31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1205 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1205  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 160 aa  316  6e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2120  RDD domain containing protein  62.82 
 
 		 157 aa  177  7e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0811  RDD domain-containing protein  43.57 
 
 		 154 aa  91.7  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.610403 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1112  RDD domain containing protein  43.07 
 
 		 152 aa  85.5  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1602  hypothetical protein  41.73 
 
 		 152 aa  84.3  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1261  RDD domain containing protein  41.61 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.295928 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1910  hypothetical protein  38.67 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278125  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2537  RDD domain-containing protein  37.88 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.92943  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4293  RDD domain-containing protein  34.15 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0756  hypothetical protein  35.61 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.840052  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0751  hypothetical protein  35.61 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2650  RDD  33.92 
 
 		 188 aa  67.8  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2885  RDD domain-containing protein  35.25 
 
 		 175 aa  67  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250053 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2241  hypothetical protein  34.91 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0821619  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1128  RDD domain-containing protein  33.33 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4656  hypothetical protein  37.5 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2622  RDD  33.53 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.72868  normal  0.883722 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2659  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.663395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2987  RDD domain containing protein  30.99 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7575  RDD domain containing protein  29.85 
 
 		 173 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.724315  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1844  RDD  35.56 
 
 		 173 aa  50.8  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.353991  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4760  RDD domain containing protein  30.63 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.724006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6837  RDD domain-containing protein  29.85 
 
 		 177 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1083  RDD domain containing protein  33.09 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.293263  normal  0.491437 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4240  RDD domain-containing protein  31.82 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4610  RDD domain containing protein  31.82 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.830489  normal  0.318012 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0883  RDD domain-containing protein  29.71 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.188299 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5633  RDD domain-containing protein  31.53 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.832887  normal  0.15374 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1904  RDD  30.6 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.68973 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0171  RDD domain-containing protein  28.71 
 
 		 140 aa  42  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652856  decreased coverage  0.0096302 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0238  RDD domain-containing protein  33.83 
 
 		 164 aa  41.6  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>