58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3913 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3913  RDD domain-containing protein  100 
 
 		 269 aa  503  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0538103  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3834  RDD domain containing protein  46.09 
 
 		 272 aa  213  2.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2522  RDD domain containing protein  48.19 
 
 		 272 aa  206  4e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11329  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1397  membrane protein/domain-like protein  47.43 
 
 		 343 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.309206 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2339  RDD domain containing protein  50.61 
 
 		 282 aa  177  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0325969  hitchhiker  0.0000235215 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4051  RDD domain containing protein  48.94 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1836  RDD domain containing protein  42.29 
 
 		 268 aa  176  3e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20730  predicted membrane protein/domain  37.74 
 
 		 286 aa  174  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00769566  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4825  RDD domain containing protein  52.28 
 
 		 285 aa  170  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7601  RDD domain containing protein  44.79 
 
 		 327 aa  167  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.202371  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1201  RDD domain-containing protein  44.72 
 
 		 269 aa  168  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1271  RDD domain containing protein  44.02 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000317829 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4863  RDD domain-containing protein  44.13 
 
 		 262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.964955  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13726  hypothetical protein  44.3 
 
 		 310 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0402342  normal  0.595615 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5231  RDD domain-containing protein  44.13 
 
 		 262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435963  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4952  RDD domain-containing protein  44.13 
 
 		 262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5459  RDD domain-containing protein  44.49 
 
 		 293 aa  161  8.000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1614  RDD domain-containing protein  45.7 
 
 		 323 aa  159  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0215766 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09260  predicted membrane protein/domain protein  48.18 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.144214 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0755  RDD  43.37 
 
 		 340 aa  155  6e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.581888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5849  RDD domain-containing protein  40.24 
 
 		 316 aa  154  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.273522 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2503  hypothetical protein  42.98 
 
 		 264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3753  RDD domain containing protein  43.33 
 
 		 285 aa  149  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1333  RDD domain-containing protein  44.72 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.391018 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0824  RDD domain containing protein  31.18 
 
 		 590 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0333571  normal  0.0552944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4809  RDD  28.57 
 
 		 261 aa  75.1  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000284972  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1596  RDD domain-containing protein  27.84 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3843  RDD domain containing protein  35.33 
 
 		 229 aa  67  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3447  RDD domain-containing protein  33.77 
 
 		 254 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3579  RDD domain containing protein  25.1 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000310569 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09288  putative transmembrane protein  28.57 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.875246  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4266  RDD domain-containing protein  24.89 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000560964  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56100  hypothetical protein  30.13 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3316  RDD domain-containing protein  35.62 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3574  RDD domain containing protein  29.64 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.737424  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4317  hypothetical protein  32.45 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4887  hypothetical protein  31.33 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.437888  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4021  RDD  32 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897049  normal  0.0584976 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4958  RDD domain containing protein  31.72 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000303152 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0409  RDD  30.07 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38330  hypothetical protein  34.19 
 
 		 242 aa  55.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0232  RDD domain containing protein  27.27 
 
 		 247 aa  52.8  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2132  hypothetical protein  27.27 
 
 		 238 aa  52  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4439  RDD  38.27 
 
 		 241 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296549  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3744  RDD domain containing protein  25.75 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1682  RDD domain containing protein  28.57 
 
 		 241 aa  50.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4234  RDD domain-containing protein  29.22 
 
 		 162 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1157  RDD domain-containing protein  38.46 
 
 		 175 aa  48.1  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0015  RDD domain-containing protein  38.89 
 
 		 80 aa  48.5  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4626  RDD domain containing protein  30.26 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.624916  normal  0.497258 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1681  RDD domain containing protein  32.29 
 
 		 156 aa  47  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0984  RDD domain containing protein  28.57 
 
 		 162 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0989  RDD domain-containing protein  28.57 
 
 		 162 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00320129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1021  RDD domain-containing protein  28.57 
 
 		 162 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2675  RDD domain-containing protein  28.21 
 
 		 306 aa  45.4  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1247  RDD domain containing protein  26.62 
 
 		 137 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  27.46 
 
 		 310 aa  43.9  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3069  RDD domain containing protein  32.19 
 
 		 150 aa  43.5  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>