59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_56100 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_56100  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  524  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4887  hypothetical protein  96.41 
 
 		 223 aa  394  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.437888  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3316  RDD domain-containing protein  68.72 
 
 		 241 aa  309  4e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38330  hypothetical protein  62.61 
 
 		 242 aa  284  9e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4021  RDD  59.18 
 
 		 241 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897049  normal  0.0584976 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4317  hypothetical protein  59.18 
 
 		 235 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4439  RDD  65.52 
 
 		 241 aa  257  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0409  RDD  44.3 
 
 		 231 aa  169  6e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3843  RDD domain containing protein  48.79 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3579  RDD domain containing protein  39.77 
 
 		 265 aa  106  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000310569 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3447  RDD domain-containing protein  37.43 
 
 		 254 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1596  RDD domain-containing protein  38.6 
 
 		 258 aa  105  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3744  RDD domain containing protein  32.48 
 
 		 279 aa  98.2  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4809  RDD  37.11 
 
 		 261 aa  87.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000284972  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4266  RDD domain-containing protein  33.56 
 
 		 274 aa  84  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000560964  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3574  RDD domain containing protein  33.66 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.737424  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3069  RDD domain containing protein  37.14 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2503  hypothetical protein  34.68 
 
 		 264 aa  82.4  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0824  RDD domain containing protein  33.15 
 
 		 590 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0333571  normal  0.0552944 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3753  RDD domain containing protein  29.65 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09288  putative transmembrane protein  30 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.875246  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5231  RDD domain-containing protein  32.93 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435963  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4863  RDD domain-containing protein  32.93 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.964955  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4952  RDD domain-containing protein  32.93 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1201  RDD domain-containing protein  33.54 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4051  RDD domain containing protein  33.92 
 
 		 288 aa  69.7  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1614  RDD domain-containing protein  32.56 
 
 		 323 aa  69.3  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0215766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1397  membrane protein/domain-like protein  34.78 
 
 		 343 aa  69.3  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.309206 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5849  RDD domain-containing protein  33.33 
 
 		 316 aa  68.9  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.273522 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13726  hypothetical protein  31.37 
 
 		 310 aa  68.9  0.00000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0402342  normal  0.595615 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20730  predicted membrane protein/domain  32.35 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00769566  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1333  RDD domain-containing protein  31.03 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.391018 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3834  RDD domain containing protein  28.57 
 
 		 272 aa  62  0.000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3129  RDD domain containing protein  35.92 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.403499 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1836  RDD domain containing protein  30.99 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0755  RDD  33.33 
 
 		 340 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.581888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2522  RDD domain containing protein  38.2 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11329  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5459  RDD domain-containing protein  36.45 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564644 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4825  RDD domain containing protein  30.36 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1157  RDD domain-containing protein  41.84 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1271  RDD domain containing protein  33.53 
 
 		 266 aa  57  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000317829 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4958  RDD domain containing protein  34.67 
 
 		 231 aa  57  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000303152 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7601  RDD domain containing protein  35.35 
 
 		 327 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.202371  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1682  RDD domain containing protein  29.3 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0232  RDD domain containing protein  26.9 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1745  RDD domain containing protein  39.13 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2339  RDD domain containing protein  37.14 
 
 		 282 aa  53.9  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0325969  hitchhiker  0.0000235215 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3913  RDD domain-containing protein  38.75 
 
 		 269 aa  51.6  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0538103  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2233  RDD domain-containing protein  26.67 
 
 		 247 aa  50.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00562558  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2132  hypothetical protein  30 
 
 		 238 aa  50.1  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2334  RDD domain containing protein  41.86 
 
 		 207 aa  50.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09260  predicted membrane protein/domain protein  33.8 
 
 		 272 aa  49.3  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.144214 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2968  RDD domain-containing protein  32.41 
 
 		 288 aa  48.5  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1078  RDD domain-containing protein  29.61 
 
 		 191 aa  43.9  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.30777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5191  RDD domain containing protein  31.29 
 
 		 157 aa  43.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2675  RDD domain-containing protein  28.22 
 
 		 306 aa  43.1  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0015  RDD domain-containing protein  36.84 
 
 		 80 aa  42.7  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1405  RDD domain-containing protein  31.87 
 
 		 200 aa  42.4  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000118543  hitchhiker  0.000767347 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3993  RDD domain containing protein  34.83 
 
 		 177 aa  42  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>