More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1224 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001303  ANIA_10626  hypothetical protein similar to ATP synthase alpha chain (Broad)  64.75 
 
 
561 aa  680    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.585818  normal  0.812779 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01523  ATP synthase alpha chain, mitochondrial precursor (Broad)  67.99 
 
 
556 aa  713    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0621  F0F1 ATP synthase subunit alpha  75.1 
 
 
509 aa  793    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.953551 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0112  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.76 
 
 
501 aa  660    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0295232  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2186  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.48 
 
 
502 aa  653    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0111  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.08 
 
 
503 aa  694    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2924  F0F1 ATP synthase subunit alpha  77.06 
 
 
509 aa  801    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.363319  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0193  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.36 
 
 
501 aa  657    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0287666  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0140  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.16 
 
 
501 aa  664    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.241383  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0173  F0F1 ATP synthase subunit alpha  77.45 
 
 
510 aa  808    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0601  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.06 
 
 
505 aa  664    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00209636  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5432  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.67 
 
 
502 aa  644    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0100  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.16 
 
 
501 aa  664    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1463  ATP synthase F1, alpha subunit  76.47 
 
 
509 aa  806    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.298107  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1801  F0F1 ATP synthase subunit alpha  78.24 
 
 
509 aa  809    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5157  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.67 
 
 
502 aa  644    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4990  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.67 
 
 
502 aa  644    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5007  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.67 
 
 
502 aa  644    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1679  F0F1 ATP synthase subunit alpha  74.36 
 
 
510 aa  787    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.536422  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3827  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.87 
 
 
502 aa  645    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1103  F0F1 ATP synthase subunit alpha  77.84 
 
 
509 aa  815    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02280  ATP synthase alpha chain, mitochondrial precursor, putative  69.54 
 
 
540 aa  708    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5105  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.67 
 
 
502 aa  643    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1468  F0F1 ATP synthase subunit alpha  76.47 
 
 
509 aa  790    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.184879 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47835  synthase of mitochondrial ATP synthase  64.66 
 
 
544 aa  661    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5398  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.67 
 
 
502 aa  644    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2629899999999999e-45 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4793  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.67 
 
 
502 aa  652    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1736  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.24 
 
 
505 aa  661    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0430  F0F1 ATP synthase subunit alpha  77.84 
 
 
510 aa  803    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1746  F0F1 ATP synthase subunit alpha  76.47 
 
 
509 aa  790    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal  0.129066 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1014  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.93 
 
 
502 aa  654    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000116673  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0220  ATP synthase F1, alpha subunit  75.29 
 
 
509 aa  786    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2297  F0F1 ATP synthase subunit alpha  74.02 
 
 
512 aa  774    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0947  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.62 
 
 
502 aa  684    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3133  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.62 
 
 
502 aa  684    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4261  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.82 
 
 
502 aa  689    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00501837  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4505  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.27 
 
 
510 aa  665    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3172  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.42 
 
 
502 aa  681    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0844597  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5522  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.67 
 
 
502 aa  644    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000300598  hitchhiker  0.0000000000000322299 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7382  F0F1 ATP synthase subunit alpha  77.6 
 
 
509 aa  797    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187104  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3408  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.27 
 
 
503 aa  694    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.14914  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0987  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.28 
 
 
502 aa  647    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975811  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4486  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.47 
 
 
510 aa  665    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5549  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.67 
 
 
502 aa  644    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.31478  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1405  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.22 
 
 
505 aa  637    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0699258  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1315  F0F1 ATP synthase subunit alpha  73.83 
 
 
512 aa  772    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4108  F0F1 ATP synthase subunit alpha  77.25 
 
 
508 aa  800    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2936  F0F1 ATP synthase subunit alpha  75 
 
 
512 aa  771    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.147396  normal  0.0629902 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1224  ATP synthase F1, alpha subunit  100 
 
 
510 aa  1025    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3305  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.67 
 
 
502 aa  653    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.694138  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2078  F0F1 ATP synthase subunit alpha  79.02 
 
 
509 aa  815    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.368934 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4350  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.05 
 
 
510 aa  673    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2203  F0F1 ATP synthase subunit alpha  73.44 
 
 
512 aa  768    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0267  F0F1 ATP synthase subunit alpha  77.45 
 
 
510 aa  804    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.686525 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2400  F0F1 ATP synthase subunit alpha  79.02 
 
 
509 aa  822    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5429  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.87 
 
 
502 aa  645    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.099904  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3417  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.46 
 
 
502 aa  652    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1047  F0F1 ATP synthase subunit alpha  72.07 
 
 
512 aa  753    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.501487  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3654  F0F1 ATP synthase subunit alpha  77.06 
 
 
509 aa  803    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4167  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.76 
 
 
501 aa  637    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.804654  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0176  F0F1 ATP synthase subunit alpha  76.47 
 
 
510 aa  800    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0605  F0F1 ATP synthase subunit alpha  76.62 
 
 
510 aa  791    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.404784  normal  0.651766 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0915  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.24 
 
 
505 aa  663    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0383852  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0112  F0F1 ATP synthase subunit alpha  74.56 
 
 
511 aa  780    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0557  F0F1 ATP synthase subunit alpha  76.67 
 
 
510 aa  799    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.114224 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0972  F0F1 ATP synthase subunit alpha  74.02 
 
 
512 aa  774    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0532  F0F1 ATP synthase subunit alpha  76.82 
 
 
510 aa  803    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2829  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.85 
 
 
502 aa  659    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2088  F0F1 ATP synthase subunit alpha  74.07 
 
 
513 aa  766    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.509731  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2286  F0F1 ATP synthase subunit alpha  77.06 
 
 
509 aa  806    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0406  F0F1 ATP synthase subunit alpha  78.24 
 
 
509 aa  801    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.102948 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2759  ATP synthase F1, alpha subunit  62.48 
 
 
502 aa  646    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4037  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.82 
 
 
502 aa  684    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00278502 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3216  F0F1 ATP synthase subunit alpha  77.84 
 
 
509 aa  809    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.458172  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3943  F0F1 ATP synthase subunit alpha  77.06 
 
 
509 aa  802    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2454  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.51 
 
 
502 aa  634    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0513  ATP synthase F1, alpha subunit  63.19 
 
 
501 aa  659    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2193  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.87 
 
 
502 aa  656    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5485  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.67 
 
 
502 aa  644    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.184326  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6637  F0F1 ATP synthase subunit alpha  77.65 
 
 
509 aa  801    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0712183 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2804  F0F1 ATP synthase subunit alpha  77.69 
 
 
510 aa  805    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.370852  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1620  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.08 
 
 
504 aa  652    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0802007  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3364  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.05 
 
 
502 aa  661    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.677346  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86570  F1F0-ATPase complex, F1 alpha subunit  68.19 
 
 
545 aa  701    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1734  F0F1 ATP synthase subunit alpha  78.24 
 
 
509 aa  807    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4497  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.99 
 
 
512 aa  656    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.694909  normal  0.0411828 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0341  ATP synthase F1, alpha subunit  76.86 
 
 
509 aa  792    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00762672 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6064  ATP synthase F1, alpha subunit  64.2 
 
 
512 aa  663    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2584  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.52 
 
 
505 aa  640    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.341955  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3460  ATP synthase F1, alpha subunit  71.69 
 
 
507 aa  738    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.823714  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3952  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.82 
 
 
502 aa  683    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.116029  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1527  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.14 
 
 
505 aa  657    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000683533  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0604  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.53 
 
 
502 aa  672    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1505  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.53 
 
 
502 aa  672    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.56305  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2214  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.87 
 
 
504 aa  657    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.188551  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3816  F0F1 ATP synthase subunit alpha  72.99 
 
 
511 aa  756    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.905134  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4740  F0F1 ATP synthase subunit alpha  78.08 
 
 
510 aa  819    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.408023  hitchhiker  0.00635659 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1467  F0F1 ATP synthase subunit alpha  76.47 
 
 
509 aa  791    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0685  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.67 
 
 
505 aa  654    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.17328  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1492  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.06 
 
 
505 aa  634  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0642798  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>