More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6523 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1712  F0F1 ATP synthase subunit alpha  76.15 
 
 
526 aa  814    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000192165  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0315  ATP synthase F1, alpha subunit  68.82 
 
 
534 aa  731    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1233  ATP synthase F1, alpha subunit  72.52 
 
 
525 aa  784    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2332  F0F1 ATP synthase subunit alpha  69.41 
 
 
526 aa  722    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0262  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.26 
 
 
526 aa  721    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0489814 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1426  ATP synthase F1, alpha subunit  61.19 
 
 
507 aa  637    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03060  ATP synthase subunit A  74.24 
 
 
524 aa  801    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1985  F0F1 ATP synthase subunit alpha  69.41 
 
 
526 aa  723    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.25217  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0140  F0F1 ATP synthase subunit alpha  67.88 
 
 
526 aa  713    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0396  F0F1 ATP synthase subunit alpha  77.1 
 
 
524 aa  835    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2380  ATP synthase F1, alpha subunit  61.64 
 
 
507 aa  635    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0176105 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2400  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.65 
 
 
509 aa  635    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2705  F0F1 ATP synthase subunit alpha  69.96 
 
 
526 aa  719    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1059  F0F1 ATP synthase subunit alpha  73.66 
 
 
525 aa  790    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0297  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.45 
 
 
526 aa  720    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.204325 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0183  F0F1 ATP synthase subunit alpha  79.96 
 
 
526 aa  866    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.617939  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4632  ATP synthase F1, alpha subunit  82.44 
 
 
525 aa  887    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0663006  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0065  ATP synthase F1 subunit alpha  71.76 
 
 
532 aa  778    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6523  ATP synthase F1, alpha subunit  100 
 
 
524 aa  1058    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  69.02 
 
 
526 aa  723    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4261  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.38 
 
 
502 aa  633  1e-180  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00501837  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17820  ATP synthase F1, alpha subunit  60.69 
 
 
541 aa  632  1e-180  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0621  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.36 
 
 
509 aa  630  1e-179  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.953551 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4037  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.46 
 
 
502 aa  627  1e-178  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00278502 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2804  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.62 
 
 
510 aa  627  1e-178  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.370852  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3952  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.46 
 
 
502 aa  626  1e-178  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.116029  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4793  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.7 
 
 
502 aa  621  1e-177  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1620  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.26 
 
 
504 aa  624  1e-177  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0802007  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3305  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.55 
 
 
502 aa  622  1e-177  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.694138  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1467  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60 
 
 
509 aa  621  1e-177  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7382  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.62 
 
 
509 aa  619  1e-176  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187104  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3417  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.55 
 
 
502 aa  618  1e-176  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0430  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.04 
 
 
510 aa  618  1e-176  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0336  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.92 
 
 
505 aa  619  1e-176  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.120732  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2286  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.15 
 
 
509 aa  620  1e-176  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3152  ATP synthase F1, alpha subunit  62.35 
 
 
501 aa  620  1e-176  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2759  ATP synthase F1, alpha subunit  59.85 
 
 
502 aa  620  1e-176  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1492  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.95 
 
 
505 aa  620  1e-176  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0642798  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0081  ATP synthase F1, alpha subunit  62.35 
 
 
507 aa  619  1e-176  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2078  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.06 
 
 
509 aa  619  1e-176  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.368934 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6637  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.43 
 
 
509 aa  616  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0712183 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0111  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.67 
 
 
503 aa  617  1e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3172  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.85 
 
 
502 aa  617  1e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0844597  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1746  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.54 
 
 
509 aa  617  1e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal  0.129066 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3408  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.07 
 
 
503 aa  616  1e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.14914  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1679  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.84 
 
 
510 aa  615  1e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.536422  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0267  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.51 
 
 
510 aa  615  1e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.686525 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0176  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.42 
 
 
510 aa  616  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0532  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.08 
 
 
510 aa  615  1e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0605  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.62 
 
 
510 aa  617  1e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.404784  normal  0.651766 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0173  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.94 
 
 
510 aa  615  1e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1468  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.54 
 
 
509 aa  617  1e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.184879 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2829  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.11 
 
 
502 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2139  ATP synthase F1, alpha subunit  60.43 
 
 
507 aa  613  9.999999999999999e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0513  ATP synthase F1, alpha subunit  58.81 
 
 
501 aa  613  9.999999999999999e-175  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4740  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.7 
 
 
510 aa  614  9.999999999999999e-175  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.408023  hitchhiker  0.00635659 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1463  ATP synthase F1, alpha subunit  59.05 
 
 
509 aa  612  9.999999999999999e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.298107  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0557  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.04 
 
 
510 aa  614  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.114224 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4497  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.86 
 
 
512 aa  614  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.694909  normal  0.0411828 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4334  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.33 
 
 
512 aa  613  9.999999999999999e-175  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00117083  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0406  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60 
 
 
509 aa  613  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.102948 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2584  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.43 
 
 
505 aa  613  9.999999999999999e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.341955  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0604  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.77 
 
 
502 aa  614  9.999999999999999e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1505  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.77 
 
 
502 aa  614  9.999999999999999e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.56305  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2193  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.81 
 
 
502 aa  610  1e-173  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0112  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.28 
 
 
511 aa  610  1e-173  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02280  ATP synthase alpha chain, mitochondrial precursor, putative  58.98 
 
 
540 aa  609  1e-173  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4167  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.04 
 
 
501 aa  608  1e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.804654  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0947  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.42 
 
 
502 aa  611  1e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3133  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.42 
 
 
502 aa  611  1e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2846  ATP synthase F1, alpha subunit  59.61 
 
 
508 aa  608  1e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.525611 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3460  ATP synthase F1, alpha subunit  61.92 
 
 
507 aa  611  1e-173  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.823714  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0065  ATP synthase F1, alpha subunit  59.27 
 
 
508 aa  609  1e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1801  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.61 
 
 
509 aa  606  9.999999999999999e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0685  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.81 
 
 
505 aa  605  9.999999999999999e-173  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.17328  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0341  ATP synthase F1, alpha subunit  58.86 
 
 
509 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00762672 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5429  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.76 
 
 
502 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.099904  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16411  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.97 
 
 
505 aa  607  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1014  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.43 
 
 
502 aa  605  9.999999999999999e-173  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000116673  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1275  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.36 
 
 
503 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.588856  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5105  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.56 
 
 
502 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16531  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.97 
 
 
505 aa  607  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.592214  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1734  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.61 
 
 
509 aa  606  9.999999999999999e-173  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.36 
 
 
503 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.244084  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1527  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.2 
 
 
505 aa  607  9.999999999999999e-173  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000683533  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0601  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.45 
 
 
505 aa  604  9.999999999999999e-173  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00209636  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5432  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.56 
 
 
502 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5157  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.56 
 
 
502 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5007  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.56 
 
 
502 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4486  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.88 
 
 
510 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0488  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60 
 
 
506 aa  601  1.0000000000000001e-171  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.294002  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5549  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.56 
 
 
502 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.31478  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.78 
 
 
505 aa  601  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1224  ATP synthase F1, alpha subunit  59.13 
 
 
510 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4350  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.88 
 
 
510 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1103  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.03 
 
 
509 aa  604  1.0000000000000001e-171  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3827  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.36 
 
 
502 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0915  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.24 
 
 
505 aa  603  1.0000000000000001e-171  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0383852  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5398  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.56 
 
 
502 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2629899999999999e-45 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5485  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.56 
 
 
502 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.184326  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>