29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0612 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0612  VanZ family protein  100 
 
 
361 aa  706    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000542073  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0210  VanZ family protein  50 
 
 
387 aa  343  4e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0595  VanZ family protein  48.82 
 
 
384 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4625  hypothetical protein  48.82 
 
 
383 aa  302  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000286703 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0647  hypothetical protein  49.87 
 
 
383 aa  301  9e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.716379  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0592  hypothetical protein  49.87 
 
 
383 aa  301  9e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0681  hypothetical protein  49.87 
 
 
383 aa  301  9e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.545812  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0736  hypothetical protein  49.87 
 
 
383 aa  301  9e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.02924e-25 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0591  hypothetical protein  49.6 
 
 
383 aa  301  1e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.527115  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0711  hypothetical protein  48.82 
 
 
383 aa  300  4e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.527264  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0748  hypothetical protein  49.34 
 
 
383 aa  293  3e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0808  hypothetical protein  48.82 
 
 
383 aa  290  3e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1340  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.35 
 
 
669 aa  185  1.0000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.774889 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1911  hypothetical protein  37 
 
 
354 aa  181  2e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08070  glycopeptide antibiotics resistance protein  33.86 
 
 
409 aa  170  3e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000781002 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0489  glycopeptide antibiotics resistance protein  29.33 
 
 
344 aa  97.4  3e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38730  glycopeptide antibiotics resistance protein  31.07 
 
 
237 aa  80.1  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27280  glycopeptide antibiotics resistance protein  27.17 
 
 
231 aa  73.2  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0585344  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2484  VanZ family protein  28.77 
 
 
210 aa  62.4  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000301645  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2684  vanZ protein, putative  26.15 
 
 
210 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0413993  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2680  teicoplanin resistance protein VanZ  24.48 
 
 
210 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2631  teicoplanin resistance protein VanZ  25.56 
 
 
210 aa  52  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.47817  decreased coverage  0.000000178374 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3806  VanZ family protein  30.43 
 
 
172 aa  50.4  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2396  teicoplanin resistance protein  26.04 
 
 
210 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1601  VanZ family protein  32.46 
 
 
195 aa  47  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.413632  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2187  VanZ family protein  31.43 
 
 
194 aa  47  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000988027  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1701  RDD domain containing protein  33.63 
 
 
162 aa  45.4  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000482282  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2015  VanZ family protein  40.28 
 
 
185 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0179065  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0259  glycopeptide antibiotics resistance protein  33.03 
 
 
216 aa  43.5  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>