More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1253 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3632  F0F1 ATP synthase subunit alpha  69.33 
 
 		 550 aa  758    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.145338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19150  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.79 
 
 		 541 aa  735    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4014  F0F1 ATP synthase subunit alpha  69.3 
 
 		 550 aa  764    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000699734 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1761  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66 
 
 		 547 aa  736    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.743322  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6138  F0F1 ATP synthase subunit alpha  74.59 
 
 		 548 aa  818    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2316  F0F1 ATP synthase subunit alpha  73.3 
 
 		 548 aa  814    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3864  F0F1 ATP synthase subunit alpha  70.11 
 
 		 548 aa  793    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.283904  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1268  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.3 
 
 		 552 aa  734    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1919  ATP synthase F1, alpha subunit  86.9 
 
 		 542 aa  973    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.086846  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2409  F0F1 ATP synthase subunit alpha  69.12 
 
 		 547 aa  770    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1070  ATP synthase F1, alpha subunit  67.9 
 
 		 542 aa  737    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08160  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.77 
 
 		 555 aa  708    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0898  ATP synthase F1 subunit alpha  69.02 
 
 		 549 aa  761    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.707906 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4330  F0F1 ATP synthase subunit alpha  73.66 
 
 		 548 aa  802    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.930948  normal  0.0279627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1669  H(+)-transporting two-sector ATPase  67.9 
 
 		 549 aa  746    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0334  ATP synthase F1, alpha subunit  70.83 
 
 		 546 aa  772    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.297297 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0146  ATP synthase F1, alpha subunit  64.65 
 
 		 553 aa  706    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.445327 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3918  ATP synthase F1, alpha subunit  67.96 
 
 		 546 aa  751    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2340  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.9 
 
 		 545 aa  714    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125145 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3709  F0F1 ATP synthase subunit alpha  67.22 
 
 		 552 aa  734    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1125  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65 
 
 		 543 aa  701    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.826073  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1022  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.73 
 
 		 553 aa  732    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11335  F0F1 ATP synthase subunit alpha  71.08 
 
 		 549 aa  787    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2124  F0F1 ATP synthase subunit alpha  70.3 
 
 		 547 aa  780    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00337947  hitchhiker  0.00781719 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1776  F0F1 ATP synthase subunit alpha  69.25 
 
 		 543 aa  726    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.984214 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1216  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.46 
 
 		 544 aa  759    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29570  F0F1 ATP synthase subunit alpha  69.93 
 
 		 548 aa  796    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3952  F0F1 ATP synthase subunit alpha  70.11 
 
 		 548 aa  793    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0936185  hitchhiker  0.00501194 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3878  F0F1 ATP synthase subunit alpha  70.11 
 
 		 548 aa  793    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18220  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.48 
 
 		 549 aa  733    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.850315  normal  0.256257 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10010  ATP synthase F1 subcomplex alpha subunit  67.72 
 
 		 543 aa  730    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.564506  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1305  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.42 
 
 		 544 aa  732    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.206364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2450  ATP synthase F1, alpha subunit  65.87 
 
 		 543 aa  719    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4138  ATP synthase F1, alpha subunit  66.18 
 
 		 545 aa  741    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.413993  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1314  ATP synthase F1 subunit alpha  68.46 
 
 		 545 aa  742    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.438487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2607  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.1 
 
 		 545 aa  711    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197618  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1253  ATP synthase F1, alpha subunit  100 
 
 		 544 aa  1100    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0274043  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0651  F0F1 ATP synthase subunit alpha  67.1 
 
 		 554 aa  737    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.310941  normal  0.421508 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1797  ATP synthase F1, alpha subunit  59.96 
 
 		 504 aa  588  1e-167  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2829  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.27 
 
 		 502 aa  588  1e-166  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2193  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.69 
 
 		 502 aa  585  1e-166  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17820  ATP synthase F1, alpha subunit  55.21 
 
 		 541 aa  585  1e-166  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0987  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.49 
 
 		 502 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975811  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2380  ATP synthase F1, alpha subunit  56.25 
 
 		 507 aa  582  1.0000000000000001e-165  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0176105 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2332  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.57 
 
 		 526 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2186  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.47 
 
 		 502 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3305  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.95 
 
 		 502 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.694138  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3417  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.14 
 
 		 502 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2846  ATP synthase F1, alpha subunit  55.12 
 
 		 508 aa  578  1e-164  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.525611 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2214  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.49 
 
 		 504 aa  578  1e-164  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.188551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0297  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.43 
 
 		 526 aa  581  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.204325 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2759  ATP synthase F1, alpha subunit  56.39 
 
 		 502 aa  581  1e-164  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0065  ATP synthase F1, alpha subunit  56.3 
 
 		 508 aa  581  1e-164  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0685  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.93 
 
 		 505 aa  577  1.0000000000000001e-163  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.17328  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0174  ATP synthase F1, alpha subunit  56.89 
 
 		 503 aa  577  1.0000000000000001e-163  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.168157  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0262  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.24 
 
 		 526 aa  575  1.0000000000000001e-163  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0489814 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.81 
 
 		 526 aa  578  1.0000000000000001e-163  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1527  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.1 
 
 		 505 aa  576  1.0000000000000001e-163  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000683533  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3827  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.66 
 
 		 502 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4167  F0F1 ATP synthase subunit alpha  54.33 
 
 		 501 aa  574  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.804654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4793  F0F1 ATP synthase subunit alpha  54.62 
 
 		 502 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16301  F0F1 ATP synthase subunit alpha  54.6 
 
 		 505 aa  572  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1492  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.27 
 
 		 505 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0642798  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5432  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.27 
 
 		 502 aa  569  1e-161  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5157  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.27 
 
 		 502 aa  569  1e-161  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4990  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.27 
 
 		 502 aa  569  1e-161  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5007  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.27 
 
 		 502 aa  569  1e-161  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3152  ATP synthase F1, alpha subunit  55.71 
 
 		 501 aa  568  1e-161  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5429  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.08 
 
 		 502 aa  568  1e-161  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.099904  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1985  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56 
 
 		 526 aa  571  1e-161  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.25217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5549  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.27 
 
 		 502 aa  569  1e-161  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.31478  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  54.4 
 
 		 505 aa  570  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0513  ATP synthase F1, alpha subunit  55.14 
 
 		 501 aa  569  1e-161  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1736  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.53 
 
 		 505 aa  570  1e-161  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1014  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.6 
 
 		 502 aa  570  1e-161  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000116673  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15701  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.23 
 
 		 504 aa  568  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.110948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5398  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.27 
 
 		 502 aa  569  1e-161  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2629899999999999e-45 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16411  F0F1 ATP synthase subunit alpha  54.21 
 
 		 505 aa  571  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5522  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.27 
 
 		 502 aa  569  1e-161  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000300598  hitchhiker  0.0000000000000322299 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5485  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.27 
 
 		 502 aa  569  1e-161  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.184326  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16531  F0F1 ATP synthase subunit alpha  54.01 
 
 		 505 aa  570  1e-161  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.592214  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0915  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.4 
 
 		 505 aa  571  1e-161  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0383852  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3172  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.1 
 
 		 502 aa  565  1e-160  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0844597  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1426  ATP synthase F1, alpha subunit  55.58 
 
 		 507 aa  566  1e-160  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0336  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.82 
 
 		 505 aa  565  1e-160  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.120732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5105  F0F1 ATP synthase subunit alpha  54.88 
 
 		 502 aa  566  1e-160  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2199  F0F1 ATP synthase subunit alpha  54.99 
 
 		 505 aa  566  1e-160  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.539772 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1871  F0F1 ATP synthase subunit alpha  54.67 
 
 		 505 aa  565  1e-160  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.798226  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.24 
 
 		 503 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.244084  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1463  ATP synthase F1, alpha subunit  53.94 
 
 		 509 aa  562  1.0000000000000001e-159  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.298107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0201  ATP synthase F1, alpha subunit  55.4 
 
 		 501 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.406681  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1027  ATP synthase F1, alpha subunit  55.01 
 
 		 501 aa  561  1.0000000000000001e-159  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2139  ATP synthase F1, alpha subunit  54.39 
 
 		 507 aa  563  1.0000000000000001e-159  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0947  F0F1 ATP synthase subunit alpha  54.13 
 
 		 502 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0140  F0F1 ATP synthase subunit alpha  54.67 
 
 		 526 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04831  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.38 
 
 		 505 aa  565  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4350  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.06 
 
 		 510 aa  561  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4261  F0F1 ATP synthase subunit alpha  54.51 
 
 		 502 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00501837  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1505  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.92 
 
 		 502 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.56305  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0604  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.92 
 
 		 502 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>