More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2809 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0253  F0F1 ATP synthase subunit alpha  72.07 
 
 		 517 aa  748    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.231665  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03618  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.55 
 
 		 513 aa  741    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0929939  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4233  ATP synthase F1, alpha subunit  68.55 
 
 		 513 aa  741    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4509  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.55 
 
 		 513 aa  737    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0722271 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0111  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.83 
 
 		 503 aa  636    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5415  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.68 
 
 		 514 aa  746    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0008954 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3958  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.55 
 
 		 513 aa  733    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0010  F0F1 ATP synthase subunit alpha  72.85 
 
 		 513 aa  777    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.768352  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3319  F0F1 ATP synthase subunit alpha  73.05 
 
 		 513 aa  765    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.162911  decreased coverage  0.00532822 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4130  F0F1 ATP synthase subunit alpha  69.14 
 
 		 513 aa  747    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.289812  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0060  ATP synthase F1, alpha subunit  70.51 
 
 		 513 aa  729    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4204  F0F1 ATP synthase subunit alpha  69.34 
 
 		 513 aa  743    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00827447  normal  0.117053 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3646  F0F1 ATP synthase subunit alpha  67.19 
 
 		 513 aa  709    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00183846  unclonable  0.000012076 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4609  F0F1 ATP synthase subunit alpha  70.62 
 
 		 514 aa  743    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4749  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.75 
 
 		 513 aa  737    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5601  ATP synthase F1, alpha subunit  69.26 
 
 		 514 aa  736    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4260  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.55 
 
 		 513 aa  741    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00377542  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3738  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.86 
 
 		 502 aa  650    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4368  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.55 
 
 		 513 aa  737    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.103499  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2955  F0F1 ATP synthase subunit alpha  73.24 
 
 		 513 aa  775    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.103528  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3055  F0F1 ATP synthase subunit alpha  69.08 
 
 		 517 aa  750    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2912  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.88 
 
 		 517 aa  749    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3732  ATP synthase F1, alpha subunit  67.77 
 
 		 513 aa  721    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5123  F0F1 ATP synthase subunit alpha  69.26 
 
 		 514 aa  736    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2026  F0F1 ATP synthase subunit alpha  67.9 
 
 		 514 aa  736    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0785493  normal  0.0283137 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4112  ATP synthase F1, alpha subunit  73.03 
 
 		 512 aa  784    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000122055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0178  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.21 
 
 		 515 aa  717    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3348  F0F1 ATP synthase subunit alpha  74.02 
 
 		 513 aa  773    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3877  F0F1 ATP synthase subunit alpha  69.65 
 
 		 514 aa  739    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.010496  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2799  F0F1 ATP synthase subunit alpha  73.05 
 
 		 513 aa  774    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3357  F0F1 ATP synthase subunit alpha  73.24 
 
 		 513 aa  775    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0191  F0F1 ATP synthase subunit alpha  67.51 
 
 		 514 aa  731    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.02548 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0181  F0F1 ATP synthase subunit alpha  73.44 
 
 		 513 aa  776    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3076  F0F1 ATP synthase subunit alpha  73.05 
 
 		 515 aa  776    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5732  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.68 
 
 		 514 aa  732    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00344772  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2526  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.16 
 
 		 513 aa  723    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.52582  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4178  F0F1 ATP synthase subunit alpha  69.34 
 
 		 513 aa  743    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000943089  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5433  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.87 
 
 		 514 aa  748    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3286  F0F1 ATP synthase subunit alpha  73.44 
 
 		 513 aa  771    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5297  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.87 
 
 		 514 aa  748    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.259807  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0104  F0F1 ATP synthase subunit alpha  73.83 
 
 		 513 aa  777    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0331113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2146  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.21 
 
 		 515 aa  717    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4261  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.14 
 
 		 502 aa  642    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00501837  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3408  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.83 
 
 		 503 aa  636    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.14914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2167  ATP synthase F1, alpha subunit  70.7 
 
 		 513 aa  735    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000771452  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0195  F0F1 ATP synthase subunit alpha  69.53 
 
 		 517 aa  732    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6358  F0F1 ATP synthase subunit alpha  70.43 
 
 		 514 aa  743    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0006  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.95 
 
 		 513 aa  744    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00898891  normal  0.0113321 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4464  ATP synthase F1, alpha subunit  71.79 
 
 		 514 aa  776    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00523084  hitchhiker  0.0000000225829 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0308  F0F1 ATP synthase subunit alpha  73.44 
 
 		 513 aa  788    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0176346  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0478  F0F1 ATP synthase subunit alpha  69.51 
 
 		 537 aa  717    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.470721  normal  0.766307 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2380  ATP synthase F1, alpha subunit  62.04 
 
 		 507 aa  647    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0176105 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3310  F0F1 ATP synthase subunit alpha  73.44 
 
 		 513 aa  776    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145544  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3950  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.55 
 
 		 513 aa  741    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0104398  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4044  F0F1 ATP synthase subunit alpha  73.44 
 
 		 513 aa  776    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4250  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.55 
 
 		 513 aa  741    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000159967  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0370  F0F1 ATP synthase subunit alpha  70.62 
 
 		 519 aa  733    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462035 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0418  F0F1 ATP synthase subunit alpha  71.48 
 
 		 517 aa  766    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0108  F0F1 ATP synthase subunit alpha  71.29 
 
 		 517 aa  756    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0072301  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3968  F0F1 ATP synthase subunit alpha  70.43 
 
 		 513 aa  767    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00212226  normal  0.363418 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3847  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.16 
 
 		 513 aa  739    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000253234 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2746  ATP synthase F1, alpha subunit  72.07 
 
 		 513 aa  780    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.426504  normal  0.209432 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0325  F0F1 ATP synthase subunit alpha  72.08 
 
 		 517 aa  742    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.525504  normal  0.259284 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0038  F0F1 ATP synthase subunit alpha  75 
 
 		 513 aa  782    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.266333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3754  F0F1 ATP synthase subunit alpha  67.77 
 
 		 513 aa  733    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.472478  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0024  F0F1 ATP synthase subunit alpha  73.83 
 
 		 513 aa  758    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.1189  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3286  ATP synthase F1, alpha subunit  69.65 
 
 		 514 aa  756    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.300258  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3152  ATP synthase F1, alpha subunit  61.46 
 
 		 501 aa  646    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2329  F0F1 ATP synthase subunit alpha  67.9 
 
 		 514 aa  738    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.355316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3496  F0F1 ATP synthase subunit alpha  73.63 
 
 		 513 aa  789    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.225453  normal  0.438236 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0143  ATP synthase F1, alpha subunit  63.67 
 
 		 513 aa  701    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.100694  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4334  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.12 
 
 		 512 aa  642    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00117083  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2193  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.51 
 
 		 502 aa  643    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4102  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.55 
 
 		 513 aa  741    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.052842  normal  0.176896 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2951  F0F1 ATP synthase subunit alpha  73.44 
 
 		 513 aa  771    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130685  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4242  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.16 
 
 		 513 aa  742    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.112134  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4297  F0F1 ATP synthase subunit alpha  69.92 
 
 		 513 aa  740    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0474794  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2432  F0F1 ATP synthase subunit alpha  70.31 
 
 		 513 aa  755    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.183567  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0306  F0F1 ATP synthase subunit alpha  71.21 
 
 		 519 aa  738    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.682885  normal  0.011367 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2454  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.78 
 
 		 502 aa  637    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2164  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.78 
 
 		 502 aa  638    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1698  F0F1 ATP synthase subunit alpha  69.73 
 
 		 513 aa  746    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4367  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.55 
 
 		 513 aa  737    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3927  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.55 
 
 		 513 aa  736    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0480758  normal  0.0183587 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4019  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.55 
 
 		 513 aa  736    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.178893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2871  F0F1 ATP synthase subunit alpha  73.05 
 
 		 513 aa  759    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4047  F0F1 ATP synthase subunit alpha  67.38 
 
 		 513 aa  709    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.145549  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00423  F0F1 ATP synthase subunit alpha  67.38 
 
 		 523 aa  712    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3013  F0F1 ATP synthase subunit alpha  73.24 
 
 		 513 aa  775    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0095  F0F1 ATP synthase subunit alpha  73.83 
 
 		 513 aa  775    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.88314  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73260  F0F1 ATP synthase subunit alpha  70.43 
 
 		 514 aa  743    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1589  F0F1 ATP synthase subunit alpha  73.24 
 
 		 513 aa  775    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.10033  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06106  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.9 
 
 		 512 aa  716    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0104  F0F1 ATP synthase subunit alpha  73.44 
 
 		 513 aa  771    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.679281  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4488  F0F1 ATP synthase subunit alpha  67.97 
 
 		 513 aa  743    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157243  hitchhiker  0.000010856 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3970  F0F1 ATP synthase subunit alpha  73.44 
 
 		 513 aa  776    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4132  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.55 
 
 		 513 aa  736    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.846354  normal  0.0284355 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4224  F0F1 ATP synthase subunit alpha  69.34 
 
 		 513 aa  743    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00414343  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0604  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.93 
 
 		 502 aa  647    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1505  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.93 
 
 		 502 aa  647    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.56305  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>