More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3738 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009707  JJD26997_0112  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.57 
 
 		 501 aa  652    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0295232  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0418  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.66 
 
 		 517 aa  638    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0465  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.4 
 
 		 509 aa  638    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.809021  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0562  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.93 
 
 		 503 aa  675    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.529195  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0111  F0F1 ATP synthase subunit alpha  67.93 
 
 		 503 aa  713    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1679  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.31 
 
 		 510 aa  644    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.536422  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1711  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.87 
 
 		 503 aa  653    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0010  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.22 
 
 		 513 aa  641    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.768352  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3319  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.28 
 
 		 513 aa  642    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.162911  decreased coverage  0.00532822 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5432  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64 
 
 		 502 aa  647    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2432  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.52 
 
 		 513 aa  644    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.183567  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0100  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.97 
 
 		 501 aa  654    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3172  F0F1 ATP synthase subunit alpha  67.07 
 
 		 502 aa  706    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0844597  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0104  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.08 
 
 		 513 aa  641    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0331113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1589  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.89 
 
 		 513 aa  638    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.10033  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0253  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.66 
 
 		 517 aa  637    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.231665  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5157  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64 
 
 		 502 aa  647    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4990  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64 
 
 		 502 aa  647    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0915  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.25 
 
 		 505 aa  669    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0383852  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5007  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64 
 
 		 502 aa  647    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2955  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.89 
 
 		 513 aa  638    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.103528  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0104  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.69 
 
 		 513 aa  635    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3896  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.08 
 
 		 513 aa  644    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.606313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0621  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.83 
 
 		 509 aa  635    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.953551 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0685  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.33 
 
 		 505 aa  673    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.17328  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4112  ATP synthase F1, alpha subunit  60.08 
 
 		 512 aa  642    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000122055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2332  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.46 
 
 		 526 aa  650    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3348  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.67 
 
 		 513 aa  644    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2799  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.67 
 
 		 513 aa  651    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.47 
 
 		 502 aa  658    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2611  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.2 
 
 		 506 aa  651    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.169882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0181  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.08 
 
 		 513 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2141  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.47 
 
 		 502 aa  658    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.588965  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2193  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63 
 
 		 502 aa  669    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3970  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.08 
 
 		 513 aa  640    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0947  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.07 
 
 		 502 aa  693    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3133  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.07 
 
 		 502 aa  693    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3286  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.89 
 
 		 513 aa  637    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1985  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.69 
 
 		 526 aa  642    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.25217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0601  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.96 
 
 		 505 aa  651    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00209636  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0140  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.77 
 
 		 526 aa  634    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4740  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.28 
 
 		 510 aa  650    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.408023  hitchhiker  0.00635659 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3408  F0F1 ATP synthase subunit alpha  67.33 
 
 		 503 aa  710    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.14914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0987  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.67 
 
 		 502 aa  667    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975811  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5549  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64 
 
 		 502 aa  647    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.31478  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3029  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.67 
 
 		 513 aa  646    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3738  F0F1 ATP synthase subunit alpha  100 
 
 		 502 aa  1017    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0336  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.6 
 
 		 505 aa  654    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.120732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0308  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.3 
 
 		 513 aa  663    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0176346  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3152  ATP synthase F1, alpha subunit  69 
 
 		 501 aa  723    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4261  F0F1 ATP synthase subunit alpha  67.66 
 
 		 502 aa  715    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00501837  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2380  ATP synthase F1, alpha subunit  70.32 
 
 		 507 aa  742    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0176105 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3310  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.28 
 
 		 513 aa  640    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145544  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4350  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.07 
 
 		 510 aa  647    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0514  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.79 
 
 		 527 aa  669    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.709885  normal  0.673527 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2400  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.83 
 
 		 509 aa  639    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16411  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.8 
 
 		 505 aa  634    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0108  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.05 
 
 		 517 aa  647    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0072301  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3968  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.87 
 
 		 513 aa  638    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00212226  normal  0.363418 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3338  ATP synthase F1 subunit alpha  63 
 
 		 506 aa  649    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2746  ATP synthase F1, alpha subunit  62.6 
 
 		 513 aa  659    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.426504  normal  0.209432 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0292  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.43 
 
 		 507 aa  647    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0038  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.28 
 
 		 513 aa  645    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.266333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2606  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.67 
 
 		 506 aa  689    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1267  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.97 
 
 		 526 aa  653    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.793474  normal  0.559767 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.27 
 
 		 503 aa  662    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.244084  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3827  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.8 
 
 		 502 aa  651    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4044  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.08 
 
 		 513 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3496  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.08 
 
 		 513 aa  658    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.225453  normal  0.438236 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4334  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.12 
 
 		 512 aa  648    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00117083  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3357  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.89 
 
 		 513 aa  638    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2286  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.65 
 
 		 509 aa  640    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5105  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.2 
 
 		 502 aa  650    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2139  ATP synthase F1, alpha subunit  64.74 
 
 		 507 aa  685    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1640  ATP synthase F1, alpha subunit  62.03 
 
 		 526 aa  650    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16531  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.8 
 
 		 505 aa  635    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.592214  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4497  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.07 
 
 		 512 aa  651    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.694909  normal  0.0411828 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.5 
 
 		 526 aa  648    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2454  F0F1 ATP synthase subunit alpha  70 
 
 		 502 aa  731    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2164  F0F1 ATP synthase subunit alpha  70 
 
 		 502 aa  731    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0327  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.68 
 
 		 507 aa  639    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2199  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.4 
 
 		 505 aa  641    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.539772 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1463  ATP synthase F1, alpha subunit  61.49 
 
 		 509 aa  642    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.298107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1620  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.65 
 
 		 504 aa  647    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0802007  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1736  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.53 
 
 		 505 aa  672    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2384  Sodium-transporting two-sector ATPase  66.73 
 
 		 504 aa  692    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15701  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.2 
 
 		 504 aa  635    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.110948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0095  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.69 
 
 		 513 aa  635    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.88314  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0140  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.97 
 
 		 501 aa  653    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.241383  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3013  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.89 
 
 		 513 aa  638    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0663  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.22 
 
 		 520 aa  644    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0131395  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3528  ATP synthase F1, alpha subunit  60.86 
 
 		 512 aa  642    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0251899 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3514  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.28 
 
 		 513 aa  642    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.277441  hitchhiker  0.00052948 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1519  ATP synthase F1, alpha subunit  59.68 
 
 		 512 aa  637    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.283334  hitchhiker  0.000000000000106657 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1275  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.27 
 
 		 503 aa  662    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.588856  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2584  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.82 
 
 		 505 aa  667    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.341955  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0536  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.53 
 
 		 503 aa  673    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.19649  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2846  ATP synthase F1, alpha subunit  65.6 
 
 		 508 aa  686    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.525611 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1527  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.07 
 
 		 505 aa  676    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000683533  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0604  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.67 
 
 		 502 aa  710    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>