More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0174 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_16411  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.16 
 
 
505 aa  636    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0981  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.98 
 
 
504 aa  641    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2139  ATP synthase F1, alpha subunit  61.2 
 
 
507 aa  639    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0947  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.16 
 
 
502 aa  635    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3133  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.16 
 
 
502 aa  635    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.57 
 
 
505 aa  637    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0336  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.29 
 
 
505 aa  646    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.120732  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0327  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.68 
 
 
507 aa  637    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18491  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.57 
 
 
504 aa  636    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.983268 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16531  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.96 
 
 
505 aa  635    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.592214  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3305  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.2 
 
 
502 aa  637    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.694138  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3417  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.4 
 
 
502 aa  642    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0174  ATP synthase F1, alpha subunit  100 
 
 
503 aa  1014    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.168157  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0519  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.23 
 
 
501 aa  635    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2584  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.11 
 
 
505 aa  640    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.341955  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0604  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60 
 
 
502 aa  634    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1505  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60 
 
 
502 aa  634    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.56305  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17820  ATP synthase F1, alpha subunit  59.52 
 
 
541 aa  644    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.16 
 
 
503 aa  631  1e-180  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.244084  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2380  ATP synthase F1, alpha subunit  60.48 
 
 
507 aa  632  1e-180  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0176105 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5429  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.84 
 
 
502 aa  632  1e-180  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.099904  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1275  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.16 
 
 
503 aa  631  1e-180  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.588856  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16301  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.96 
 
 
505 aa  633  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0065  ATP synthase F1, alpha subunit  60.64 
 
 
508 aa  631  1e-180  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0685  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.76 
 
 
505 aa  629  1e-179  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.17328  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3172  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.8 
 
 
502 aa  629  1e-179  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0844597  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5432  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.64 
 
 
502 aa  630  1e-179  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5157  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.64 
 
 
502 aa  630  1e-179  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4990  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.64 
 
 
502 aa  630  1e-179  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5007  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.64 
 
 
502 aa  630  1e-179  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0081  ATP synthase F1, alpha subunit  59.48 
 
 
507 aa  628  1e-179  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2619  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.22 
 
 
503 aa  629  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2759  ATP synthase F1, alpha subunit  59.96 
 
 
502 aa  629  1e-179  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5522  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.64 
 
 
502 aa  630  1e-179  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000300598  hitchhiker  0.0000000000000322299 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2611  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.9 
 
 
506 aa  631  1e-179  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.169882  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1014  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.36 
 
 
502 aa  628  1e-179  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000116673  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5398  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.64 
 
 
502 aa  630  1e-179  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2629899999999999e-45 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0987  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.2 
 
 
502 aa  629  1e-179  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975811  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5549  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.64 
 
 
502 aa  630  1e-179  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.31478  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5105  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.64 
 
 
502 aa  630  1e-179  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3952  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.4 
 
 
502 aa  628  1e-179  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.116029  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6064  ATP synthase F1, alpha subunit  59.76 
 
 
512 aa  628  1e-179  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5485  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.64 
 
 
502 aa  630  1e-179  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.184326  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4037  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.4 
 
 
502 aa  628  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00278502 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3827  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.44 
 
 
502 aa  630  1e-179  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0193  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.56 
 
 
501 aa  625  1e-178  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0287666  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0292  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.08 
 
 
507 aa  626  1e-178  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4793  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.2 
 
 
502 aa  625  1e-178  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4167  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59 
 
 
501 aa  627  1e-178  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.804654  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2193  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.48 
 
 
502 aa  624  1e-177  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2214  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.48 
 
 
504 aa  623  1e-177  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.188551  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2186  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.2 
 
 
502 aa  624  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3338  ATP synthase F1 subunit alpha  60.48 
 
 
506 aa  622  1e-177  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4261  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.8 
 
 
502 aa  621  1e-177  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00501837  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2720  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.21 
 
 
503 aa  622  1e-177  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2846  ATP synthase F1, alpha subunit  59.28 
 
 
508 aa  623  1e-177  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.525611 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0513  ATP synthase F1, alpha subunit  59.08 
 
 
501 aa  621  1e-177  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1978  ATP synthase F1, alpha subunit  62.67 
 
 
499 aa  622  1e-177  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3383  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.21 
 
 
503 aa  622  1e-177  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0111242  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0111  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.48 
 
 
503 aa  619  1e-176  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0861  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.84 
 
 
501 aa  620  1e-176  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0205389  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15701  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.79 
 
 
504 aa  620  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.110948  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3152  ATP synthase F1, alpha subunit  59.4 
 
 
501 aa  620  1e-176  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3408  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.68 
 
 
503 aa  619  1e-176  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.14914  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0201  ATP synthase F1, alpha subunit  59.08 
 
 
501 aa  619  1e-176  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.406681  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0488  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.82 
 
 
506 aa  616  1e-175  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.294002  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2400  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.86 
 
 
509 aa  617  1e-175  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4334  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.12 
 
 
512 aa  615  1e-175  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00117083  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2829  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.08 
 
 
502 aa  617  1e-175  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1240  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.4 
 
 
506 aa  617  1e-175  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1527  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.6 
 
 
505 aa  615  1e-175  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000683533  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0915  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.92 
 
 
505 aa  613  9.999999999999999e-175  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0383852  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_501  ATP synthase F1, alpha subunit  60.12 
 
 
503 aa  612  9.999999999999999e-175  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0562093  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2188  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.62 
 
 
506 aa  612  9.999999999999999e-175  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.929468 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3364  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.49 
 
 
502 aa  611  9.999999999999999e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.677346  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4350  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.76 
 
 
510 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0621  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.06 
 
 
509 aa  613  9.999999999999999e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.953551 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0601  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.28 
 
 
505 aa  614  9.999999999999999e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00209636  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12070  ATP synthase F1 subcomplex alpha subunit  58.03 
 
 
524 aa  612  9.999999999999999e-175  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4497  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.79 
 
 
512 aa  611  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.694909  normal  0.0411828 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4505  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.17 
 
 
510 aa  611  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1519  ATP synthase F1, alpha subunit  57.6 
 
 
512 aa  614  9.999999999999999e-175  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.283334  hitchhiker  0.000000000000106657 
 
 
-
 
NC_002936  DET0562  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.92 
 
 
503 aa  609  1e-173  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.529195  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1711  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58 
 
 
503 aa  610  1e-173  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0536  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.32 
 
 
503 aa  610  1e-173  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.19649  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0100  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.35 
 
 
501 aa  608  1e-173  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1492  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.4 
 
 
505 aa  610  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0642798  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04831  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.35 
 
 
505 aa  610  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1463  ATP synthase F1, alpha subunit  58.86 
 
 
509 aa  610  1e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.298107  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1736  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.52 
 
 
505 aa  609  1e-173  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1426  ATP synthase F1, alpha subunit  59.68 
 
 
507 aa  608  1e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21420  ATP synthase F1 subcomplex alpha subunit  57.56 
 
 
520 aa  608  1e-173  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4486  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.37 
 
 
510 aa  610  1e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2454  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.2 
 
 
502 aa  609  1e-173  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2164  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.2 
 
 
502 aa  610  1e-173  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1935  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.24 
 
 
500 aa  610  1e-173  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1043  ATP synthase F1, alpha subunit  57.45 
 
 
522 aa  610  1e-173  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.890996  normal  0.113061 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0297  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.78 
 
 
526 aa  607  9.999999999999999e-173  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.204325 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0112  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.15 
 
 
501 aa  607  9.999999999999999e-173  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0295232  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2141  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.8 
 
 
502 aa  607  9.999999999999999e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.588965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>