More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1240 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2759  ATP synthase F1, alpha subunit  63.8 
 
 
502 aa  660    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6064  ATP synthase F1, alpha subunit  61.22 
 
 
512 aa  644    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0111  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.55 
 
 
503 aa  645    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1711  F0F1 ATP synthase subunit alpha  70.38 
 
 
503 aa  740    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17820  ATP synthase F1, alpha subunit  65.15 
 
 
541 aa  684    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5432  F0F1 ATP synthase subunit alpha  75.1 
 
 
502 aa  774    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0861  F0F1 ATP synthase subunit alpha  75.81 
 
 
501 aa  787    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0205389  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5157  F0F1 ATP synthase subunit alpha  75.1 
 
 
502 aa  774    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4990  F0F1 ATP synthase subunit alpha  75.1 
 
 
502 aa  774    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5007  F0F1 ATP synthase subunit alpha  75.1 
 
 
502 aa  774    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0270  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.11 
 
 
505 aa  635    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2141  F0F1 ATP synthase subunit alpha  71.71 
 
 
502 aa  746    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.588965  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0065  ATP synthase F1, alpha subunit  63.07 
 
 
508 aa  651    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2606  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.46 
 
 
506 aa  636    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3417  F0F1 ATP synthase subunit alpha  73.51 
 
 
502 aa  769    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  71.71 
 
 
502 aa  746    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0685  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.2 
 
 
505 aa  646    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.17328  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0947  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.27 
 
 
502 aa  664    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3133  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.27 
 
 
502 aa  664    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5485  F0F1 ATP synthase subunit alpha  75.1 
 
 
502 aa  774    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.184326  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3408  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.15 
 
 
503 aa  640    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.14914  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5549  F0F1 ATP synthase subunit alpha  75.1 
 
 
502 aa  774    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.31478  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5398  F0F1 ATP synthase subunit alpha  75.1 
 
 
502 aa  774    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2629899999999999e-45 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2139  ATP synthase F1, alpha subunit  62.6 
 
 
507 aa  645    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2380  ATP synthase F1, alpha subunit  64.74 
 
 
507 aa  662    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0176105 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4037  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.88 
 
 
502 aa  639    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00278502 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3172  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.08 
 
 
502 aa  641    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0844597  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1736  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.68 
 
 
505 aa  640    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4793  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.6 
 
 
502 aa  698    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2846  ATP synthase F1, alpha subunit  60.79 
 
 
508 aa  646    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.525611 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4167  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.87 
 
 
501 aa  665    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.804654  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1426  ATP synthase F1, alpha subunit  63.51 
 
 
507 aa  658    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0081  ATP synthase F1, alpha subunit  62.15 
 
 
507 aa  650    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3152  ATP synthase F1, alpha subunit  65.07 
 
 
501 aa  672    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3952  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.88 
 
 
502 aa  639    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.116029  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3827  F0F1 ATP synthase subunit alpha  75.1 
 
 
502 aa  778    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5429  F0F1 ATP synthase subunit alpha  75.3 
 
 
502 aa  776    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.099904  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0465  F0F1 ATP synthase subunit alpha  75.15 
 
 
509 aa  783    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.809021  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5105  F0F1 ATP synthase subunit alpha  75.3 
 
 
502 aa  775    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5522  F0F1 ATP synthase subunit alpha  75.1 
 
 
502 aa  775    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000300598  hitchhiker  0.0000000000000322299 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1935  F0F1 ATP synthase subunit alpha  76.32 
 
 
500 aa  772    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0663  F0F1 ATP synthase subunit alpha  72.37 
 
 
520 aa  761    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0131395  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1240  F0F1 ATP synthase subunit alpha  100 
 
 
506 aa  1021    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1871  F0F1 ATP synthase subunit alpha  77.09 
 
 
505 aa  804    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.798226  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0519  F0F1 ATP synthase subunit alpha  76.41 
 
 
501 aa  790    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0915  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.32 
 
 
505 aa  637    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0383852  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3305  F0F1 ATP synthase subunit alpha  72.91 
 
 
502 aa  766    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.694138  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1527  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.88 
 
 
505 aa  644    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000683533  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0604  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.48 
 
 
502 aa  644    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1505  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.48 
 
 
502 aa  644    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.56305  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4261  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.48 
 
 
502 aa  650    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00501837  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1275  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.24 
 
 
503 aa  634  1e-180  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.588856  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3738  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.68 
 
 
502 aa  632  1e-180  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0327  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.82 
 
 
507 aa  632  1e-180  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2193  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.6 
 
 
502 aa  633  1e-180  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.24 
 
 
503 aa  634  1e-180  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.244084  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2454  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.8 
 
 
502 aa  633  1e-180  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2164  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.6 
 
 
502 aa  632  1e-180  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2384  Sodium-transporting two-sector ATPase  60.52 
 
 
504 aa  633  1e-180  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0513  ATP synthase F1, alpha subunit  60 
 
 
501 aa  630  1e-179  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1519  ATP synthase F1, alpha subunit  58.78 
 
 
512 aa  625  1e-178  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.283334  hitchhiker  0.000000000000106657 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3383  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.96 
 
 
503 aa  622  1e-177  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0111242  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2720  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.96 
 
 
503 aa  622  1e-177  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0987  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.48 
 
 
502 aa  624  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975811  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3364  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61 
 
 
502 aa  622  1e-177  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.677346  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16531  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.35 
 
 
505 aa  621  1e-177  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.592214  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0193  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.76 
 
 
501 aa  622  1e-177  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0287666  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16411  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.35 
 
 
505 aa  620  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0292  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.88 
 
 
507 aa  619  1e-176  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2186  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.08 
 
 
502 aa  619  1e-176  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1014  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.22 
 
 
502 aa  618  1e-176  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000116673  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4334  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.64 
 
 
512 aa  621  1e-176  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00117083  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2829  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.8 
 
 
502 aa  618  1e-176  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2619  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.28 
 
 
503 aa  620  1e-176  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0140  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.96 
 
 
501 aa  615  1e-175  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.241383  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0100  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.96 
 
 
501 aa  615  1e-175  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16301  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.03 
 
 
505 aa  616  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2214  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.6 
 
 
504 aa  615  1e-175  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.188551  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.15 
 
 
505 aa  615  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0174  ATP synthase F1, alpha subunit  59.4 
 
 
503 aa  617  1e-175  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.168157  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0112  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.76 
 
 
501 aa  615  1e-175  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0295232  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2584  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.32 
 
 
505 aa  616  1e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.341955  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2611  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.68 
 
 
506 aa  612  9.999999999999999e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.169882  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1492  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.2 
 
 
505 aa  612  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0642798  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2400  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.12 
 
 
509 aa  612  9.999999999999999e-175  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2199  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.85 
 
 
505 aa  613  9.999999999999999e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.539772 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1043  ATP synthase F1, alpha subunit  58.22 
 
 
522 aa  610  1e-173  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.890996  normal  0.113061 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0981  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.62 
 
 
504 aa  610  1e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0336  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.63 
 
 
505 aa  610  1e-173  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.120732  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11335  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.17 
 
 
549 aa  608  1e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18491  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.82 
 
 
504 aa  609  1e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.983268 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_501  ATP synthase F1, alpha subunit  59.08 
 
 
503 aa  608  1e-173  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0562093  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0747  ATP synthase F1, alpha subunit  58.2 
 
 
504 aa  608  1e-173  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.873736  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12070  ATP synthase F1 subcomplex alpha subunit  57.97 
 
 
524 aa  608  1e-173  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4497  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.27 
 
 
512 aa  605  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.694909  normal  0.0411828 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0297  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.45 
 
 
526 aa  605  9.999999999999999e-173  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.204325 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15701  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.22 
 
 
504 aa  605  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.110948  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1640  ATP synthase F1, alpha subunit  58.5 
 
 
526 aa  607  9.999999999999999e-173  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0536  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.85 
 
 
503 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.19649  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1620  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.04 
 
 
504 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0802007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>