60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_38330 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_38330  hypothetical protein  100 
 
 
242 aa  472  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3316  RDD domain-containing protein  71.62 
 
 
241 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4021  RDD  64.73 
 
 
241 aa  286  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897049  normal  0.0584976 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4317  hypothetical protein  63.27 
 
 
235 aa  278  8e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56100  hypothetical protein  62.61 
 
 
265 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4887  hypothetical protein  65.9 
 
 
223 aa  261  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.437888  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4439  RDD  65.49 
 
 
241 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296549  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0409  RDD  49.04 
 
 
231 aa  193  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3843  RDD domain containing protein  47.81 
 
 
229 aa  158  6e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3579  RDD domain containing protein  40.14 
 
 
265 aa  105  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000310569 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3447  RDD domain-containing protein  40.52 
 
 
254 aa  102  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1596  RDD domain-containing protein  38.56 
 
 
258 aa  97.8  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4266  RDD domain-containing protein  35.29 
 
 
274 aa  93.2  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000560964  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3744  RDD domain containing protein  31.11 
 
 
279 aa  87.4  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3574  RDD domain containing protein  37.42 
 
 
255 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.737424  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2503  hypothetical protein  37.57 
 
 
264 aa  79.7  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4809  RDD  34.73 
 
 
261 aa  78.2  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000284972  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0824  RDD domain containing protein  32.05 
 
 
590 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0333571  normal  0.0552944 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3069  RDD domain containing protein  37.14 
 
 
150 aa  77.4  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5849  RDD domain-containing protein  35.98 
 
 
316 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.273522 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09288  putative transmembrane protein  34.25 
 
 
237 aa  65.9  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.875246  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4051  RDD domain containing protein  34.46 
 
 
288 aa  65.5  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3753  RDD domain containing protein  29.94 
 
 
285 aa  65.1  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0755  RDD  33.71 
 
 
340 aa  62.4  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.581888  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1397  membrane protein/domain-like protein  33.08 
 
 
343 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.309206 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4958  RDD domain containing protein  34.34 
 
 
231 aa  59.3  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000303152 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3129  RDD domain containing protein  37.61 
 
 
304 aa  59.3  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.403499 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1614  RDD domain-containing protein  31.98 
 
 
323 aa  58.9  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0215766 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1201  RDD domain-containing protein  29.34 
 
 
269 aa  58.5  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13726  hypothetical protein  33.12 
 
 
310 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0402342  normal  0.595615 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5459  RDD domain-containing protein  39.08 
 
 
293 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1333  RDD domain-containing protein  31.03 
 
 
280 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.391018 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4863  RDD domain-containing protein  33.75 
 
 
262 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.964955  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5231  RDD domain-containing protein  33.75 
 
 
262 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435963  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4952  RDD domain-containing protein  33.75 
 
 
262 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5334  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1157  RDD domain-containing protein  42.22 
 
 
175 aa  56.6  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3834  RDD domain containing protein  30.57 
 
 
272 aa  55.8  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7601  RDD domain containing protein  31.86 
 
 
327 aa  55.5  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.202371  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1745  RDD domain containing protein  42.65 
 
 
151 aa  55.5  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1836  RDD domain containing protein  28.17 
 
 
268 aa  55.5  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2522  RDD domain containing protein  39.47 
 
 
272 aa  54.3  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11329  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0232  RDD domain containing protein  27.27 
 
 
247 aa  53.5  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2132  hypothetical protein  32.69 
 
 
238 aa  52.8  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20730  predicted membrane protein/domain  28.04 
 
 
286 aa  52.4  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00769566  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3913  RDD domain-containing protein  40.26 
 
 
269 aa  50.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0538103  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09260  predicted membrane protein/domain protein  32.16 
 
 
272 aa  50.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.144214 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1682  RDD domain containing protein  28.38 
 
 
241 aa  49.7  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2339  RDD domain containing protein  31.88 
 
 
282 aa  49.7  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0325969  hitchhiker  0.0000235215 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4825  RDD domain containing protein  30.72 
 
 
285 aa  48.5  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1271  RDD domain containing protein  30.05 
 
 
266 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000317829 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2334  RDD domain containing protein  40.21 
 
 
207 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4241  RDD domain containing protein  31 
 
 
635 aa  46.6  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.18119  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2968  RDD domain-containing protein  26.74 
 
 
288 aa  44.7  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2675  RDD domain-containing protein  32.95 
 
 
306 aa  44.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1078  RDD domain-containing protein  28.29 
 
 
191 aa  44.3  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.30777  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2233  RDD domain-containing protein  27.33 
 
 
247 aa  44.3  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00562558  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3591  hypothetical protein  28.46 
 
 
133 aa  43.5  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157612  normal  0.0949488 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0015  RDD domain-containing protein  40.58 
 
 
80 aa  42.7  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1940  RDD domain-containing protein  25.19 
 
 
246 aa  42  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000546955  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3993  RDD domain containing protein  34.02 
 
 
177 aa  42  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>