More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0442 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0442  ATP synthase F1, alpha subunit  100 
 
 		 509 aa  991    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.237252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0945  alternate F1F0 ATPase, F1 subunit alpha  54.1 
 
 		 585 aa  495  1e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.670591  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2996  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.79 
 
 		 522 aa  491  1e-137  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3056  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.35 
 
 		 517 aa  491  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1070  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.86 
 
 		 511 aa  488  1e-136  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0470  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.97 
 
 		 519 aa  487  1e-136  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309325  normal  0.152842 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2675  F0F1 ATP synthase subunit alpha  54.21 
 
 		 528 aa  484  1e-135  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1654  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.62 
 
 		 511 aa  481  1e-134  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1168  F0F1 ATP synthase subunit alpha  54.75 
 
 		 534 aa  479  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.295877  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1961  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.65 
 
 		 510 aa  478  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.938875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2329  F0F1 ATP synthase subunit alpha  54.35 
 
 		 520 aa  474  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3099  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.27 
 
 		 571 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00665351  normal  0.271166 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0895  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.38 
 
 		 508 aa  459  9.999999999999999e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.19048 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2846  ATP synthase F1, alpha subunit  48.54 
 
 		 508 aa  457  1e-127  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.525611 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2380  ATP synthase F1, alpha subunit  52 
 
 		 507 aa  458  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0176105 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1519  ATP synthase F1, alpha subunit  47.44 
 
 		 512 aa  457  1e-127  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.283334  hitchhiker  0.000000000000106657 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1275  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.22 
 
 		 503 aa  450  1e-125  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.588856  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3383  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.39 
 
 		 503 aa  448  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0111242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0327  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.31 
 
 		 507 aa  449  1e-125  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.22 
 
 		 503 aa  450  1e-125  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.244084  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2720  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.39 
 
 		 503 aa  448  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2619  F0F1 ATP synthase subunit alpha  46.47 
 
 		 503 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1426  ATP synthase F1, alpha subunit  49.55 
 
 		 507 aa  445  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0292  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.29 
 
 		 507 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4167  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.76 
 
 		 501 aa  444  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.804654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3152  ATP synthase F1, alpha subunit  49.56 
 
 		 501 aa  442  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17820  ATP synthase F1, alpha subunit  52.11 
 
 		 541 aa  441  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0536  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50 
 
 		 503 aa  439  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.19649  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2606  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.79 
 
 		 506 aa  440  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1492  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.84 
 
 		 505 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0642798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4793  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.89 
 
 		 502 aa  436  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0065  ATP synthase F1, alpha subunit  51.54 
 
 		 508 aa  436  1e-121  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0562  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.53 
 
 		 503 aa  434  1e-120  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.529195  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0111  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50 
 
 		 503 aa  432  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1711  F0F1 ATP synthase subunit alpha  46.65 
 
 		 503 aa  434  1e-120  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2141  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.71 
 
 		 502 aa  434  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.588965  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3172  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.32 
 
 		 502 aa  434  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0844597  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0981  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50 
 
 		 504 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16301  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.71 
 
 		 505 aa  433  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3408  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.24 
 
 		 503 aa  433  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.14914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0297  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.42 
 
 		 526 aa  432  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.204325 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_501  ATP synthase F1, alpha subunit  49.3 
 
 		 503 aa  433  1e-120  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0562093  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.71 
 
 		 502 aa  434  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1620  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.25 
 
 		 504 aa  433  1e-120  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0802007  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15701  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.76 
 
 		 504 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.110948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3827  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.69 
 
 		 502 aa  434  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1505  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.59 
 
 		 502 aa  434  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.56305  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0604  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.59 
 
 		 502 aa  434  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3417  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.23 
 
 		 502 aa  432  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3305  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.23 
 
 		 502 aa  434  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.694138  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5398  F0F1 ATP synthase subunit alpha  46.85 
 
 		 502 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2629899999999999e-45 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5522  F0F1 ATP synthase subunit alpha  46.85 
 
 		 502 aa  431  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000300598  hitchhiker  0.0000000000000322299 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5432  F0F1 ATP synthase subunit alpha  46.85 
 
 		 502 aa  431  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5429  F0F1 ATP synthase subunit alpha  46.85 
 
 		 502 aa  431  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.099904  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5157  F0F1 ATP synthase subunit alpha  46.85 
 
 		 502 aa  431  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4990  F0F1 ATP synthase subunit alpha  46.85 
 
 		 502 aa  431  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5007  F0F1 ATP synthase subunit alpha  46.85 
 
 		 502 aa  431  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.32 
 
 		 526 aa  430  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0685  F0F1 ATP synthase subunit alpha  46.74 
 
 		 505 aa  431  1e-119  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.17328  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18491  F0F1 ATP synthase subunit alpha  45.97 
 
 		 504 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.983268 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5549  F0F1 ATP synthase subunit alpha  46.85 
 
 		 502 aa  431  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.31478  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50 
 
 		 505 aa  431  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0174  ATP synthase F1, alpha subunit  50.82 
 
 		 503 aa  431  1e-119  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.168157  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4620  ATP synthase F1, alpha subunit  48.06 
 
 		 538 aa  430  1e-119  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4334  F0F1 ATP synthase subunit alpha  45.79 
 
 		 512 aa  431  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00117083  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4261  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.05 
 
 		 502 aa  429  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00501837  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2454  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.41 
 
 		 502 aa  430  1e-119  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2164  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.41 
 
 		 502 aa  430  1e-119  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5105  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.54 
 
 		 502 aa  430  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5485  F0F1 ATP synthase subunit alpha  46.85 
 
 		 502 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.184326  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0081  ATP synthase F1, alpha subunit  50.82 
 
 		 507 aa  430  1e-119  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2584  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.81 
 
 		 505 aa  430  1e-119  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.341955  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3738  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.25 
 
 		 502 aa  427  1e-118  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4037  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.29 
 
 		 502 aa  426  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00278502 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2214  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.82 
 
 		 504 aa  427  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.188551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0465  F0F1 ATP synthase subunit alpha  46.26 
 
 		 509 aa  426  1e-118  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.809021  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0201  ATP synthase F1, alpha subunit  47.19 
 
 		 501 aa  426  1e-118  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.406681  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0947  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.88 
 
 		 502 aa  425  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3133  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.88 
 
 		 502 aa  425  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0140  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.42 
 
 		 526 aa  428  1e-118  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0987  F0F1 ATP synthase subunit alpha  45.56 
 
 		 502 aa  427  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975811  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0336  F0F1 ATP synthase subunit alpha  45.49 
 
 		 505 aa  427  1e-118  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.120732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2139  ATP synthase F1, alpha subunit  51.53 
 
 		 507 aa  426  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0082  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.65 
 
 		 525 aa  427  1e-118  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1640  ATP synthase F1, alpha subunit  48.5 
 
 		 526 aa  426  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2384  Sodium-transporting two-sector ATPase  50.59 
 
 		 504 aa  428  1e-118  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86570  F1F0-ATPase complex, F1 alpha subunit  46.7 
 
 		 545 aa  428  1e-118  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3952  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.29 
 
 		 502 aa  426  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.116029  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0747  ATP synthase F1, alpha subunit  48.71 
 
 		 504 aa  423  1e-117  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.873736  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2409  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.53 
 
 		 547 aa  422  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0513  ATP synthase F1, alpha subunit  48.12 
 
 		 501 aa  424  1e-117  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2759  ATP synthase F1, alpha subunit  50.34 
 
 		 502 aa  422  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3338  ATP synthase F1 subunit alpha  46.35 
 
 		 506 aa  422  1e-117  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1405  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.47 
 
 		 505 aa  424  1e-117  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0699258  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16411  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.29 
 
 		 505 aa  425  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0605  F0F1 ATP synthase subunit alpha  45.79 
 
 		 510 aa  422  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.404784  normal  0.651766 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2705  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.42 
 
 		 526 aa  424  1e-117  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2199  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.53 
 
 		 505 aa  425  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.539772 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1736  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.37 
 
 		 505 aa  423  1e-117  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1027  ATP synthase F1, alpha subunit  50.84 
 
 		 501 aa  424  1e-117  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>