53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2233 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2233  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 247 aa  499  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00562558  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09288  putative transmembrane protein  40.82 
 
 		 237 aa  175  6e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.875246  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0232  RDD domain containing protein  35.08 
 
 		 247 aa  153  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1682  RDD domain containing protein  32.8 
 
 		 241 aa  132  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4958  RDD domain containing protein  31.69 
 
 		 231 aa  126  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000303152 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2132  hypothetical protein  32.68 
 
 		 238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4266  RDD domain-containing protein  26.69 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000560964  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4809  RDD  30.95 
 
 		 261 aa  74.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000284972  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3843  RDD domain containing protein  27.7 
 
 		 229 aa  67  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3574  RDD domain containing protein  27.49 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.737424  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0824  RDD domain containing protein  36.08 
 
 		 590 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0333571  normal  0.0552944 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3579  RDD domain containing protein  26.92 
 
 		 265 aa  62  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000310569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5849  RDD domain-containing protein  28.98 
 
 		 316 aa  58.9  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.273522 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3744  RDD domain containing protein  27.19 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1596  RDD domain-containing protein  28.19 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4825  RDD domain containing protein  33.33 
 
 		 285 aa  57  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38330  hypothetical protein  27.33 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3993  RDD domain containing protein  44.78 
 
 		 177 aa  57  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4887  hypothetical protein  25.7 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.437888  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1157  RDD domain-containing protein  37.08 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3316  RDD domain-containing protein  28.48 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1397  membrane protein/domain-like protein  28.87 
 
 		 343 aa  55.5  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.309206 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1745  RDD domain containing protein  35.71 
 
 		 151 aa  53.9  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2522  RDD domain containing protein  29.81 
 
 		 272 aa  53.1  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11329  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7601  RDD domain containing protein  29.57 
 
 		 327 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.202371  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56100  hypothetical protein  27.1 
 
 		 265 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4317  hypothetical protein  27.12 
 
 		 235 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3753  RDD domain containing protein  27.21 
 
 		 285 aa  53.9  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3447  RDD domain-containing protein  27.72 
 
 		 254 aa  52.8  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20730  predicted membrane protein/domain  22.22 
 
 		 286 aa  52.4  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00769566  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2503  hypothetical protein  26.22 
 
 		 264 aa  52.8  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5231  RDD domain-containing protein  31.82 
 
 		 262 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435963  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4952  RDD domain-containing protein  31.82 
 
 		 262 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4863  RDD domain-containing protein  31.82 
 
 		 262 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.964955  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4021  RDD  29.03 
 
 		 241 aa  52  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897049  normal  0.0584976 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0755  RDD  31.91 
 
 		 340 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.581888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0409  RDD  22.84 
 
 		 231 aa  50.4  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4439  RDD  32.05 
 
 		 241 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0015  RDD domain-containing protein  43.66 
 
 		 80 aa  49.7  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1201  RDD domain-containing protein  25 
 
 		 269 aa  49.7  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1271  RDD domain containing protein  31 
 
 		 266 aa  48.9  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000317829 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4051  RDD domain containing protein  32.05 
 
 		 288 aa  48.9  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3834  RDD domain containing protein  24.26 
 
 		 272 aa  48.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13726  hypothetical protein  32.91 
 
 		 310 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0402342  normal  0.595615 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1836  RDD domain containing protein  28.8 
 
 		 268 aa  48.1  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2856  RDD domain-containing protein  30.28 
 
 		 375 aa  47  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000762039 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1333  RDD domain-containing protein  29.6 
 
 		 280 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.391018 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5459  RDD domain-containing protein  24.82 
 
 		 293 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0371  RDD domain containing protein  26.74 
 
 		 135 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3913  RDD domain-containing protein  23.21 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0538103  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  27.46 
 
 		 187 aa  42.7  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1247  RDD domain containing protein  26.97 
 
 		 137 aa  42.4  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3069  RDD domain containing protein  27.41 
 
 		 150 aa  42  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>