More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3056 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0470  F0F1 ATP synthase subunit alpha  70 
 
 		 519 aa  716    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309325  normal  0.152842 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3099  F0F1 ATP synthase subunit alpha  71.4 
 
 		 571 aa  735    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00665351  normal  0.271166 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1961  F0F1 ATP synthase subunit alpha  80.8 
 
 		 510 aa  820    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.938875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1070  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.19 
 
 		 511 aa  664    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1654  F0F1 ATP synthase subunit alpha  70.94 
 
 		 511 aa  731    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0895  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.82 
 
 		 508 aa  666    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.19048 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2329  F0F1 ATP synthase subunit alpha  72.24 
 
 		 520 aa  753    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1168  F0F1 ATP synthase subunit alpha  77.2 
 
 		 534 aa  780    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.295877  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2675  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.22 
 
 		 528 aa  698    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3056  F0F1 ATP synthase subunit alpha  100 
 
 		 517 aa  1042    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0945  alternate F1F0 ATPase, F1 subunit alpha  75.69 
 
 		 585 aa  791    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.670591  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2996  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.97 
 
 		 522 aa  632  1e-180  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17820  ATP synthase F1, alpha subunit  50.6 
 
 		 541 aa  522  1e-147  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0081  ATP synthase F1, alpha subunit  55.39 
 
 		 507 aa  521  1e-147  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0065  ATP synthase F1, alpha subunit  50.1 
 
 		 508 aa  518  1e-146  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0747  ATP synthase F1, alpha subunit  48.73 
 
 		 504 aa  515  1.0000000000000001e-145  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.873736  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2846  ATP synthase F1, alpha subunit  49.11 
 
 		 508 aa  513  1e-144  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.525611 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2139  ATP synthase F1, alpha subunit  51.98 
 
 		 507 aa  509  1e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1519  ATP synthase F1, alpha subunit  50 
 
 		 512 aa  508  1e-143  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.283334  hitchhiker  0.000000000000106657 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2380  ATP synthase F1, alpha subunit  50.2 
 
 		 507 aa  507  9.999999999999999e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0176105 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0336  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.84 
 
 		 505 aa  503  1e-141  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.120732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0292  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.09 
 
 		 507 aa  499  1e-140  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0327  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.09 
 
 		 507 aa  499  1e-140  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4793  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.48 
 
 		 502 aa  499  1e-140  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16301  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.14 
 
 		 505 aa  497  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.21 
 
 		 505 aa  497  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1275  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.59 
 
 		 503 aa  498  1e-139  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.588856  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15701  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.11 
 
 		 504 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.110948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4334  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.23 
 
 		 512 aa  495  1e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00117083  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3827  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.69 
 
 		 502 aa  498  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.59 
 
 		 503 aa  498  1e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.244084  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0562  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.22 
 
 		 503 aa  493  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.529195  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3152  ATP synthase F1, alpha subunit  50.86 
 
 		 501 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5432  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.06 
 
 		 502 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5157  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.06 
 
 		 502 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4990  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.06 
 
 		 502 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5007  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.06 
 
 		 502 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16531  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50 
 
 		 505 aa  494  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.592214  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_501  ATP synthase F1, alpha subunit  50.44 
 
 		 503 aa  493  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0562093  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5485  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.06 
 
 		 502 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.184326  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2720  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.95 
 
 		 503 aa  494  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5549  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.06 
 
 		 502 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.31478  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5105  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.86 
 
 		 502 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16411  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50 
 
 		 505 aa  494  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5429  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.86 
 
 		 502 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.099904  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0297  F0F1 ATP synthase subunit alpha  46.35 
 
 		 526 aa  492  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.204325 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1492  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.21 
 
 		 505 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0642798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5522  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.06 
 
 		 502 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000300598  hitchhiker  0.0000000000000322299 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5398  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.06 
 
 		 502 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2629899999999999e-45 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3383  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.95 
 
 		 503 aa  494  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0111242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0519  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.69 
 
 		 501 aa  494  9.999999999999999e-139  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0536  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.11 
 
 		 503 aa  490  1e-137  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.19649  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0262  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.5 
 
 		 526 aa  490  1e-137  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0489814 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3417  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.58 
 
 		 502 aa  490  1e-137  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0947  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.21 
 
 		 502 aa  488  1e-137  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3133  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.21 
 
 		 502 aa  488  1e-137  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2619  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.11 
 
 		 503 aa  491  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3305  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.99 
 
 		 502 aa  491  1e-137  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.694138  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0174  ATP synthase F1, alpha subunit  51.43 
 
 		 503 aa  491  1e-137  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.168157  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1711  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.65 
 
 		 503 aa  488  1e-136  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04831  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.9 
 
 		 505 aa  485  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1426  ATP synthase F1, alpha subunit  49.9 
 
 		 507 aa  488  1e-136  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4167  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.17 
 
 		 501 aa  487  1e-136  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.804654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1027  ATP synthase F1, alpha subunit  48.12 
 
 		 501 aa  487  1e-136  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1640  ATP synthase F1, alpha subunit  49.1 
 
 		 526 aa  485  1e-136  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1014  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.88 
 
 		 502 aa  486  1e-136  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000116673  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1797  ATP synthase F1, alpha subunit  51.14 
 
 		 504 aa  483  1e-135  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0981  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.35 
 
 		 504 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2611  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.88 
 
 		 506 aa  484  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.169882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0140  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.68 
 
 		 526 aa  484  1e-135  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3864  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.26 
 
 		 548 aa  482  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.283904  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3738  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.06 
 
 		 502 aa  484  1e-135  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.44 
 
 		 502 aa  483  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0201  ATP synthase F1, alpha subunit  48.7 
 
 		 501 aa  482  1e-135  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.406681  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  46.72 
 
 		 526 aa  484  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3878  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.26 
 
 		 548 aa  482  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2454  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.66 
 
 		 502 aa  482  1e-135  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2164  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.66 
 
 		 502 aa  483  1e-135  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2141  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.44 
 
 		 502 aa  483  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.588965  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3952  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.26 
 
 		 548 aa  482  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0936185  hitchhiker  0.00501194 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1505  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.02 
 
 		 502 aa  480  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.56305  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0604  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.02 
 
 		 502 aa  480  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0442  ATP synthase F1, alpha subunit  53.35 
 
 		 509 aa  481  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.237252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0465  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.79 
 
 		 509 aa  481  1e-134  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.809021  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1978  ATP synthase F1, alpha subunit  50.51 
 
 		 499 aa  481  1e-134  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0601  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.69 
 
 		 505 aa  479  1e-134  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00209636  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2606  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.4 
 
 		 506 aa  479  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2384  Sodium-transporting two-sector ATPase  45.71 
 
 		 504 aa  479  1e-134  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2705  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.98 
 
 		 526 aa  480  1e-134  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11335  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.29 
 
 		 549 aa  481  1e-134  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0861  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.33 
 
 		 501 aa  476  1e-133  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0205389  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4620  ATP synthase F1, alpha subunit  50 
 
 		 538 aa  476  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0987  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.12 
 
 		 522 aa  477  1e-133  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.746829 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2316  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.59 
 
 		 548 aa  476  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1985  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.47 
 
 		 526 aa  478  1e-133  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.25217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0488  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.47 
 
 		 506 aa  477  1e-133  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.294002  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2188  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.33 
 
 		 506 aa  477  1e-133  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.929468 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18491  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.13 
 
 		 504 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.983268 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2199  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.25 
 
 		 505 aa  478  1e-133  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.539772 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2759  ATP synthase F1, alpha subunit  47.14 
 
 		 502 aa  478  1e-133  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>