More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1168 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2329  F0F1 ATP synthase subunit alpha  81.3 
 
 		 520 aa  841    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0895  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.74 
 
 		 508 aa  670    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.19048 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3099  F0F1 ATP synthase subunit alpha  76.33 
 
 		 571 aa  814    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00665351  normal  0.271166 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1961  F0F1 ATP synthase subunit alpha  77.4 
 
 		 510 aa  805    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.938875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2996  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.46 
 
 		 522 aa  662    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1070  F0F1 ATP synthase subunit alpha  67.99 
 
 		 511 aa  682    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1654  F0F1 ATP synthase subunit alpha  71.03 
 
 		 511 aa  728    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0470  F0F1 ATP synthase subunit alpha  73.67 
 
 		 519 aa  771    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309325  normal  0.152842 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0945  alternate F1F0 ATPase, F1 subunit alpha  83.93 
 
 		 585 aa  849    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.670591  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1168  F0F1 ATP synthase subunit alpha  100 
 
 		 534 aa  1071    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.295877  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2675  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.16 
 
 		 528 aa  702    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3056  F0F1 ATP synthase subunit alpha  77.2 
 
 		 517 aa  798    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2846  ATP synthase F1, alpha subunit  53.65 
 
 		 508 aa  526  1e-148  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.525611 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0065  ATP synthase F1, alpha subunit  51.4 
 
 		 508 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1519  ATP synthase F1, alpha subunit  51.32 
 
 		 512 aa  514  1e-144  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.283334  hitchhiker  0.000000000000106657 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0747  ATP synthase F1, alpha subunit  51.46 
 
 		 504 aa  508  1e-143  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.873736  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3738  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.25 
 
 		 502 aa  509  1e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0081  ATP synthase F1, alpha subunit  52.28 
 
 		 507 aa  505  9.999999999999999e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0327  F0F1 ATP synthase subunit alpha  54.57 
 
 		 507 aa  506  9.999999999999999e-143  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0536  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.11 
 
 		 503 aa  506  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.19649  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0292  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.51 
 
 		 507 aa  502  1e-141  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17820  ATP synthase F1, alpha subunit  50.31 
 
 		 541 aa  503  1e-141  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0562  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.11 
 
 		 503 aa  499  1e-140  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.529195  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_501  ATP synthase F1, alpha subunit  53.24 
 
 		 503 aa  501  1e-140  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0562093  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2139  ATP synthase F1, alpha subunit  56.74 
 
 		 507 aa  496  1e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0336  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50 
 
 		 505 aa  498  1e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.120732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1426  ATP synthase F1, alpha subunit  51.88 
 
 		 507 aa  496  1e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.58 
 
 		 502 aa  495  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2141  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.58 
 
 		 502 aa  495  1e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.588965  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1711  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.16 
 
 		 503 aa  494  9.999999999999999e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3152  ATP synthase F1, alpha subunit  52.47 
 
 		 501 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2380  ATP synthase F1, alpha subunit  50.51 
 
 		 507 aa  495  9.999999999999999e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0176105 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3827  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.81 
 
 		 502 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0519  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.56 
 
 		 501 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5105  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.61 
 
 		 502 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5429  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.4 
 
 		 502 aa  491  1e-137  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.099904  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5522  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.4 
 
 		 502 aa  490  1e-137  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000300598  hitchhiker  0.0000000000000322299 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5432  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.2 
 
 		 502 aa  489  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5157  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.2 
 
 		 502 aa  489  1e-137  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4990  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.2 
 
 		 502 aa  489  1e-137  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5007  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.2 
 
 		 502 aa  489  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1275  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.46 
 
 		 503 aa  488  1e-137  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.588856  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.46 
 
 		 503 aa  488  1e-137  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.244084  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5485  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.2 
 
 		 502 aa  489  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.184326  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5549  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.2 
 
 		 502 aa  489  1e-137  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.31478  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3305  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.47 
 
 		 502 aa  489  1e-137  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.694138  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5398  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.2 
 
 		 502 aa  489  1e-137  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2629899999999999e-45 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4167  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.21 
 
 		 501 aa  488  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.804654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4334  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.23 
 
 		 512 aa  491  1e-137  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00117083  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4505  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.56 
 
 		 510 aa  485  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0174  ATP synthase F1, alpha subunit  50.62 
 
 		 503 aa  486  1e-136  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.168157  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0465  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.38 
 
 		 509 aa  486  1e-136  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.809021  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4486  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.33 
 
 		 510 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0201  ATP synthase F1, alpha subunit  52.26 
 
 		 501 aa  483  1e-135  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.406681  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4350  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.2 
 
 		 510 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2619  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.32 
 
 		 503 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16411  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.9 
 
 		 505 aa  484  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1797  ATP synthase F1, alpha subunit  52.63 
 
 		 504 aa  483  1e-135  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16301  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.78 
 
 		 505 aa  482  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15701  F0F1 ATP synthase subunit alpha  54 
 
 		 504 aa  484  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.110948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4793  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.87 
 
 		 502 aa  484  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16531  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.69 
 
 		 505 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.592214  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3417  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.02 
 
 		 502 aa  484  1e-135  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04831  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.61 
 
 		 505 aa  482  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0297  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.26 
 
 		 526 aa  479  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.204325 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0513  ATP synthase F1, alpha subunit  50.66 
 
 		 501 aa  479  1e-134  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0442  ATP synthase F1, alpha subunit  55.6 
 
 		 509 aa  479  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.237252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4497  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.44 
 
 		 512 aa  478  1e-134  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.694909  normal  0.0411828 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1492  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.31 
 
 		 505 aa  480  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0642798  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3338  ATP synthase F1 subunit alpha  52.89 
 
 		 506 aa  481  1e-134  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.1 
 
 		 505 aa  480  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2199  F0F1 ATP synthase subunit alpha  54.44 
 
 		 505 aa  481  1e-134  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.539772 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1240  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.86 
 
 		 506 aa  481  1e-134  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0861  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.67 
 
 		 501 aa  477  1e-133  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0205389  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1014  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.99 
 
 		 502 aa  476  1e-133  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000116673  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl113  F0F1 ATP synthase subunit alpha  46.36 
 
 		 525 aa  475  1e-133  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6523  ATP synthase F1, alpha subunit  52.75 
 
 		 524 aa  476  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0981  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.72 
 
 		 504 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2611  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.78 
 
 		 506 aa  476  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.169882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0685  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.99 
 
 		 505 aa  476  1e-133  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.17328  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3952  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.4 
 
 		 548 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0936185  hitchhiker  0.00501194 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2720  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.11 
 
 		 503 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3864  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.4 
 
 		 548 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.283904  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3878  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.4 
 
 		 548 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2759  ATP synthase F1, alpha subunit  48.3 
 
 		 502 aa  476  1e-133  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2454  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.86 
 
 		 502 aa  476  1e-133  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2164  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.86 
 
 		 502 aa  477  1e-133  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3383  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.11 
 
 		 503 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0111242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1935  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.72 
 
 		 500 aa  476  1e-133  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0663  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.01 
 
 		 520 aa  476  1e-133  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0131395  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1871  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.85 
 
 		 505 aa  476  1e-133  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.798226  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  46.26 
 
 		 526 aa  473  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2799  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.97 
 
 		 513 aa  474  1e-132  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0947  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.17 
 
 		 502 aa  473  1e-132  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0987  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.67 
 
 		 522 aa  474  1e-132  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.746829 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0308  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.44 
 
 		 513 aa  472  1e-132  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0176346  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0082  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.33 
 
 		 525 aa  474  1e-132  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1736  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.88 
 
 		 505 aa  473  1e-132  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18491  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.49 
 
 		 504 aa  472  1e-132  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.983268 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2384  Sodium-transporting two-sector ATPase  48.15 
 
 		 504 aa  474  1e-132  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>