27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4098 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4098  FHA domain containing protein  100 
 
 
325 aa  634    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124335  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0737  FHA domain-containing protein  46.43 
 
 
498 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.38821  hitchhiker  0.00771309 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3973  FHA domain-containing protein  43.22 
 
 
446 aa  94  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.825925  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1397  FHA domain containing protein  38.32 
 
 
512 aa  73.9  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0172432  normal  0.166225 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3539  Forkhead-associated protein  28.19 
 
 
371 aa  62  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.953767  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1841  forkhead-associated protein  30.56 
 
 
334 aa  60.8  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.521298  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5899  hypothetical protein  32.11 
 
 
471 aa  60.1  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.529842  normal  0.0437244 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2769  FHA domain-containing protein  36.44 
 
 
526 aa  55.8  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1473  Forkhead-associated protein  35.51 
 
 
485 aa  54.3  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0144762  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1326  FHA domain containing protein  34.58 
 
 
424 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.375936  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2395  FHA domain-containing protein  35.65 
 
 
505 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1756  FHA domain containing protein  34.45 
 
 
564 aa  48.9  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0457  FHA domain containing protein  31.82 
 
 
534 aa  48.1  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3276  serine/threonine kinase protein  36.56 
 
 
475 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.162967  normal  0.186689 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1844  protein kinase  42.19 
 
 
485 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2193  transcriptional regulator, SARP family  36.96 
 
 
385 aa  45.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00163999  hitchhiker  0.00133858 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1927  RDD domain containing protein  32.74 
 
 
431 aa  44.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0178592  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2200  FHA domain containing protein  34.34 
 
 
585 aa  45.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.632754  decreased coverage  0.00361499 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07540  FHA domain-containing protein  31.03 
 
 
614 aa  45.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.118463 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4227  FHA domain containing protein  32.1 
 
 
308 aa  44.3  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.208424  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0367  FHA domain-containing protein  40.3 
 
 
529 aa  43.1  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.216513  decreased coverage  0.000756141 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2396  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  41.94 
 
 
427 aa  43.1  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4947  FHA domain-containing protein  28.35 
 
 
187 aa  43.1  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337015  normal  0.997084 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2459  FHA domain containing protein  32.65 
 
 
1011 aa  42.7  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0709  transcriptional regulator, SARP family  35.11 
 
 
379 aa  42.7  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122417  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3060  FHA domain-containing protein  39.39 
 
 
253 aa  42.7  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1520  FHA domain-containing protein  35.11 
 
 
1065 aa  42.4  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00810345  decreased coverage  0.000340593 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>