48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4825 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4825  RDD domain containing protein  100 
 
 		 285 aa  551  1e-156  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3913  RDD domain-containing protein  52.56 
 
 		 269 aa  195  6e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0538103  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20730  predicted membrane protein/domain  43.88 
 
 		 286 aa  186  3e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00769566  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2522  RDD domain containing protein  45.1 
 
 		 272 aa  181  9.000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11329  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3834  RDD domain containing protein  42.06 
 
 		 272 aa  177  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1836  RDD domain containing protein  42.58 
 
 		 268 aa  169  4e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5849  RDD domain-containing protein  41.7 
 
 		 316 aa  159  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.273522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1397  membrane protein/domain-like protein  40.98 
 
 		 343 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.309206 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0755  RDD  41.7 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.581888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1201  RDD domain-containing protein  40.24 
 
 		 269 aa  154  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1271  RDD domain containing protein  40.73 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000317829 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5459  RDD domain-containing protein  41.22 
 
 		 293 aa  147  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09260  predicted membrane protein/domain protein  44.81 
 
 		 272 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.144214 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4952  RDD domain-containing protein  40.24 
 
 		 262 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5231  RDD domain-containing protein  40.24 
 
 		 262 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435963  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4863  RDD domain-containing protein  40.24 
 
 		 262 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.964955  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2339  RDD domain containing protein  42.53 
 
 		 282 aa  141  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0325969  hitchhiker  0.0000235215 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1614  RDD domain-containing protein  43.41 
 
 		 323 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0215766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7601  RDD domain containing protein  40.65 
 
 		 327 aa  138  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.202371  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4051  RDD domain containing protein  40.67 
 
 		 288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13726  hypothetical protein  40.09 
 
 		 310 aa  132  5e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0402342  normal  0.595615 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1333  RDD domain-containing protein  41.34 
 
 		 280 aa  130  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.391018 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2503  hypothetical protein  36.36 
 
 		 264 aa  124  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3753  RDD domain containing protein  36.55 
 
 		 285 aa  122  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4266  RDD domain-containing protein  25.22 
 
 		 274 aa  72  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000560964  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0824  RDD domain containing protein  32.57 
 
 		 590 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0333571  normal  0.0552944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4809  RDD  30.22 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000284972  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3316  RDD domain-containing protein  31.54 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56100  hypothetical protein  30.5 
 
 		 265 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4317  hypothetical protein  32 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3447  RDD domain-containing protein  26.83 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1596  RDD domain-containing protein  25.47 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38330  hypothetical protein  31.55 
 
 		 242 aa  54.7  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2233  RDD domain-containing protein  29.86 
 
 		 247 aa  54.7  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00562558  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4887  hypothetical protein  34.07 
 
 		 223 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.437888  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4439  RDD  36.67 
 
 		 241 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2132  hypothetical protein  28.48 
 
 		 238 aa  52  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4021  RDD  32.69 
 
 		 241 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897049  normal  0.0584976 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4958  RDD domain containing protein  29.05 
 
 		 231 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000303152 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3843  RDD domain containing protein  29.14 
 
 		 229 aa  49.7  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1157  RDD domain-containing protein  41.43 
 
 		 175 aa  45.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0409  RDD  28.66 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3744  RDD domain containing protein  27.33 
 
 		 279 aa  45.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0232  RDD domain containing protein  26.8 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3069  RDD domain containing protein  31.94 
 
 		 150 aa  44.3  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0015  RDD domain-containing protein  37.5 
 
 		 80 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1745  RDD domain containing protein  31.82 
 
 		 151 aa  44.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3574  RDD domain containing protein  30.65 
 
 		 255 aa  42.7  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.737424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>