51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1271 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1271  RDD domain containing protein  100 
 
 
266 aa  515  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000317829 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1201  RDD domain-containing protein  72.45 
 
 
269 aa  349  2e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2522  RDD domain containing protein  48.66 
 
 
272 aa  221  9.999999999999999e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11329  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3834  RDD domain containing protein  44.66 
 
 
272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1836  RDD domain containing protein  38.17 
 
 
268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20730  predicted membrane protein/domain  38.26 
 
 
286 aa  178  9e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00769566  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3753  RDD domain containing protein  45.38 
 
 
285 aa  168  8e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09260  predicted membrane protein/domain protein  45.49 
 
 
272 aa  162  8.000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.144214 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2339  RDD domain containing protein  42.97 
 
 
282 aa  161  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0325969  hitchhiker  0.0000235215 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4051  RDD domain containing protein  43.64 
 
 
288 aa  155  8e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1397  membrane protein/domain-like protein  44.09 
 
 
343 aa  152  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.309206 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4863  RDD domain-containing protein  41.74 
 
 
262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.964955  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2503  hypothetical protein  41.63 
 
 
264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4952  RDD domain-containing protein  41.74 
 
 
262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5334  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5231  RDD domain-containing protein  41.74 
 
 
262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435963  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3913  RDD domain-containing protein  42.06 
 
 
269 aa  146  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0538103  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1614  RDD domain-containing protein  39.27 
 
 
323 aa  144  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0215766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7601  RDD domain containing protein  40.08 
 
 
327 aa  143  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.202371  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5459  RDD domain-containing protein  40.82 
 
 
293 aa  140  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13726  hypothetical protein  36.41 
 
 
310 aa  130  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0402342  normal  0.595615 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5849  RDD domain-containing protein  35.71 
 
 
316 aa  129  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.273522 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0755  RDD  38.1 
 
 
340 aa  129  7.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.581888  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1333  RDD domain-containing protein  38.02 
 
 
280 aa  125  6e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.391018 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4825  RDD domain containing protein  42.39 
 
 
285 aa  112  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09288  putative transmembrane protein  27.4 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.875246  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3316  RDD domain-containing protein  36.13 
 
 
241 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56100  hypothetical protein  31.07 
 
 
265 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4809  RDD  26.88 
 
 
261 aa  65.1  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000284972  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2132  hypothetical protein  29.22 
 
 
238 aa  63.2  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4317  hypothetical protein  34.59 
 
 
235 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4021  RDD  34.1 
 
 
241 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897049  normal  0.0584976 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4887  hypothetical protein  32.92 
 
 
223 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.437888  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0409  RDD  33.54 
 
 
231 aa  58.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4266  RDD domain-containing protein  24.45 
 
 
274 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000560964  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0824  RDD domain containing protein  29.94 
 
 
590 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0333571  normal  0.0552944 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3843  RDD domain containing protein  35.14 
 
 
229 aa  56.6  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38330  hypothetical protein  30.05 
 
 
242 aa  55.8  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4439  RDD  30.67 
 
 
241 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296549  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0704  RDD domain-containing protein  32.14 
 
 
327 aa  52  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4958  RDD domain containing protein  33.55 
 
 
231 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000303152 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1682  RDD domain containing protein  29.87 
 
 
241 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3579  RDD domain containing protein  30.34 
 
 
265 aa  50.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000310569 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1596  RDD domain-containing protein  27.67 
 
 
258 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3744  RDD domain containing protein  29.45 
 
 
279 aa  47.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1247  RDD domain containing protein  31.29 
 
 
137 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2233  RDD domain-containing protein  27.7 
 
 
247 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00562558  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3574  RDD domain containing protein  36.59 
 
 
255 aa  44.3  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.737424  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0015  RDD domain-containing protein  38.16 
 
 
80 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3447  RDD domain-containing protein  35.44 
 
 
254 aa  43.5  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2675  RDD domain-containing protein  31.2 
 
 
306 aa  42.7  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3069  RDD domain containing protein  29.71 
 
 
150 aa  42.7  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>