 aa  659    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0465  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.8 
 
 
509 aa  639    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.809021  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3383  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.8 
 
 
503 aa  653    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0111242  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5398  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.87 
 
 
502 aa  667    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2629899999999999e-45 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1014  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.88 
 
 
502 aa  642    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000116673  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1519  ATP synthase F1, alpha subunit  59.25 
 
 
512 aa  645    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.283334  hitchhiker  0.000000000000106657 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4334  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.68 
 
 
512 aa  642    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00117083  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1426  ATP synthase F1, alpha subunit  66.6 
 
 
507 aa  699    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2846  ATP synthase F1, alpha subunit  63.71 
 
 
508 aa  672    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.525611 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3827  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.07 
 
 
502 aa  672    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2759  ATP synthase F1, alpha subunit  63.87 
 
 
502 aa  665    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3364  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.6 
 
 
502 aa  638    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.677346  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0327  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.85 
 
 
507 aa  662    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0081  ATP synthase F1, alpha subunit  83.63 
 
 
507 aa  870    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2454  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.07 
 
 
502 aa  685    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2164  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.07 
 
 
502 aa  686    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2199  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.08 
 
 
505 aa  642    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.539772 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0297  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.15 
 
 
526 aa  642    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.204325 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16411  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.77 
 
 
505 aa  643    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5105  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.87 
 
 
502 aa  667    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6064  ATP synthase F1, alpha subunit  61.11 
 
 
512 aa  641    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2384  Sodium-transporting two-sector ATPase  69.52 
 
 
504 aa  732    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0201  ATP synthase F1, alpha subunit  61.4 
 
 
501 aa  638    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.406681  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17820  ATP synthase F1, alpha subunit  69.06 
 
 
541 aa  717    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2619  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.07 
 
 
503 aa  659    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1240  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.6 
 
 
506 aa  645    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_501  ATP synthase F1, alpha subunit  62.75 
 
 
503 aa  658    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0562093  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2584  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66 
 
 
505 aa  681    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.341955  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15701  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.17 
 
 
504 aa  642    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.110948  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2141  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65 
 
 
502 aa  659    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.588965  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0604  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.2 
 
 
502 aa  672    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1505  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.2 
 
 
502 aa  672    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.56305  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.12 
 
 
526 aa  644    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3152  ATP synthase F1, alpha subunit  74.6 
 
 
501 aa  780    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2193  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.6 
 
 
502 aa  648    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16531  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.77 
 
 
505 aa  642    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.592214  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1027  ATP synthase F1, alpha subunit  62.48 
 
 
501 aa  632  1e-180  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0601  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.2 
 
 
505 aa  631  1e-180  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00209636  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1620  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.05 
 
 
504 aa  631  1e-180  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0802007  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0685  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.84 
 
 
505 aa  632  1e-180  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.17328  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1527  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.8 
 
 
505 aa  634  1e-180  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000683533  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1736  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.72 
 
 
505 aa  633  1e-180  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0747  ATP synthase F1, alpha subunit  60.71 
 
 
504 aa  634  1e-180  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.873736  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2705  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.35 
 
 
526 aa  631  1e-179  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1463  ATP synthase F1, alpha subunit  61.02 
 
 
509 aa  630  1e-179  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.298107  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04831  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.37 
 
 
505 aa  628  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0514  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.93 
 
 
527 aa  630  1e-179  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.709885  normal  0.673527 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0488  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.28 
 
 
506 aa  630  1e-179  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.294002  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0915  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.52 
 
 
505 aa  631  1e-179  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0383852  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0519  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.37 
 
 
501 aa  629  1e-179  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0193  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.17 
 
 
501 aa  628  1e-179  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0287666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>