More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2675 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_2329  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.54 
 
 
520 aa  693    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0470  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.14 
 
 
519 aa  669    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309325  normal  0.152842 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0895  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.1 
 
 
508 aa  648    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.19048 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3099  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64 
 
 
571 aa  670    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00665351  normal  0.271166 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1654  F0F1 ATP synthase subunit alpha  63.53 
 
 
511 aa  671    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1961  F0F1 ATP synthase subunit alpha  67.6 
 
 
510 aa  710    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.938875  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1168  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.16 
 
 
534 aa  697    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.295877  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0945  alternate F1F0 ATPase, F1 subunit alpha  64.53 
 
 
585 aa  702    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.670591  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2675  F0F1 ATP synthase subunit alpha  100 
 
 
528 aa  1073    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3056  F0F1 ATP synthase subunit alpha  65.22 
 
 
517 aa  698    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1070  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.48 
 
 
511 aa  632  1e-180  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2996  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.3 
 
 
522 aa  624  1e-177  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0065  ATP synthase F1, alpha subunit  50.83 
 
 
508 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2846  ATP synthase F1, alpha subunit  51.68 
 
 
508 aa  514  1e-144  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.525611 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17820  ATP synthase F1, alpha subunit  55.69 
 
 
541 aa  505  9.999999999999999e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1519  ATP synthase F1, alpha subunit  50.82 
 
 
512 aa  503  1e-141  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.283334  hitchhiker  0.000000000000106657 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_501  ATP synthase F1, alpha subunit  54.21 
 
 
503 aa  499  1e-140  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0562093  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0536  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.47 
 
 
503 aa  501  1e-140  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.19649  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0081  ATP synthase F1, alpha subunit  53.56 
 
 
507 aa  497  1e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0562  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.24 
 
 
503 aa  498  1e-139  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.529195  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2380  ATP synthase F1, alpha subunit  53.29 
 
 
507 aa  497  1e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0176105 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3827  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.32 
 
 
502 aa  496  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4167  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.08 
 
 
501 aa  495  1e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.804654  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5522  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.68 
 
 
502 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000300598  hitchhiker  0.0000000000000322299 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5432  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.68 
 
 
502 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5157  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.68 
 
 
502 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4990  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.68 
 
 
502 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5007  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.68 
 
 
502 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3738  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.89 
 
 
502 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5398  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.68 
 
 
502 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2629899999999999e-45 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5549  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.68 
 
 
502 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.31478  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0747  ATP synthase F1, alpha subunit  50 
 
 
504 aa  494  9.999999999999999e-139  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.873736  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5485  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.68 
 
 
502 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.184326  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0292  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.09 
 
 
507 aa  489  1e-137  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5429  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.47 
 
 
502 aa  491  1e-137  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.099904  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5105  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.86 
 
 
502 aa  489  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0327  F0F1 ATP synthase subunit alpha  54.86 
 
 
507 aa  489  1e-137  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0519  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.94 
 
 
501 aa  489  1e-137  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0947  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.87 
 
 
502 aa  486  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3133  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.87 
 
 
502 aa  486  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3305  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.4 
 
 
502 aa  488  1e-136  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.694138  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1014  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.56 
 
 
502 aa  486  1e-136  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000116673  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3417  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.17 
 
 
502 aa  485  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1711  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.45 
 
 
503 aa  484  1e-135  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1426  ATP synthase F1, alpha subunit  53.63 
 
 
507 aa  484  1e-135  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4620  ATP synthase F1, alpha subunit  53.29 
 
 
538 aa  484  1e-135  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0336  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.26 
 
 
505 aa  484  1e-135  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.120732  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.91 
 
 
502 aa  483  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3152  ATP synthase F1, alpha subunit  47.14 
 
 
501 aa  484  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4793  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.84 
 
 
502 aa  483  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2141  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.91 
 
 
502 aa  483  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.588965  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0861  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.1 
 
 
501 aa  481  1e-134  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0205389  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl113  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.15 
 
 
525 aa  481  1e-134  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.52 
 
 
503 aa  479  1e-134  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.244084  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0465  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.9 
 
 
509 aa  479  1e-134  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.809021  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0442  ATP synthase F1, alpha subunit  54.55 
 
 
509 aa  479  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.237252  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4334  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.82 
 
 
512 aa  480  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00117083  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1275  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.52 
 
 
503 aa  479  1e-134  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.588856  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3383  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.22 
 
 
503 aa  478  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0111242  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2720  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.22 
 
 
503 aa  478  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0082  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.58 
 
 
525 aa  476  1e-133  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1027  ATP synthase F1, alpha subunit  53.86 
 
 
501 aa  475  1e-133  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1240  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.37 
 
 
506 aa  478  1e-133  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0174  ATP synthase F1, alpha subunit  53.08 
 
 
503 aa  475  1e-133  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.168157  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2619  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.03 
 
 
503 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4261  F0F1 ATP synthase subunit alpha  46.23 
 
 
502 aa  473  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00501837  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3952  F0F1 ATP synthase subunit alpha  45.29 
 
 
548 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0936185  hitchhiker  0.00501194 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0297  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.77 
 
 
526 aa  472  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.204325 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2611  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.45 
 
 
506 aa  473  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.169882  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0513  ATP synthase F1, alpha subunit  47.82 
 
 
501 aa  473  1e-132  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0601  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.16 
 
 
505 aa  472  1e-132  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00209636  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1797  ATP synthase F1, alpha subunit  49.27 
 
 
504 aa  473  1e-132  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2746  ATP synthase F1, alpha subunit  46.38 
 
 
513 aa  473  1e-132  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.426504  normal  0.209432 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2139  ATP synthase F1, alpha subunit  51.49 
 
 
507 aa  474  1e-132  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2759  ATP synthase F1, alpha subunit  45.82 
 
 
502 aa  472  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3878  F0F1 ATP synthase subunit alpha  45.29 
 
 
548 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3864  F0F1 ATP synthase subunit alpha  45.29 
 
 
548 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.283904  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2454  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.76 
 
 
502 aa  473  1e-132  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2164  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.76 
 
 
502 aa  473  1e-132  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0663  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.78 
 
 
520 aa  473  1e-132  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0131395  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1669  H(+)-transporting two-sector ATPase  48.86 
 
 
549 aa  473  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1267  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.64 
 
 
526 aa  469  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.793474  normal  0.559767 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0201  ATP synthase F1, alpha subunit  51.63 
 
 
501 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.406681  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19150  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.17 
 
 
541 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0334  ATP synthase F1, alpha subunit  47.53 
 
 
546 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.297297 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0898  ATP synthase F1 subunit alpha  48.03 
 
 
549 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.707906 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1527  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.32 
 
 
505 aa  471  1.0000000000000001e-131  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000683533  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1492  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.25 
 
 
505 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0642798  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2188  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.05 
 
 
506 aa  470  1.0000000000000001e-131  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.929468 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0262  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.02 
 
 
526 aa  471  1.0000000000000001e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0489814 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4350  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.37 
 
 
510 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16411  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.78 
 
 
505 aa  470  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4505  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.12 
 
 
510 aa  468  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0183  F0F1 ATP synthase subunit alpha  46.63 
 
 
526 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.617939  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2199  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.56 
 
 
505 aa  471  1.0000000000000001e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.539772 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1463  ATP synthase F1, alpha subunit  52.41 
 
 
509 aa  470  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.298107  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16531  F0F1 ATP synthase subunit alpha  52.02 
 
 
505 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.592214  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0514  F0F1 ATP synthase subunit alpha  51.75 
 
 
527 aa  470  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.709885  normal  0.673527 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1935  F0F1 ATP synthase subunit alpha  54.27 
 
 
500 aa  469  1.0000000000000001e-131  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3338  ATP synthase F1 subunit alpha  51.25 
 
 
506 aa  466  9.999999999999999e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>