43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1364 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1364  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 186 aa  374  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000121263  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0277  RDD domain containing protein  38.78 
 
 		 217 aa  124  8.000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.0986894 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0075  RDD domain-containing protein  35.71 
 
 		 185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0306278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1706  RDD  42.14 
 
 		 170 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.305495  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1148  RDD domain containing protein  33.16 
 
 		 185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00101829  hitchhiker  0.000000000000525817 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0170  RDD domain-containing protein  44.37 
 
 		 145 aa  107  8.000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000534855  decreased coverage  0.00967799 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  44 
 
 		 187 aa  106  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  34.23 
 
 		 310 aa  95.9  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2289  RDD domain-containing protein  35 
 
 		 202 aa  93.2  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0171  RDD domain-containing protein  43.15 
 
 		 140 aa  87.8  8e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652856  decreased coverage  0.0096302 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1340  serine/threonine protein kinase  47.25 
 
 		 536 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.975368 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1223  RDD domain containing protein  32.95 
 
 		 202 aa  86.3  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2609  serine/threonine protein kinase  37.72 
 
 		 415 aa  85.1  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.101255 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3591  hypothetical protein  34.46 
 
 		 133 aa  77  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157612  normal  0.0949488 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3583  MJ0042 family finger-like protein  35.81 
 
 		 295 aa  74.7  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040814  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  31.17 
 
 		 169 aa  72.8  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2608  RDD domain-containing protein  37.61 
 
 		 456 aa  72.4  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.107491 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3457  RDD domain containing protein  32.91 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.052067 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04050  RDD family protein  34.09 
 
 		 424 aa  70.5  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0891  RDD domain-containing protein  33.33 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98299 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1213  RDD  39.29 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0799296  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2713  RDD domain containing protein  32.89 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  31.52 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0628  hypothetical protein  32.68 
 
 		 154 aa  62  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0572979  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4968  YxaI  43.24 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1701  RDD domain containing protein  33.77 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000482282  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3024  branched-chain amino acid aminotransferase I  32.9 
 
 		 167 aa  58.2  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  33.56 
 
 		 257 aa  53.1  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0409  RDD  31.33 
 
 		 231 aa  48.5  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0399  RDD domain-containing protein  37.35 
 
 		 278 aa  48.5  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0177068 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0726  RDD domain containing protein  26.85 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0769  RDD protein  28.76 
 
 		 163 aa  47.4  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0105114  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0643  RDD family protein  36.36 
 
 		 195 aa  45.8  0.0004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0512  hypothetical protein  47.37 
 
 		 289 aa  45.1  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.269332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1489  RDD domain containing protein  25.52 
 
 		 155 aa  45.4  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126204  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0396  RDD  36.36 
 
 		 196 aa  44.7  0.0007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.476249  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0824  hypothetical protein  76.92 
 
 		 43 aa  42  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000359871 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1639  PASTA domain containing protein  62.5 
 
 		 501 aa  42  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.81867  hitchhiker  0.00180269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8545  membrane protein/domain-like protein  34.18 
 
 		 175 aa  41.6  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  27.5 
 
 		 166 aa  41.6  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0678  RDD domain-containing protein  26.67 
 
 		 157 aa  41.6  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.416032  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0511  hypothetical protein  58.33 
 
 		 111 aa  41.2  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.575865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0712  RDD domain-containing protein  26.21 
 
 		 634 aa  41.2  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>