More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1405 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_0341  ATP synthase F1, alpha subunit  62.06 
 
 
509 aa  640    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00762672 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7382  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.46 
 
 
509 aa  640    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187104  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2829  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.12 
 
 
502 aa  651    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4167  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.85 
 
 
501 aa  648    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.804654  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0111  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.2 
 
 
503 aa  691    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1492  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.32 
 
 
505 aa  646    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0642798  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1711  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.65 
 
 
503 aa  637    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3952  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.13 
 
 
502 aa  672    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.116029  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1620  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.25 
 
 
504 aa  655    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0802007  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5432  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.28 
 
 
502 aa  652    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0100  F0F1 ATP synthase subunit alpha  78.8 
 
 
501 aa  820    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4793  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.72 
 
 
502 aa  637    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1801  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.26 
 
 
509 aa  635    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0193  F0F1 ATP synthase subunit alpha  79.2 
 
 
501 aa  819    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0287666  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2332  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.42 
 
 
526 aa  635    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5157  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.28 
 
 
502 aa  652    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4990  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.28 
 
 
502 aa  652    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5007  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.28 
 
 
502 aa  652    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.96 
 
 
503 aa  637    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.244084  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4740  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.75 
 
 
510 aa  647    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.408023  hitchhiker  0.00635659 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0605  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.55 
 
 
510 aa  640    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.404784  normal  0.651766 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3943  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.28 
 
 
509 aa  635    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1103  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.26 
 
 
509 aa  639    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0601  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.73 
 
 
505 aa  663    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00209636  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0981  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.28 
 
 
504 aa  639    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2924  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.47 
 
 
509 aa  641    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.363319  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18491  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.68 
 
 
504 aa  636    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.983268 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1014  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.71 
 
 
502 aa  663    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000116673  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0430  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.75 
 
 
510 aa  641    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1746  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.47 
 
 
509 aa  637    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal  0.129066 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5485  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.28 
 
 
502 aa  652    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.184326  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4486  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.97 
 
 
510 aa  650    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3654  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.28 
 
 
509 aa  634    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1468  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.47 
 
 
509 aa  637    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.184879 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0947  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.26 
 
 
502 aa  682    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3133  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.26 
 
 
502 aa  682    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0112  F0F1 ATP synthase subunit alpha  78.2 
 
 
501 aa  816    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0295232  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4505  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.17 
 
 
510 aa  652    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5105  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.08 
 
 
502 aa  649    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5522  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.48 
 
 
502 aa  653    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000300598  hitchhiker  0.0000000000000322299 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3172  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.73 
 
 
502 aa  693    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0844597  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3408  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.6 
 
 
503 aa  689    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.14914  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0987  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.12 
 
 
502 aa  654    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975811  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5549  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.28 
 
 
502 aa  652    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.31478  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1405  F0F1 ATP synthase subunit alpha  100 
 
 
505 aa  1018    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0699258  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.12 
 
 
505 aa  636    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0336  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.28 
 
 
505 aa  641    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.120732  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0308  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.08 
 
 
513 aa  634    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0176346  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1224  ATP synthase F1, alpha subunit  61.22 
 
 
510 aa  637    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2380  ATP synthase F1, alpha subunit  62.55 
 
 
507 aa  652    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0176105 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.85 
 
 
502 aa  641    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4350  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.56 
 
 
510 aa  659    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0267  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.95 
 
 
510 aa  643    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.686525 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2400  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.92 
 
 
509 aa  650    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2186  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.32 
 
 
502 aa  642    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1463  ATP synthase F1, alpha subunit  63.64 
 
 
509 aa  659    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.298107  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15701  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.88 
 
 
504 aa  637    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.110948  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0176  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.36 
 
 
510 aa  639    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2746  ATP synthase F1, alpha subunit  59.92 
 
 
513 aa  636    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.426504  normal  0.209432 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0406  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.26 
 
 
509 aa  641    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.102948 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3305  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.07 
 
 
502 aa  666    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.694138  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1426  ATP synthase F1, alpha subunit  63.05 
 
 
507 aa  651    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0557  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.55 
 
 
510 aa  642    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.114224 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1467  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.67 
 
 
509 aa  642    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0532  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.45 
 
 
510 aa  639    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5429  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.08 
 
 
502 aa  650    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.099904  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4334  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.56 
 
 
512 aa  652    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00117083  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2078  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.44 
 
 
509 aa  657    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.368934 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2286  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.93 
 
 
509 aa  653    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4497  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.13 
 
 
512 aa  649    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.694909  normal  0.0411828 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2193  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.52 
 
 
502 aa  644    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3152  ATP synthase F1, alpha subunit  62.65 
 
 
501 aa  643    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0140  F0F1 ATP synthase subunit alpha  78.8 
 
 
501 aa  819    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.241383  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3216  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.66 
 
 
509 aa  639    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.458172  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3364  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.73 
 
 
502 aa  650    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.677346  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2454  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.4 
 
 
502 aa  635    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4037  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.93 
 
 
502 aa  670    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00278502 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1679  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.99 
 
 
510 aa  658    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.536422  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2759  ATP synthase F1, alpha subunit  63.93 
 
 
502 aa  672    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4108  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.99 
 
 
508 aa  640    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4261  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.93 
 
 
502 aa  688    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00501837  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3827  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.08 
 
 
502 aa  653    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2141  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.85 
 
 
502 aa  641    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.588965  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2804  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.75 
 
 
510 aa  639    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.370852  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0685  F0F1 ATP synthase subunit alpha  77.58 
 
 
505 aa  813    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.17328  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6637  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.66 
 
 
509 aa  644    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0712183 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2214  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.93 
 
 
504 aa  662    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.188551  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1275  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.96 
 
 
503 aa  637    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.588856  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0621  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.46 
 
 
509 aa  637    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.953551 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0915  F0F1 ATP synthase subunit alpha  78.88 
 
 
505 aa  835    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0383852  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17820  ATP synthase F1, alpha subunit  60.96 
 
 
541 aa  643    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1736  F0F1 ATP synthase subunit alpha  78.61 
 
 
505 aa  835    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2584  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.16 
 
 
505 aa  645    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.341955  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3460  ATP synthase F1, alpha subunit  63.96 
 
 
507 aa  666    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.823714  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5398  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.28 
 
 
502 aa  652    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2629899999999999e-45 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1527  F0F1 ATP synthase subunit alpha  78.29 
 
 
505 aa  830    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000683533  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0604  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.13 
 
 
502 aa  692    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1505  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.13 
 
 
502 aa  692    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.56305  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.62 
 
 
526 aa  647    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0173  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.55 
 
 
510 aa  641    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>