30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0737 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3973  FHA domain-containing protein  71.2 
 
 
446 aa  661    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.825925  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0737  FHA domain-containing protein  100 
 
 
498 aa  983    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.38821  hitchhiker  0.00771309 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1397  FHA domain containing protein  44.52 
 
 
512 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0172432  normal  0.166225 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5899  hypothetical protein  44.87 
 
 
471 aa  140  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.529842  normal  0.0437244 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1841  forkhead-associated protein  44.52 
 
 
334 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.521298  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1473  Forkhead-associated protein  41.29 
 
 
485 aa  119  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0144762  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3539  Forkhead-associated protein  38.53 
 
 
371 aa  118  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.953767  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4098  FHA domain containing protein  46.43 
 
 
325 aa  99.8  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124335  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1293  FHA domain-containing protein  32.28 
 
 
598 aa  69.7  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.584105  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1337  FHA domain containing protein  30.43 
 
 
697 aa  63.9  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000206516 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21550  FHA domain-containing protein  32.14 
 
 
888 aa  61.6  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07540  FHA domain-containing protein  29.68 
 
 
614 aa  60.8  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.118463 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0490  FHA domain containing protein  30.32 
 
 
578 aa  58.5  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.148331  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1927  RDD domain containing protein  32.69 
 
 
431 aa  53.5  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0178592  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3276  serine/threonine kinase protein  33.55 
 
 
475 aa  52  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.162967  normal  0.186689 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0701  serine/threonine kinase protein  28.95 
 
 
500 aa  51.6  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000041573  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1335  RDD domain containing protein  32.43 
 
 
451 aa  50.1  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000041678 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1756  FHA domain containing protein  32.11 
 
 
564 aa  47.8  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3212  FHA domain containing protein  29.36 
 
 
463 aa  47.4  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.945848  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2822  FHA domain-containing protein  33.6 
 
 
247 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000875758  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1844  protein kinase  32.45 
 
 
485 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2541  FHA domain-containing protein  32.74 
 
 
247 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00963691 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1291  RDD domain-containing protein  31.68 
 
 
556 aa  45.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0429  diguanylate cyclase  46.67 
 
 
338 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1125  FHA domain containing protein  33.66 
 
 
164 aa  44.7  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1693  FHA domain-containing protein  27.12 
 
 
167 aa  44.7  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0514614  normal  0.923966 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0455  FHA domain containing protein  28.07 
 
 
125 aa  43.9  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.107862  normal  0.788327 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0458  diguanylate cyclase  45 
 
 
326 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0457  diguanylate cyclase  45 
 
 
326 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5252  FHA domain containing protein  33.33 
 
 
255 aa  43.1  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.691426 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>