More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1640 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2759  ATP synthase F1, alpha subunit  63.69 
 
 
502 aa  649    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1492  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.97 
 
 
505 aa  642    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0642798  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.02 
 
 
503 aa  663    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.244084  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3152  ATP synthase F1, alpha subunit  64.74 
 
 
501 aa  664    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2846  ATP synthase F1, alpha subunit  61.83 
 
 
508 aa  643    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.525611 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0081  ATP synthase F1, alpha subunit  62.5 
 
 
507 aa  642    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4167  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.43 
 
 
501 aa  645    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.804654  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1275  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.02 
 
 
503 aa  663    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.588856  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0336  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.65 
 
 
505 aa  635    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.120732  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2380  ATP synthase F1, alpha subunit  63.64 
 
 
507 aa  654    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0176105 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3305  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.15 
 
 
502 aa  635    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.694138  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3738  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.03 
 
 
502 aa  650    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0065  ATP synthase F1, alpha subunit  63.91 
 
 
508 aa  654    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0292  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.22 
 
 
507 aa  654    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0747  ATP synthase F1, alpha subunit  60.64 
 
 
504 aa  635    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.873736  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0327  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.42 
 
 
507 aa  654    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4793  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.95 
 
 
502 aa  645    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15701  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.25 
 
 
504 aa  640    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.110948  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1640  ATP synthase F1, alpha subunit  100 
 
 
526 aa  1055    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17820  ATP synthase F1, alpha subunit  62.29 
 
 
541 aa  660    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2332  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.12 
 
 
526 aa  639    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2193  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.11 
 
 
502 aa  639    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1426  ATP synthase F1, alpha subunit  62.62 
 
 
507 aa  649    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1679  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.33 
 
 
510 aa  642    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.536422  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0270  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.44 
 
 
505 aa  631  1e-180  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0981  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.24 
 
 
504 aa  633  1e-180  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3417  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.15 
 
 
502 aa  634  1e-180  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18491  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.65 
 
 
504 aa  634  1e-180  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.983268 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0262  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.65 
 
 
526 aa  632  1e-180  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0489814 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2829  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.52 
 
 
502 aa  634  1e-180  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2286  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.37 
 
 
509 aa  633  1e-180  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2454  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.64 
 
 
502 aa  633  1e-180  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2164  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.64 
 
 
502 aa  634  1e-180  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1014  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.69 
 
 
502 aa  629  1e-179  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000116673  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2214  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.64 
 
 
504 aa  629  1e-179  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.188551  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16531  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.84 
 
 
505 aa  630  1e-179  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.592214  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0987  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.44 
 
 
502 aa  629  1e-179  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975811  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.92 
 
 
505 aa  630  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16411  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.84 
 
 
505 aa  630  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2619  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.99 
 
 
503 aa  630  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0297  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.08 
 
 
526 aa  630  1e-179  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.204325 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6064  ATP synthase F1, alpha subunit  61.75 
 
 
512 aa  625  1e-178  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0465  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.57 
 
 
509 aa  627  1e-178  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.809021  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0947  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.72 
 
 
502 aa  626  1e-178  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3133  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.72 
 
 
502 aa  626  1e-178  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1985  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.23 
 
 
526 aa  627  1e-178  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.25217  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0488  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.25 
 
 
506 aa  627  1e-178  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.294002  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2400  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.16 
 
 
509 aa  627  1e-178  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16301  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.72 
 
 
505 aa  627  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2384  Sodium-transporting two-sector ATPase  60.12 
 
 
504 aa  625  1e-178  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0685  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.32 
 
 
505 aa  627  1e-178  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.17328  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1527  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.43 
 
 
505 aa  627  1e-178  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000683533  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.46 
 
 
526 aa  627  1e-178  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1463  ATP synthase F1, alpha subunit  61.18 
 
 
509 aa  622  1e-177  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.298107  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0111  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.64 
 
 
503 aa  623  1e-177  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2720  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.6 
 
 
503 aa  624  1e-177  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3383  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.6 
 
 
503 aa  624  1e-177  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0111242  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2611  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.24 
 
 
506 aa  624  1e-177  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.169882  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2188  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.45 
 
 
506 aa  624  1e-177  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.929468 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4740  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.18 
 
 
510 aa  622  1e-177  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.408023  hitchhiker  0.00635659 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1467  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.37 
 
 
509 aa  621  1e-177  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2584  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.03 
 
 
505 aa  622  1e-177  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.341955  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0604  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.04 
 
 
502 aa  621  1e-177  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1505  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.04 
 
 
502 aa  621  1e-177  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.56305  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2705  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.27 
 
 
526 aa  620  1e-176  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_501  ATP synthase F1, alpha subunit  59.56 
 
 
503 aa  618  1e-176  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0562093  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12070  ATP synthase F1 subcomplex alpha subunit  59.34 
 
 
524 aa  621  1e-176  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0406  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.76 
 
 
509 aa  620  1e-176  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.102948 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0513  ATP synthase F1, alpha subunit  59.76 
 
 
501 aa  618  1e-176  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1746  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.37 
 
 
509 aa  620  1e-176  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal  0.129066 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0621  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.2 
 
 
509 aa  621  1e-176  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.953551 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2186  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.64 
 
 
502 aa  619  1e-176  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7382  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.76 
 
 
509 aa  618  1e-176  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187104  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1468  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.37 
 
 
509 aa  620  1e-176  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.184879 
 
 
-
 
NC_002936  DET0562  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.76 
 
 
503 aa  616  1e-175  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.529195  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0601  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.84 
 
 
505 aa  617  1e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00209636  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0140  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.12 
 
 
526 aa  616  1e-175  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1224  ATP synthase F1, alpha subunit  60.67 
 
 
510 aa  617  1e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2139  ATP synthase F1, alpha subunit  59.36 
 
 
507 aa  616  1e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3364  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.92 
 
 
502 aa  617  1e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.677346  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1519  ATP synthase F1, alpha subunit  56.95 
 
 
512 aa  615  1e-175  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.283334  hitchhiker  0.000000000000106657 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6637  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.37 
 
 
509 aa  615  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0712183 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0915  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.92 
 
 
505 aa  615  1e-175  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0383852  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0536  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.56 
 
 
503 aa  616  1e-175  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.19649  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0605  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.78 
 
 
510 aa  617  1e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.404784  normal  0.651766 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0173  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.86 
 
 
510 aa  614  1e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4261  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.96 
 
 
502 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00501837  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3827  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.76 
 
 
502 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5157  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.96 
 
 
502 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4990  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.96 
 
 
502 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3338  ATP synthase F1 subunit alpha  59.8 
 
 
506 aa  612  9.999999999999999e-175  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3408  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.24 
 
 
503 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.14914  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5549  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.96 
 
 
502 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.31478  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0557  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.47 
 
 
510 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.114224 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0532  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.69 
 
 
510 aa  612  9.999999999999999e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0220  ATP synthase F1, alpha subunit  60.08 
 
 
509 aa  612  9.999999999999999e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1103  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.39 
 
 
509 aa  612  9.999999999999999e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5429  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.76 
 
 
502 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.099904  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3172  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.16 
 
 
502 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0844597  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3205  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.25 
 
 
514 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>