48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1682 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1682  RDD domain containing protein  100 
 
 		 241 aa  492  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09288  putative transmembrane protein  30.13 
 
 		 237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.875246  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4958  RDD domain containing protein  31.56 
 
 		 231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000303152 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0232  RDD domain containing protein  33.47 
 
 		 247 aa  124  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2233  RDD domain-containing protein  32.8 
 
 		 247 aa  122  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00562558  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2132  hypothetical protein  28.63 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4266  RDD domain-containing protein  28.57 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000560964  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3447  RDD domain-containing protein  26.29 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1596  RDD domain-containing protein  31.48 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3579  RDD domain containing protein  27.93 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000310569 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4021  RDD  29.22 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897049  normal  0.0584976 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0409  RDD  30 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3993  RDD domain containing protein  35.8 
 
 		 177 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0755  RDD  29.49 
 
 		 340 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.581888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5849  RDD domain-containing protein  30.07 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.273522 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3574  RDD domain containing protein  33.33 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.737424  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4317  hypothetical protein  27.04 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1397  membrane protein/domain-like protein  31.82 
 
 		 343 aa  55.1  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.309206 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3316  RDD domain-containing protein  28.38 
 
 		 241 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3744  RDD domain containing protein  29.65 
 
 		 279 aa  54.7  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20730  predicted membrane protein/domain  26.17 
 
 		 286 aa  53.9  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00769566  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1836  RDD domain containing protein  26.79 
 
 		 268 aa  53.5  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13726  hypothetical protein  30.41 
 
 		 310 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0402342  normal  0.595615 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5459  RDD domain-containing protein  28.19 
 
 		 293 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4863  RDD domain-containing protein  29.14 
 
 		 262 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.964955  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5231  RDD domain-containing protein  29.14 
 
 		 262 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435963  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4952  RDD domain-containing protein  29.14 
 
 		 262 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4809  RDD  24.51 
 
 		 261 aa  52  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000284972  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56100  hypothetical protein  28.66 
 
 		 265 aa  52  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4887  hypothetical protein  30.26 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.437888  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3843  RDD domain containing protein  27.08 
 
 		 229 aa  51.2  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0015  RDD domain-containing protein  39.74 
 
 		 80 aa  51.2  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2503  hypothetical protein  28.29 
 
 		 264 aa  50.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4051  RDD domain containing protein  27.33 
 
 		 288 aa  50.4  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38330  hypothetical protein  28.38 
 
 		 242 aa  49.7  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1201  RDD domain-containing protein  27.78 
 
 		 269 aa  48.9  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1333  RDD domain-containing protein  28.08 
 
 		 280 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.391018 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0824  RDD domain containing protein  22.41 
 
 		 590 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0333571  normal  0.0552944 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3753  RDD domain containing protein  25.68 
 
 		 285 aa  47  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4439  RDD  32.14 
 
 		 241 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3834  RDD domain containing protein  27.27 
 
 		 272 aa  46.6  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1614  RDD domain-containing protein  28.66 
 
 		 323 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0215766 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1701  RDD domain containing protein  26.04 
 
 		 162 aa  43.9  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000482282  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3591  hypothetical protein  27.27 
 
 		 133 aa  43.5  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157612  normal  0.0949488 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1271  RDD domain containing protein  31.3 
 
 		 266 aa  43.1  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000317829 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7601  RDD domain containing protein  27.64 
 
 		 327 aa  42.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.202371  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2522  RDD domain containing protein  27.21 
 
 		 272 aa  42.7  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11329  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3129  RDD domain containing protein  26.97 
 
 		 304 aa  42.4  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.403499 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>