More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0334 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2450  ATP synthase F1, alpha subunit  74.81 
 
 
543 aa  815    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2340  F0F1 ATP synthase subunit alpha  72.27 
 
 
545 aa  797    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125145 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1216  F0F1 ATP synthase subunit alpha  73.16 
 
 
544 aa  827    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2316  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.57 
 
 
548 aa  772    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261994  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4330  F0F1 ATP synthase subunit alpha  69.5 
 
 
548 aa  750    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.930948  normal  0.0279627 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3632  F0F1 ATP synthase subunit alpha  70.89 
 
 
550 aa  766    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.145338  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2409  F0F1 ATP synthase subunit alpha  85.45 
 
 
547 aa  965    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1669  H(+)-transporting two-sector ATPase  74.77 
 
 
549 aa  844    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4138  ATP synthase F1, alpha subunit  71.88 
 
 
545 aa  809    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.413993  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29570  F0F1 ATP synthase subunit alpha  70.35 
 
 
548 aa  803    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0898  ATP synthase F1 subunit alpha  74.03 
 
 
549 aa  840    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.707906 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1022  F0F1 ATP synthase subunit alpha  71.16 
 
 
553 aa  789    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4014  F0F1 ATP synthase subunit alpha  70.4 
 
 
550 aa  775    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000699734 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3709  F0F1 ATP synthase subunit alpha  71.27 
 
 
552 aa  787    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6138  F0F1 ATP synthase subunit alpha  72.74 
 
 
548 aa  809    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1776  F0F1 ATP synthase subunit alpha  76.56 
 
 
543 aa  817    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.984214 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1268  F0F1 ATP synthase subunit alpha  72.53 
 
 
552 aa  814    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0146  ATP synthase F1, alpha subunit  71.54 
 
 
553 aa  773    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.445327 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11335  F0F1 ATP synthase subunit alpha  69.46 
 
 
549 aa  771    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19150  F0F1 ATP synthase subunit alpha  73.84 
 
 
541 aa  816    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2124  F0F1 ATP synthase subunit alpha  72.01 
 
 
547 aa  801    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00337947  hitchhiker  0.00781719 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0334  ATP synthase F1, alpha subunit  100 
 
 
546 aa  1106    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.297297 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3878  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.32 
 
 
548 aa  772    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3952  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.32 
 
 
548 aa  772    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0936185  hitchhiker  0.00501194 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1314  ATP synthase F1 subunit alpha  70.56 
 
 
545 aa  770    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.438487  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1919  ATP synthase F1, alpha subunit  71.64 
 
 
542 aa  795    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.086846  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1125  F0F1 ATP synthase subunit alpha  69.76 
 
 
543 aa  757    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.826073  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1070  ATP synthase F1, alpha subunit  76.05 
 
 
542 aa  825    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1761  F0F1 ATP synthase subunit alpha  75.5 
 
 
547 aa  848    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.743322  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3918  ATP synthase F1, alpha subunit  76.48 
 
 
546 aa  857    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1253  ATP synthase F1, alpha subunit  70.83 
 
 
544 aa  785    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0274043  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1305  F0F1 ATP synthase subunit alpha  73.69 
 
 
544 aa  809    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.206364  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18220  F0F1 ATP synthase subunit alpha  73.36 
 
 
549 aa  817    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.850315  normal  0.256257 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2607  F0F1 ATP synthase subunit alpha  71.9 
 
 
545 aa  796    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197618  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10010  ATP synthase F1 subcomplex alpha subunit  75.33 
 
 
543 aa  826    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.564506  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3864  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.32 
 
 
548 aa  772    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.283904  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0651  F0F1 ATP synthase subunit alpha  73.33 
 
 
554 aa  818    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.310941  normal  0.421508 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08160  F0F1 ATP synthase subunit alpha  71.01 
 
 
555 aa  791    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17820  ATP synthase F1, alpha subunit  57.97 
 
 
541 aa  625  1e-178  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2214  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.02 
 
 
504 aa  620  1e-176  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.188551  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2759  ATP synthase F1, alpha subunit  60.12 
 
 
502 aa  618  1e-176  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2332  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.34 
 
 
526 aa  619  1e-176  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0297  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.87 
 
 
526 aa  611  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.204325 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2193  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.82 
 
 
502 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4793  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.55 
 
 
502 aa  614  9.999999999999999e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1985  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.39 
 
 
526 aa  614  9.999999999999999e-175  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.25217  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21420  ATP synthase F1 subcomplex alpha subunit  59.13 
 
 
520 aa  613  9.999999999999999e-175  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.68 
 
 
526 aa  612  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.3 
 
 
505 aa  611  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2380  ATP synthase F1, alpha subunit  59.81 
 
 
507 aa  608  1e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0176105 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16301  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.3 
 
 
505 aa  611  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2829  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.63 
 
 
502 aa  608  1e-173  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1797  ATP synthase F1, alpha subunit  59.92 
 
 
504 aa  610  1e-173  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4167  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.96 
 
 
501 aa  608  1e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.804654  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3305  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.2 
 
 
502 aa  608  1e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.694138  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3417  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.2 
 
 
502 aa  606  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3152  ATP synthase F1, alpha subunit  59.72 
 
 
501 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16531  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.91 
 
 
505 aa  607  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.592214  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2186  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.74 
 
 
502 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1492  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.33 
 
 
505 aa  606  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0642798  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0987  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.74 
 
 
502 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975811  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0065  ATP synthase F1, alpha subunit  59.22 
 
 
508 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1014  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.55 
 
 
502 aa  607  9.999999999999999e-173  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000116673  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16411  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.91 
 
 
505 aa  607  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0262  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.25 
 
 
526 aa  603  1.0000000000000001e-171  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0489814 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1711  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.2 
 
 
503 aa  603  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2846  ATP synthase F1, alpha subunit  58.43 
 
 
508 aa  604  1.0000000000000001e-171  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.525611 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1463  ATP synthase F1, alpha subunit  57.96 
 
 
509 aa  603  1.0000000000000001e-171  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.298107  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0201  ATP synthase F1, alpha subunit  58.63 
 
 
501 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.406681  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3827  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.2 
 
 
502 aa  601  1e-170  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5398  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.4 
 
 
502 aa  601  1e-170  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2629899999999999e-45 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5432  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.4 
 
 
502 aa  601  1e-170  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5157  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.4 
 
 
502 aa  601  1e-170  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4990  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.4 
 
 
502 aa  601  1e-170  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5007  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.4 
 
 
502 aa  601  1e-170  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5429  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.2 
 
 
502 aa  600  1e-170  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.099904  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5105  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.2 
 
 
502 aa  600  1e-170  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2611  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.12 
 
 
506 aa  599  1e-170  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.169882  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12070  ATP synthase F1 subcomplex alpha subunit  56.74 
 
 
524 aa  599  1e-170  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5485  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.4 
 
 
502 aa  601  1e-170  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.184326  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5549  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.4 
 
 
502 aa  601  1e-170  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.31478  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2705  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.06 
 
 
526 aa  600  1e-170  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5522  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.4 
 
 
502 aa  601  1e-170  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000300598  hitchhiker  0.0000000000000322299 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2199  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.89 
 
 
505 aa  600  1e-170  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.539772 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3460  ATP synthase F1, alpha subunit  60.04 
 
 
507 aa  598  1e-170  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.823714  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1527  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.96 
 
 
505 aa  599  1e-170  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000683533  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1275  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.84 
 
 
503 aa  595  1e-169  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.588856  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0981  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.71 
 
 
504 aa  597  1e-169  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15701  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.72 
 
 
504 aa  598  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.110948  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0140  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.69 
 
 
526 aa  598  1e-169  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6064  ATP synthase F1, alpha subunit  57.31 
 
 
512 aa  597  1e-169  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.84 
 
 
503 aa  595  1e-169  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.244084  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.28 
 
 
502 aa  597  1e-169  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0685  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.76 
 
 
505 aa  596  1e-169  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.17328  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0621  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.15 
 
 
509 aa  595  1e-169  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.953551 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0465  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.67 
 
 
509 aa  596  1e-169  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.809021  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2286  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.56 
 
 
509 aa  595  1e-169  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2141  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.28 
 
 
502 aa  597  1e-169  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.588965  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0663  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.42 
 
 
520 aa  596  1e-169  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0131395  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2078  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.76 
 
 
509 aa  595  1e-169  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.368934 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>