104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0171 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_0171  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 140 aa  271  3e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652856  decreased coverage  0.0096302 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0170  RDD domain-containing protein  45.83 
 
 		 145 aa  117  4.9999999999999996e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000534855  decreased coverage  0.00967799 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1706  RDD  44.83 
 
 		 170 aa  110  5e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.305495  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  40.85 
 
 		 310 aa  104  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0075  RDD domain-containing protein  40.44 
 
 		 185 aa  102  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0306278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  41.84 
 
 		 187 aa  101  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1364  RDD domain-containing protein  43.15 
 
 		 186 aa  101  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000121263  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1148  RDD domain containing protein  38.69 
 
 		 185 aa  99.4  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00101829  hitchhiker  0.000000000000525817 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3591  hypothetical protein  40.74 
 
 		 133 aa  90.9  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157612  normal  0.0949488 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3583  MJ0042 family finger-like protein  37.96 
 
 		 295 aa  89.4  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040814  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0277  RDD domain containing protein  42.14 
 
 		 217 aa  89  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.0986894 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3457  RDD domain containing protein  37.59 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.052067 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2713  RDD domain containing protein  34.29 
 
 		 159 aa  77  0.00000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2609  serine/threonine protein kinase  40.74 
 
 		 415 aa  74.3  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.101255 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04050  RDD family protein  35.9 
 
 		 424 aa  73.2  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  34.81 
 
 		 270 aa  70.1  0.000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  30.56 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1223  RDD domain containing protein  43.42 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8545  membrane protein/domain-like protein  31.11 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  29.5 
 
 		 257 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1340  serine/threonine protein kinase  37.08 
 
 		 536 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.975368 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1213  RDD  42.67 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0799296  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2289  RDD domain-containing protein  36.36 
 
 		 202 aa  62  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0371  RDD domain containing protein  31.69 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2608  RDD domain-containing protein  30.71 
 
 		 456 aa  61.2  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.107491 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1247  RDD domain containing protein  28.28 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9150  membrane protein/domain-like protein  29.14 
 
 		 447 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0431  RDD domain-containing protein  36.23 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3024  branched-chain amino acid aminotransferase I  30.77 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0726  RDD domain containing protein  26.76 
 
 		 156 aa  57  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0115  hypothetical protein  27.56 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.539233  hitchhiker  0.000011217 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1602  hypothetical protein  28.91 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1157  RDD domain-containing protein  29.77 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1260  RDD protein  30.07 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1499  RDD domain containing protein  25.18 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4968  YxaI  43.24 
 
 		 77 aa  52.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0234  RDD protein  39.71 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1261  RDD domain containing protein  26.56 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.295928 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1489  RDD domain containing protein  27.07 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126204  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0598  RDD domain containing protein  28.89 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0331  RDD family protein  23.17 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  28.19 
 
 		 169 aa  52  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0399  RDD domain-containing protein  28.46 
 
 		 278 aa  52.4  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0177068 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0674  RDD  24.84 
 
 		 163 aa  51.2  0.000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1112  RDD domain containing protein  26.56 
 
 		 152 aa  51.2  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2120  RDD domain containing protein  29.13 
 
 		 157 aa  50.8  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1128  RDD domain-containing protein  27.54 
 
 		 152 aa  49.7  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0824  RDD domain containing protein  32.97 
 
 		 590 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0333571  normal  0.0552944 
 
 
-
 
NC_002978  WD0355  hypothetical protein  39.13 
 
 		 198 aa  48.9  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1449  RDD domain-containing protein  30.6 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.413718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1509  hypothetical protein  34.26 
 
 		 375 aa  48.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0950  RDD protein  26.28 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1701  RDD domain containing protein  26.43 
 
 		 162 aa  47.8  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000482282  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0678  RDD domain-containing protein  37.5 
 
 		 157 aa  47.4  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.416032  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0093  RDD domain containing protein  31.72 
 
 		 211 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.173435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4396  RDD  32.93 
 
 		 162 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0425  RDD protein  30.28 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0811  RDD domain-containing protein  25.93 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.610403 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3673  RDD domain containing protein  28 
 
 		 323 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2137  RDD domain containing protein  23.87 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4817  RDD domain containing protein  27.89 
 
 		 198 aa  45.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4672  RDD domain-containing protein  20.39 
 
 		 168 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.952193  normal  0.331849 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0288  RDD domain-containing protein  29.03 
 
 		 276 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0824  hypothetical protein  57.58 
 
 		 43 aa  45.1  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000359871 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1501  RDD domain-containing protein  31.46 
 
 		 444 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.561992  hitchhiker  0.000145013 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0891  RDD domain-containing protein  30.2 
 
 		 152 aa  44.3  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98299 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2897  hypothetical protein  26.67 
 
 		 191 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.607229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0396  RDD  36.23 
 
 		 196 aa  44.3  0.0006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.476249  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0643  RDD family protein  32.58 
 
 		 195 aa  44.3  0.0006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0008  hypothetical protein  31.03 
 
 		 171 aa  44.3  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.018988  normal  0.471387 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0628  hypothetical protein  27.01 
 
 		 154 aa  44.3  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0572979  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1918  RDD protein  30.94 
 
 		 154 aa  43.9  0.0007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.002418  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1568  RDD domain-containing protein  31.46 
 
 		 448 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.957894  normal  0.02442 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0269  RDD domain-containing protein  41.18 
 
 		 317 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.194271 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2847  RDD family membrane protein  36.14 
 
 		 329 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.1745 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4809  RDD  24.29 
 
 		 261 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000284972  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0769  RDD protein  39.39 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0105114  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14520  hypothetical protein  26.43 
 
 		 165 aa  42.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0474  hypothetical protein  28.26 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.647005  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1388  hypothetical protein  27.54 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1375  SecF protein  29.37 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.905726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1267  hypothetical protein  27.54 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1175  RDD domain-containing protein  29.17 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4654  RDD domain-containing protein  30.48 
 
 		 264 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.807388  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13630  hypothetical protein  29.66 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.687713  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0098  RDD domain containing protein  27.69 
 
 		 204 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1910  hypothetical protein  26.95 
 
 		 179 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278125  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2053  RDD domain-containing protein  32.14 
 
 		 150 aa  41.6  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4234  RDD domain-containing protein  30 
 
 		 162 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3069  RDD domain containing protein  28.78 
 
 		 150 aa  42  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1061  RDD domain containing protein  31.03 
 
 		 211 aa  41.6  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5436  RDD domain containing protein  22.86 
 
 		 214 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2885  RDD domain-containing protein  25.56 
 
 		 175 aa  41.2  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250053 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1145  hypothetical protein  28.47 
 
 		 166 aa  41.2  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3574  RDD domain containing protein  28.24 
 
 		 255 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.737424  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0505  conserved hypothetical protein, RDD family  28.78 
 
 		 152 aa  40.8  0.006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2662  RDD domain-containing protein  28.07 
 
 		 412 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2684  RDD domain-containing protein  28.07 
 
 		 415 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0059123  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1683  RDD domain-containing protein  32.53 
 
 		 424 aa  40.4  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2763  RDD domain-containing protein  28.07 
 
 		 412 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.136751  hitchhiker  0.000413792 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>