More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1620 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_4261  F0F1 ATP synthase subunit alpha  67.27 
 
 
502 aa  707    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00501837  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0220  ATP synthase F1, alpha subunit  62.4 
 
 
509 aa  647    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3654  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.81 
 
 
509 aa  652    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1620  F0F1 ATP synthase subunit alpha  100 
 
 
504 aa  1014    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0802007  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2829  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.39 
 
 
502 aa  675    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0111  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.33 
 
 
503 aa  702    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16531  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.71 
 
 
505 aa  637    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.592214  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4793  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.46 
 
 
502 aa  666    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0292  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.53 
 
 
507 aa  645    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3152  ATP synthase F1, alpha subunit  63.6 
 
 
501 aa  657    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1103  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.19 
 
 
509 aa  660    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5432  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.78 
 
 
502 aa  652    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0100  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.32 
 
 
501 aa  681    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2619  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.4 
 
 
503 aa  655    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_004310  BR1801  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.19 
 
 
509 aa  657    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5157  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.78 
 
 
502 aa  652    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4990  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.78 
 
 
502 aa  652    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5007  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.78 
 
 
502 aa  652    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1746  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.34 
 
 
509 aa  640    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal  0.129066 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1014  F0F1 ATP synthase subunit alpha  71.4 
 
 
502 aa  733    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000116673  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2705  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.6 
 
 
526 aa  658    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3827  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.78 
 
 
502 aa  650    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15701  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.51 
 
 
504 aa  636    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.110948  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1734  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.39 
 
 
509 aa  657    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2720  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.4 
 
 
503 aa  647    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5522  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.78 
 
 
502 aa  652    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000300598  hitchhiker  0.0000000000000322299 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1468  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.34 
 
 
509 aa  640    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.184879 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.39 
 
 
503 aa  663    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.244084  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0406  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.03 
 
 
509 aa  639    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.102948 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0430  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.9 
 
 
510 aa  635    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2611  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.87 
 
 
506 aa  636    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.169882  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1736  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.06 
 
 
505 aa  673    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2332  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.91 
 
 
526 aa  654    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2193  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.19 
 
 
502 aa  670    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0297  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.76 
 
 
526 aa  651    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.204325 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0947  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.06 
 
 
502 aa  676    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3133  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.06 
 
 
502 aa  676    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1463  ATP synthase F1, alpha subunit  62.99 
 
 
509 aa  657    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.298107  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1985  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.47 
 
 
526 aa  671    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.25217  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5485  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.78 
 
 
502 aa  652    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.184326  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0140  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.03 
 
 
526 aa  662    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0262  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.79 
 
 
526 aa  660    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0489814 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3408  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.93 
 
 
503 aa  707    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.14914  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0987  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.98 
 
 
502 aa  674    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975811  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5549  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.78 
 
 
502 aa  652    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.31478  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1405  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.25 
 
 
505 aa  655    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0699258  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1492  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.2 
 
 
505 aa  648    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0642798  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0336  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.15 
 
 
505 aa  642    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.120732  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3738  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.65 
 
 
502 aa  647    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1224  ATP synthase F1, alpha subunit  62.08 
 
 
510 aa  652    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2380  ATP synthase F1, alpha subunit  66.47 
 
 
507 aa  679    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0176105 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6637  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.61 
 
 
509 aa  645    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0712183 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4350  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.47 
 
 
510 aa  665    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1679  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.28 
 
 
510 aa  661    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.536422  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0267  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.08 
 
 
510 aa  645    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.686525 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2400  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.19 
 
 
509 aa  665    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1315  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.69 
 
 
512 aa  648    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3338  ATP synthase F1 subunit alpha  63.55 
 
 
506 aa  640    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5105  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.38 
 
 
502 aa  649    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2141  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.6 
 
 
502 aa  636    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.588965  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4740  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.9 
 
 
510 aa  643    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.408023  hitchhiker  0.00635659 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0176  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.1 
 
 
510 aa  636    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0621  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.99 
 
 
509 aa  665    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.953551 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2078  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.23 
 
 
509 aa  650    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.368934 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0685  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.31 
 
 
505 aa  681    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.17328  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0140  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.32 
 
 
501 aa  681    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.241383  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0557  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.69 
 
 
510 aa  645    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.114224 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16411  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.71 
 
 
505 aa  637    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0532  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.26 
 
 
510 aa  639    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2924  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.81 
 
 
509 aa  644    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.363319  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0173  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.48 
 
 
510 aa  655    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4334  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.35 
 
 
512 aa  655    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00117083  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2186  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.78 
 
 
502 aa  670    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2286  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.19 
 
 
509 aa  651    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.6 
 
 
502 aa  636    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1467  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.02 
 
 
509 aa  640    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1275  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.39 
 
 
503 aa  663    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.588856  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3216  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.02 
 
 
509 aa  642    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.458172  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0183  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.86 
 
 
526 aa  650    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.617939  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2454  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.78 
 
 
502 aa  647    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2164  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.98 
 
 
502 aa  648    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2199  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.15 
 
 
505 aa  639    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.539772 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0327  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.43 
 
 
507 aa  644    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0605  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.22 
 
 
510 aa  640    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.404784  normal  0.651766 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2804  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.01 
 
 
510 aa  656    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.370852  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0915  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65 
 
 
505 aa  675    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0383852  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3172  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.46 
 
 
502 aa  692    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0844597  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4486  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.67 
 
 
510 aa  671    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0601  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.25 
 
 
505 aa  670    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00209636  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5429  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.58 
 
 
502 aa  650    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.099904  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0341  ATP synthase F1, alpha subunit  61.61 
 
 
509 aa  638    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00762672 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4497  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.94 
 
 
512 aa  669    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.694909  normal  0.0411828 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2584  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.65 
 
 
505 aa  670    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.341955  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3460  ATP synthase F1, alpha subunit  63.84 
 
 
507 aa  644    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.823714  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5398  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.78 
 
 
502 aa  652    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2629899999999999e-45 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1527  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.14 
 
 
505 aa  682    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000683533  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0604  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.87 
 
 
502 aa  674    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1505  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.87 
 
 
502 aa  674    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.56305  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.88 
 
 
526 aa  665    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3952  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.33 
 
 
502 aa  685    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.116029  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>