More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_10010 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3918  ATP synthase F1, alpha subunit  74.31 
 
 		 546 aa  825    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4330  F0F1 ATP synthase subunit alpha  70.25 
 
 		 548 aa  761    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.930948  normal  0.0279627 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1919  ATP synthase F1, alpha subunit  67.96 
 
 		 542 aa  744    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.086846  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2409  F0F1 ATP synthase subunit alpha  74.49 
 
 		 547 aa  822    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1125  F0F1 ATP synthase subunit alpha  75.87 
 
 		 543 aa  821    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.826073  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3632  F0F1 ATP synthase subunit alpha  72.66 
 
 		 550 aa  773    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.145338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1268  F0F1 ATP synthase subunit alpha  75.55 
 
 		 552 aa  828    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29570  F0F1 ATP synthase subunit alpha  69.6 
 
 		 548 aa  771    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1305  F0F1 ATP synthase subunit alpha  84.16 
 
 		 544 aa  926    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.206364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6138  F0F1 ATP synthase subunit alpha  74.28 
 
 		 548 aa  781    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3864  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.56 
 
 		 548 aa  761    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.283904  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0146  ATP synthase F1, alpha subunit  74.31 
 
 		 553 aa  815    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.445327 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4138  ATP synthase F1, alpha subunit  71.98 
 
 		 545 aa  789    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.413993  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1314  ATP synthase F1 subunit alpha  71.48 
 
 		 545 aa  758    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.438487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4014  F0F1 ATP synthase subunit alpha  73.05 
 
 		 550 aa  780    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000699734 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3709  F0F1 ATP synthase subunit alpha  72.94 
 
 		 552 aa  770    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1776  F0F1 ATP synthase subunit alpha  86.92 
 
 		 543 aa  944    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.984214 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2124  F0F1 ATP synthase subunit alpha  71.3 
 
 		 547 aa  771    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00337947  hitchhiker  0.00781719 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11335  F0F1 ATP synthase subunit alpha  70.44 
 
 		 549 aa  757    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1022  F0F1 ATP synthase subunit alpha  70.2 
 
 		 553 aa  762    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0334  ATP synthase F1, alpha subunit  76.54 
 
 		 546 aa  825    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.297297 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1070  ATP synthase F1, alpha subunit  88.77 
 
 		 542 aa  978    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0898  ATP synthase F1 subunit alpha  74.72 
 
 		 549 aa  824    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.707906 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1253  ATP synthase F1, alpha subunit  67.72 
 
 		 544 aa  730    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0274043  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3878  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.56 
 
 		 548 aa  761    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1216  F0F1 ATP synthase subunit alpha  72.98 
 
 		 544 aa  815    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2340  F0F1 ATP synthase subunit alpha  76.88 
 
 		 545 aa  859    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125145 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18220  F0F1 ATP synthase subunit alpha  73.59 
 
 		 549 aa  828    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.850315  normal  0.256257 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3952  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.56 
 
 		 548 aa  761    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0936185  hitchhiker  0.00501194 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1761  F0F1 ATP synthase subunit alpha  76.37 
 
 		 547 aa  850    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.743322  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10010  ATP synthase F1 subcomplex alpha subunit  100 
 
 		 543 aa  1091    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.564506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1669  H(+)-transporting two-sector ATPase  72.88 
 
 		 549 aa  808    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2450  ATP synthase F1, alpha subunit  87.32 
 
 		 543 aa  968    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19150  F0F1 ATP synthase subunit alpha  79.63 
 
 		 541 aa  879    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08160  F0F1 ATP synthase subunit alpha  77.76 
 
 		 555 aa  858    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2607  F0F1 ATP synthase subunit alpha  76.19 
 
 		 545 aa  851    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197618  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2316  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.13 
 
 		 548 aa  765    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0651  F0F1 ATP synthase subunit alpha  72.83 
 
 		 554 aa  811    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.310941  normal  0.421508 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1492  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.96 
 
 		 505 aa  622  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0642798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16411  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60 
 
 		 505 aa  619  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16531  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60 
 
 		 505 aa  620  1e-176  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.592214  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0981  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.39 
 
 		 504 aa  613  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16301  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60 
 
 		 505 aa  614  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60 
 
 		 505 aa  613  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3305  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.61 
 
 		 502 aa  609  1e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.694138  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0685  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.57 
 
 		 505 aa  608  1e-173  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.17328  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0336  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.8 
 
 		 505 aa  609  1e-173  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.120732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2186  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.72 
 
 		 502 aa  610  1e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18491  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.2 
 
 		 504 aa  608  1e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.983268 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0065  ATP synthase F1, alpha subunit  59.88 
 
 		 508 aa  608  1e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1527  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.14 
 
 		 505 aa  608  1e-173  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000683533  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3417  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.38 
 
 		 502 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1014  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.8 
 
 		 502 aa  606  9.999999999999999e-173  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000116673  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2829  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.94 
 
 		 502 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2332  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.7 
 
 		 526 aa  605  9.999999999999999e-173  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2193  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.76 
 
 		 502 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15701  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.43 
 
 		 504 aa  607  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.110948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.84 
 
 		 503 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.244084  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0297  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.94 
 
 		 526 aa  606  9.999999999999999e-173  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.204325 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1275  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.84 
 
 		 503 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.588856  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2199  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.59 
 
 		 505 aa  605  9.999999999999999e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.539772 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4793  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.63 
 
 		 502 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0327  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.84 
 
 		 507 aa  602  1.0000000000000001e-171  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1797  ATP synthase F1, alpha subunit  62.02 
 
 		 504 aa  604  1.0000000000000001e-171  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2619  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.92 
 
 		 503 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2720  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.72 
 
 		 503 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3383  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.72 
 
 		 503 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0111242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0292  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.78 
 
 		 507 aa  599  1e-170  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2078  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.12 
 
 		 509 aa  598  1e-170  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.368934 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2611  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.72 
 
 		 506 aa  601  1e-170  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.169882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0987  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.37 
 
 		 502 aa  599  1e-170  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975811  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2214  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.15 
 
 		 504 aa  598  1e-170  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.188551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3152  ATP synthase F1, alpha subunit  59.33 
 
 		 501 aa  599  1e-170  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1679  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.82 
 
 		 510 aa  599  1e-170  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.536422  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17820  ATP synthase F1, alpha subunit  56.07 
 
 		 541 aa  599  1e-170  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04831  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.2 
 
 		 505 aa  599  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3338  ATP synthase F1 subunit alpha  60.12 
 
 		 506 aa  599  1e-170  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5485  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60 
 
 		 502 aa  597  1e-169  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.184326  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5429  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.8 
 
 		 502 aa  595  1e-169  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.099904  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5432  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60 
 
 		 502 aa  597  1e-169  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0173  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.8 
 
 		 510 aa  597  1e-169  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5157  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60 
 
 		 502 aa  597  1e-169  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4990  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60 
 
 		 502 aa  597  1e-169  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5007  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60 
 
 		 502 aa  597  1e-169  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3827  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.61 
 
 		 502 aa  595  1e-169  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1985  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.56 
 
 		 526 aa  597  1e-169  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.25217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0488  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.71 
 
 		 506 aa  595  1e-169  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.294002  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0201  ATP synthase F1, alpha subunit  58.27 
 
 		 501 aa  595  1e-169  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.406681  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5549  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60 
 
 		 502 aa  597  1e-169  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.31478  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2759  ATP synthase F1, alpha subunit  59.02 
 
 		 502 aa  595  1e-169  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0532  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.88 
 
 		 510 aa  595  1e-169  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5105  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.8 
 
 		 502 aa  596  1e-169  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5522  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60 
 
 		 502 aa  596  1e-169  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000300598  hitchhiker  0.0000000000000322299 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0262  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.17 
 
 		 526 aa  596  1e-169  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0489814 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5398  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60 
 
 		 502 aa  597  1e-169  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2629899999999999e-45 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2705  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.56 
 
 		 526 aa  595  1e-169  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.94 
 
 		 526 aa  597  1e-169  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0621  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.35 
 
 		 509 aa  593  1e-168  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.953551 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2141  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.45 
 
 		 502 aa  593  1e-168  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.588965  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2846  ATP synthase F1, alpha subunit  58.82 
 
 		 508 aa  594  1e-168  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.525611 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>