27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3973 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3973  FHA domain-containing protein  100 
 
 
446 aa  881    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.825925  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0737  FHA domain-containing protein  72.34 
 
 
498 aa  659    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.38821  hitchhiker  0.00771309 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1397  FHA domain containing protein  43.33 
 
 
512 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0172432  normal  0.166225 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5899  hypothetical protein  40.76 
 
 
471 aa  136  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.529842  normal  0.0437244 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1841  forkhead-associated protein  42.95 
 
 
334 aa  133  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.521298  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3539  Forkhead-associated protein  39.81 
 
 
371 aa  121  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.953767  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1473  Forkhead-associated protein  41.45 
 
 
485 aa  113  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0144762  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4098  FHA domain containing protein  43.22 
 
 
325 aa  94  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124335  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1293  FHA domain-containing protein  31.51 
 
 
598 aa  70.5  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.584105  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21550  FHA domain-containing protein  33.04 
 
 
888 aa  63.9  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1337  FHA domain containing protein  31.82 
 
 
697 aa  62  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000206516 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0490  FHA domain containing protein  29.68 
 
 
578 aa  59.3  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.148331  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1927  RDD domain containing protein  31.73 
 
 
431 aa  52.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0178592  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3276  serine/threonine kinase protein  30.26 
 
 
475 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.162967  normal  0.186689 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1335  RDD domain containing protein  31.25 
 
 
451 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000041678 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0701  serine/threonine kinase protein  27.16 
 
 
500 aa  50.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000041573  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1756  FHA domain containing protein  31.19 
 
 
564 aa  48.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1844  protein kinase  29.8 
 
 
485 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1291  RDD domain-containing protein  30.69 
 
 
556 aa  47  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1125  FHA domain containing protein  33.66 
 
 
164 aa  47  0.0008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2862  serine/threonine protein kinase with FHA domain protein  29.61 
 
 
461 aa  47  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0331912  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3212  FHA domain containing protein  28.44 
 
 
463 aa  46.2  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.945848  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0429  diguanylate cyclase  46.67 
 
 
338 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0458  diguanylate cyclase  45 
 
 
326 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0457  diguanylate cyclase  45 
 
 
326 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5252  FHA domain containing protein  31.82 
 
 
255 aa  44.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.691426 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3060  FHA domain-containing protein  33.85 
 
 
253 aa  43.9  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>