37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1701 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1701  RDD domain containing protein  100 
 
 		 162 aa  316  9e-86  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000482282  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2713  RDD domain containing protein  34.38 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  34.53 
 
 		 257 aa  74.3  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0726  RDD domain containing protein  31.21 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  32.87 
 
 		 310 aa  61.2  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1364  RDD domain-containing protein  33.77 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000121263  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  29.41 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1706  RDD  26.09 
 
 		 170 aa  52.8  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.305495  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1148  RDD domain containing protein  26.67 
 
 		 185 aa  53.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00101829  hitchhiker  0.000000000000525817 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5849  RDD domain-containing protein  30.82 
 
 		 316 aa  52  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.273522 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0075  RDD domain-containing protein  30.22 
 
 		 185 aa  51.2  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0306278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  28.32 
 
 		 187 aa  51.2  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5436  RDD domain containing protein  32.21 
 
 		 214 aa  50.4  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4863  RDD domain-containing protein  33.8 
 
 		 262 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.964955  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4952  RDD domain-containing protein  33.8 
 
 		 262 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5231  RDD domain-containing protein  33.8 
 
 		 262 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435963  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3834  RDD domain containing protein  32.14 
 
 		 272 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2503  hypothetical protein  32.37 
 
 		 264 aa  48.1  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5459  RDD domain-containing protein  36.36 
 
 		 293 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0277  RDD domain containing protein  29.17 
 
 		 217 aa  47  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.0986894 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7601  RDD domain containing protein  35.35 
 
 		 327 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.202371  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0612  VanZ family protein  33.93 
 
 		 361 aa  45.4  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000542073  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0170  RDD domain-containing protein  26.21 
 
 		 145 aa  45.1  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000534855  decreased coverage  0.00967799 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1499  RDD domain containing protein  25.97 
 
 		 174 aa  44.7  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8545  membrane protein/domain-like protein  31.65 
 
 		 175 aa  44.3  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1333  RDD domain-containing protein  33.08 
 
 		 280 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.391018 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1682  RDD domain containing protein  26.04 
 
 		 241 aa  43.9  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3574  RDD domain containing protein  29.19 
 
 		 255 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.737424  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0371  RDD domain containing protein  27.94 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1449  RDD domain-containing protein  33.58 
 
 		 158 aa  42  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.413718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1247  RDD domain containing protein  29.59 
 
 		 137 aa  42  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3753  RDD domain containing protein  33.67 
 
 		 285 aa  41.2  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13726  hypothetical protein  30.68 
 
 		 310 aa  41.2  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0402342  normal  0.595615 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0755  RDD  30.71 
 
 		 340 aa  41.2  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.581888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3583  MJ0042 family finger-like protein  27.14 
 
 		 295 aa  40.8  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040814  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2289  RDD domain-containing protein  27.22 
 
 		 202 aa  40.8  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3591  hypothetical protein  28.57 
 
 		 133 aa  40.4  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157612  normal  0.0949488 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>