More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2996 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0470  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.85 
 
 		 519 aa  635    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309325  normal  0.152842 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3099  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.02 
 
 		 571 aa  638    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00665351  normal  0.271166 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2996  F0F1 ATP synthase subunit alpha  100 
 
 		 522 aa  1050    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2329  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.83 
 
 		 520 aa  645    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1168  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.46 
 
 		 534 aa  648    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.295877  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0945  alternate F1F0 ATPase, F1 subunit alpha  65.73 
 
 		 585 aa  671    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.670591  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1961  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.01 
 
 		 510 aa  637    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.938875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3056  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.97 
 
 		 517 aa  632  1e-180  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2675  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.3 
 
 		 528 aa  624  1e-177  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1654  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.86 
 
 		 511 aa  619  1e-176  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0895  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.84 
 
 		 508 aa  607  9.999999999999999e-173  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.19048 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1070  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.36 
 
 		 511 aa  598  1e-170  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2846  ATP synthase F1, alpha subunit  54.6 
 
 		 508 aa  529  1e-149  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.525611 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0065  ATP synthase F1, alpha subunit  54.91 
 
 		 508 aa  521  1e-147  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17820  ATP synthase F1, alpha subunit  53.23 
 
 		 541 aa  524  1e-147  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0327  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.21 
 
 		 507 aa  524  1e-147  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4167  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.53 
 
 		 501 aa  518  1e-146  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.804654  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1711  F0F1 ATP synthase subunit alpha  54.72 
 
 		 503 aa  508  1e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3152  ATP synthase F1, alpha subunit  56.56 
 
 		 501 aa  511  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5522  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.62 
 
 		 502 aa  508  1e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000300598  hitchhiker  0.0000000000000322299 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5105  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.83 
 
 		 502 aa  510  1e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0081  ATP synthase F1, alpha subunit  53.39 
 
 		 507 aa  510  1e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1426  ATP synthase F1, alpha subunit  52.63 
 
 		 507 aa  509  1e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.21 
 
 		 502 aa  510  1e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2141  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.21 
 
 		 502 aa  510  1e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.588965  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5429  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.62 
 
 		 502 aa  509  1e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.099904  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3827  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.4 
 
 		 502 aa  511  1e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5432  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.4 
 
 		 502 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5157  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.4 
 
 		 502 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4990  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.4 
 
 		 502 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5007  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.4 
 
 		 502 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1519  ATP synthase F1, alpha subunit  54.24 
 
 		 512 aa  508  9.999999999999999e-143  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.283334  hitchhiker  0.000000000000106657 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5485  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.4 
 
 		 502 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.184326  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3417  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.83 
 
 		 502 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5549  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.4 
 
 		 502 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.31478  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2380  ATP synthase F1, alpha subunit  53.99 
 
 		 507 aa  507  9.999999999999999e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0176105 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5398  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.4 
 
 		 502 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2629899999999999e-45 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3305  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.58 
 
 		 502 aa  504  1e-141  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.694138  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0947  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.78 
 
 		 502 aa  502  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3133  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.78 
 
 		 502 aa  502  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4334  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.6 
 
 		 512 aa  503  1e-141  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00117083  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0519  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.52 
 
 		 501 aa  505  1e-141  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2139  ATP synthase F1, alpha subunit  52.02 
 
 		 507 aa  499  1e-140  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0465  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.4 
 
 		 509 aa  500  1e-140  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.809021  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0201  ATP synthase F1, alpha subunit  50.53 
 
 		 501 aa  501  1e-140  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.406681  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0536  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.63 
 
 		 503 aa  501  1e-140  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.19649  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0562  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.17 
 
 		 503 aa  496  1e-139  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.529195  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0292  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.8 
 
 		 507 aa  498  1e-139  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_501  ATP synthase F1, alpha subunit  54.44 
 
 		 503 aa  496  1e-139  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0562093  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4793  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.52 
 
 		 502 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0336  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.64 
 
 		 505 aa  493  9.999999999999999e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.120732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2384  Sodium-transporting two-sector ATPase  55.13 
 
 		 504 aa  494  9.999999999999999e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1240  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.2 
 
 		 506 aa  494  9.999999999999999e-139  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15701  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.81 
 
 		 504 aa  491  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.110948  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0861  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.93 
 
 		 501 aa  491  1e-137  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0205389  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16531  F0F1 ATP synthase subunit alpha  54.3 
 
 		 505 aa  488  1e-137  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.592214  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.21 
 
 		 505 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.19 
 
 		 503 aa  488  1e-137  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.244084  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16301  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.21 
 
 		 505 aa  491  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16411  F0F1 ATP synthase subunit alpha  54.3 
 
 		 505 aa  488  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3738  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.29 
 
 		 502 aa  489  1e-137  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0747  ATP synthase F1, alpha subunit  49.49 
 
 		 504 aa  489  1e-137  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.873736  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1935  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.14 
 
 		 500 aa  489  1e-137  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1275  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.19 
 
 		 503 aa  488  1e-137  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.588856  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0981  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.36 
 
 		 504 aa  487  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1027  ATP synthase F1, alpha subunit  48.48 
 
 		 501 aa  487  1e-136  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2199  F0F1 ATP synthase subunit alpha  54.97 
 
 		 505 aa  486  1e-136  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.539772 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0685  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.8 
 
 		 505 aa  483  1e-135  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.17328  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1797  ATP synthase F1, alpha subunit  54.01 
 
 		 504 aa  482  1e-135  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1014  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48 
 
 		 502 aa  482  1e-135  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000116673  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4261  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.46 
 
 		 502 aa  483  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00501837  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2188  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.97 
 
 		 506 aa  483  1e-135  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.929468 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18491  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.71 
 
 		 504 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.983268 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0174  ATP synthase F1, alpha subunit  51.16 
 
 		 503 aa  484  1e-135  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.168157  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1736  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.69 
 
 		 505 aa  483  1e-135  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0663  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.69 
 
 		 520 aa  484  1e-135  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0131395  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1871  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.95 
 
 		 505 aa  484  1e-135  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.798226  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2584  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.69 
 
 		 505 aa  483  1e-135  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.341955  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2589  ATP synthase F1, alpha subunit  50.21 
 
 		 513 aa  478  1e-134  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.20493  normal  0.113766 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0915  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.69 
 
 		 505 aa  479  1e-134  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0383852  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2214  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.46 
 
 		 504 aa  479  1e-134  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.188551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6064  ATP synthase F1, alpha subunit  52.51 
 
 		 512 aa  479  1e-134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2606  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.36 
 
 		 506 aa  479  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3172  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.86 
 
 		 502 aa  479  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0844597  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0270  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.89 
 
 		 505 aa  480  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0442  ATP synthase F1, alpha subunit  56.46 
 
 		 509 aa  479  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.237252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2164  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.71 
 
 		 502 aa  478  1e-134  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2759  ATP synthase F1, alpha subunit  49.8 
 
 		 502 aa  480  1e-134  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0604  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.06 
 
 		 502 aa  481  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1505  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.06 
 
 		 502 aa  481  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.56305  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2799  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.49 
 
 		 513 aa  476  1e-133  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0488  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.28 
 
 		 506 aa  478  1e-133  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.294002  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0987  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.37 
 
 		 502 aa  476  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975811  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2193  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.27 
 
 		 502 aa  476  1e-133  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2746  ATP synthase F1, alpha subunit  49.59 
 
 		 513 aa  478  1e-133  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.426504  normal  0.209432 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2619  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.89 
 
 		 503 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0213  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.08 
 
 		 514 aa  478  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2454  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.71 
 
 		 502 aa  478  1e-133  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1527  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.69 
 
 		 505 aa  478  1e-133  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000683533  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4620  ATP synthase F1, alpha subunit  48.92 
 
 		 538 aa  476  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>