53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_5231 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4863  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 262 aa  512  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.964955  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5231  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 262 aa  512  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435963  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4952  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 262 aa  512  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5459  RDD domain-containing protein  78.17 
 
 		 293 aa  352  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1333  RDD domain-containing protein  75.81 
 
 		 280 aa  333  1e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.391018 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13726  hypothetical protein  74.19 
 
 		 310 aa  330  2e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0402342  normal  0.595615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1397  membrane protein/domain-like protein  58.85 
 
 		 343 aa  223  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.309206 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3753  RDD domain containing protein  51.59 
 
 		 285 aa  201  7e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3834  RDD domain containing protein  45.9 
 
 		 272 aa  195  7e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4051  RDD domain containing protein  50.43 
 
 		 288 aa  191  7e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5849  RDD domain-containing protein  44.31 
 
 		 316 aa  185  8e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.273522 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0755  RDD  45.63 
 
 		 340 aa  178  9e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.581888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2522  RDD domain containing protein  45.68 
 
 		 272 aa  170  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11329  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20730  predicted membrane protein/domain  38.06 
 
 		 286 aa  169  5e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00769566  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7601  RDD domain containing protein  44.98 
 
 		 327 aa  168  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.202371  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2503  hypothetical protein  47.41 
 
 		 264 aa  165  8e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1614  RDD domain-containing protein  43.13 
 
 		 323 aa  158  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0215766 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1836  RDD domain containing protein  40.56 
 
 		 268 aa  158  1e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1201  RDD domain-containing protein  40.57 
 
 		 269 aa  152  5e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3913  RDD domain-containing protein  40.28 
 
 		 269 aa  145  5e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0538103  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2339  RDD domain containing protein  43.1 
 
 		 282 aa  144  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0325969  hitchhiker  0.0000235215 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1271  RDD domain containing protein  41.56 
 
 		 266 aa  140  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000317829 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09260  predicted membrane protein/domain protein  42.15 
 
 		 272 aa  123  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.144214 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4825  RDD domain containing protein  40.41 
 
 		 285 aa  109  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4809  RDD  26.21 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000284972  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4317  hypothetical protein  37.16 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09288  putative transmembrane protein  34.44 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.875246  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4021  RDD  39.83 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897049  normal  0.0584976 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3843  RDD domain containing protein  33.54 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0824  RDD domain containing protein  31.18 
 
 		 590 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0333571  normal  0.0552944 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56100  hypothetical protein  32.93 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3316  RDD domain-containing protein  34.16 
 
 		 241 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4439  RDD  42.57 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0232  RDD domain containing protein  24.29 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3579  RDD domain containing protein  26.64 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000310569 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1596  RDD domain-containing protein  27.31 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2132  hypothetical protein  29.05 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4887  hypothetical protein  38.38 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.437888  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0409  RDD  31.91 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3574  RDD domain containing protein  33.33 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.737424  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4266  RDD domain-containing protein  26.52 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000560964  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3447  RDD domain-containing protein  25.1 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38330  hypothetical protein  33.75 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4958  RDD domain containing protein  32 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000303152 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1682  RDD domain containing protein  29.14 
 
 		 241 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1701  RDD domain containing protein  33.8 
 
 		 162 aa  49.7  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000482282  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3069  RDD domain containing protein  36.46 
 
 		 150 aa  49.7  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2713  RDD domain containing protein  39.77 
 
 		 159 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0015  RDD domain-containing protein  39.47 
 
 		 80 aa  46.6  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1681  RDD domain containing protein  36.27 
 
 		 156 aa  45.4  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3744  RDD domain containing protein  24.89 
 
 		 279 aa  45.4  0.0009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0726  RDD domain containing protein  41.33 
 
 		 156 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2233  RDD domain-containing protein  31.82 
 
 		 247 aa  43.9  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00562558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>