More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0470 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_2329  F0F1 ATP synthase subunit alpha  71.6 
 
 
520 aa  743    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1961  F0F1 ATP synthase subunit alpha  70.02 
 
 
510 aa  706    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.938875  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3099  F0F1 ATP synthase subunit alpha  70.08 
 
 
571 aa  706    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00665351  normal  0.271166 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2996  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.85 
 
 
522 aa  635    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0470  F0F1 ATP synthase subunit alpha  100 
 
 
519 aa  1050    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309325  normal  0.152842 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1070  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.5 
 
 
511 aa  637    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1654  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.31 
 
 
511 aa  665    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0945  alternate F1F0 ATPase, F1 subunit alpha  72.06 
 
 
585 aa  734    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.670591  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0895  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.55 
 
 
508 aa  637    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.19048 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1168  F0F1 ATP synthase subunit alpha  73.67 
 
 
534 aa  761    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.295877  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2675  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.14 
 
 
528 aa  669    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3056  F0F1 ATP synthase subunit alpha  70 
 
 
517 aa  716    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0327  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.32 
 
 
507 aa  506  9.999999999999999e-143  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0747  ATP synthase F1, alpha subunit  52.48 
 
 
504 aa  504  1e-141  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.873736  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2846  ATP synthase F1, alpha subunit  50.74 
 
 
508 aa  501  1e-141  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.525611 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1519  ATP synthase F1, alpha subunit  51.47 
 
 
512 aa  501  1e-140  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.283334  hitchhiker  0.000000000000106657 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17820  ATP synthase F1, alpha subunit  53.52 
 
 
541 aa  499  1e-140  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3417  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.69 
 
 
502 aa  497  1e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0292  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.43 
 
 
507 aa  496  1e-139  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3305  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.48 
 
 
502 aa  496  1e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.694138  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2380  ATP synthase F1, alpha subunit  51.71 
 
 
507 aa  489  1e-137  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0176105 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0081  ATP synthase F1, alpha subunit  53.76 
 
 
507 aa  488  1e-136  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3738  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.1 
 
 
502 aa  486  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5429  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.04 
 
 
502 aa  485  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.099904  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1014  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.63 
 
 
502 aa  486  1e-136  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000116673  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5105  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.25 
 
 
502 aa  486  1e-136  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0519  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.75 
 
 
501 aa  486  1e-136  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0562  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.37 
 
 
503 aa  483  1e-135  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.529195  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3827  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.04 
 
 
502 aa  483  1e-135  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5432  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.83 
 
 
502 aa  484  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5157  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.83 
 
 
502 aa  484  1e-135  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4990  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.83 
 
 
502 aa  484  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5007  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.83 
 
 
502 aa  484  1e-135  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5398  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.83 
 
 
502 aa  484  1e-135  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2629899999999999e-45 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5522  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.83 
 
 
502 aa  483  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000300598  hitchhiker  0.0000000000000322299 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0065  ATP synthase F1, alpha subunit  49.06 
 
 
508 aa  484  1e-135  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5549  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.83 
 
 
502 aa  484  1e-135  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.31478  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5485  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.83 
 
 
502 aa  484  1e-135  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.184326  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1711  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.14 
 
 
503 aa  479  1e-134  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4167  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.75 
 
 
501 aa  479  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.804654  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0442  ATP synthase F1, alpha subunit  56.67 
 
 
509 aa  480  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.237252  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2141  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.87 
 
 
502 aa  480  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.588965  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0336  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.86 
 
 
505 aa  479  1e-134  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.120732  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1426  ATP synthase F1, alpha subunit  51.35 
 
 
507 aa  479  1e-134  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0536  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.47 
 
 
503 aa  479  1e-134  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.19649  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_501  ATP synthase F1, alpha subunit  51.69 
 
 
503 aa  481  1e-134  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0562093  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.87 
 
 
502 aa  480  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2759  ATP synthase F1, alpha subunit  48.55 
 
 
502 aa  475  1e-133  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0174  ATP synthase F1, alpha subunit  50.11 
 
 
503 aa  475  1e-133  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.168157  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2139  ATP synthase F1, alpha subunit  51.99 
 
 
507 aa  477  1e-133  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4334  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.54 
 
 
512 aa  477  1e-133  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00117083  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.32 
 
 
503 aa  477  1e-133  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.244084  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1275  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.32 
 
 
503 aa  477  1e-133  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.588856  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4793  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.93 
 
 
502 aa  473  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0861  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.26 
 
 
501 aa  473  1e-132  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0205389  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0465  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.25 
 
 
509 aa  474  1e-132  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.809021  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1240  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.44 
 
 
506 aa  474  1e-132  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2619  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.56 
 
 
503 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3152  ATP synthase F1, alpha subunit  50 
 
 
501 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1492  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.41 
 
 
505 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0642798  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0201  ATP synthase F1, alpha subunit  48.64 
 
 
501 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.406681  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2199  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.14 
 
 
505 aa  469  1.0000000000000001e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.539772 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2611  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.83 
 
 
506 aa  466  9.999999999999999e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.169882  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0947  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.07 
 
 
502 aa  468  9.999999999999999e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3133  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.07 
 
 
502 aa  468  9.999999999999999e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3864  F0F1 ATP synthase subunit alpha  46.23 
 
 
548 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.283904  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3878  F0F1 ATP synthase subunit alpha  46.23 
 
 
548 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1640  ATP synthase F1, alpha subunit  48.96 
 
 
526 aa  466  9.999999999999999e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3952  F0F1 ATP synthase subunit alpha  46.23 
 
 
548 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0936185  hitchhiker  0.00501194 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2584  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.79 
 
 
505 aa  468  9.999999999999999e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.341955  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2606  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.58 
 
 
506 aa  464  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1027  ATP synthase F1, alpha subunit  50 
 
 
501 aa  464  1e-129  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16531  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.7 
 
 
505 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.592214  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4070  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.48 
 
 
517 aa  463  1e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0283869  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0488  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.56 
 
 
506 aa  464  1e-129  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.294002  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0297  F0F1 ATP synthase subunit alpha  46.11 
 
 
526 aa  462  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.204325 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0685  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.24 
 
 
505 aa  464  1e-129  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.17328  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0132  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.58 
 
 
509 aa  463  1e-129  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3383  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.89 
 
 
503 aa  462  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0111242  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2720  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.89 
 
 
503 aa  462  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3338  ATP synthase F1 subunit alpha  49.05 
 
 
506 aa  462  1e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0663  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.76 
 
 
520 aa  465  1e-129  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0131395  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0604  F0F1 ATP synthase subunit alpha  46.61 
 
 
502 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16301  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.91 
 
 
505 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16411  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.7 
 
 
505 aa  461  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0514  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.14 
 
 
527 aa  461  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.709885  normal  0.673527 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1468  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.66 
 
 
509 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.184879 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0987  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.58 
 
 
522 aa  460  9.999999999999999e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.746829 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1505  F0F1 ATP synthase subunit alpha  46.61 
 
 
502 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.56305  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4620  ATP synthase F1, alpha subunit  52.79 
 
 
538 aa  460  9.999999999999999e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1746  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.66 
 
 
509 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal  0.129066 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2384  Sodium-transporting two-sector ATPase  47.08 
 
 
504 aa  461  9.999999999999999e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1467  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.54 
 
 
509 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1871  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.84 
 
 
505 aa  461  9.999999999999999e-129  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.798226  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0981  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.84 
 
 
504 aa  455  1e-127  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0083  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.97 
 
 
509 aa  457  1e-127  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.7 
 
 
505 aa  457  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1267  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.33 
 
 
526 aa  456  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.793474  normal  0.559767 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0082  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.81 
 
 
525 aa  456  1e-127  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18491  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.28 
 
 
504 aa  455  1e-127  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.983268 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>