22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1083 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1083  RDD domain containing protein  100 
 
 		 146 aa  294  2e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.293263  normal  0.491437 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1176  RDD domain-containing protein  57.25 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0883  RDD domain-containing protein  52.82 
 
 		 143 aa  139  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.188299 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2640  hypothetical protein  51.45 
 
 		 150 aa  134  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.253038  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1297  RDD domain-containing protein  51.45 
 
 		 150 aa  134  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1904  RDD  38.3 
 
 		 149 aa  90.9  6e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.68973 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4293  RDD domain-containing protein  30.26 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4656  hypothetical protein  30.07 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1910  hypothetical protein  27.7 
 
 		 179 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278125  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2885  RDD domain-containing protein  30.43 
 
 		 175 aa  49.7  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250053 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2241  hypothetical protein  30.67 
 
 		 179 aa  47.4  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0821619  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0811  RDD domain-containing protein  28.77 
 
 		 154 aa  47  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.610403 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2120  RDD domain containing protein  28.28 
 
 		 157 aa  43.9  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2987  RDD domain containing protein  28 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2650  RDD  29.25 
 
 		 188 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2622  RDD  30.41 
 
 		 180 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.72868  normal  0.883722 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5633  RDD domain-containing protein  26.67 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.832887  normal  0.15374 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0751  hypothetical protein  27.15 
 
 		 156 aa  40.8  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0756  hypothetical protein  27.15 
 
 		 156 aa  40.8  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.840052  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1261  RDD domain containing protein  29.93 
 
 		 152 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.295928 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1128  RDD domain-containing protein  31.47 
 
 		 152 aa  40.8  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2537  RDD domain-containing protein  29.05 
 
 		 156 aa  40.8  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.92943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>